ترجمه فارسی مقاله رمزگشایی تاثیر عملکردی انواع مرتبط با بیماری آلزایمر در سلول های ایمنی در حال استراحت و پیش التهابی

چکیده

Genome-wide association studies have identified loci associated with Alzheimer’s Disease (AD), but identifying the exact causal variants and genes at each locus is challenging due to linkage disequilibrium and their largely non-coding nature. To address this, we performed a massively parallel reporter assay of 3,576 AD-associated variants in THP-1 macrophages in both resting and proinflammatory states and identified 47 expression-modulating variants (emVars). To understand the endogenous chromatin context of emVars, we built an activity-by-contact model using epigenomic maps of macrophage inflammation and inferred condition-specific enhancer-promoter pairs. Intersection of emVars with enhancer-promoter pairs and microglia expression quantitative trait loci allowed us to connect 39 emVars to 76 putative AD risk genes enriched for AD-associated molecular signatures. Overall, systematic characterization of AD-associated variants enhances our understanding of the regulatory mechanisms underlying AD pathogenesis.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

مطالعات انجمن گسترده ژنوم ، مکان های مرتبط با بیماری آلزایمر (AD) را شناسایی کرده است ، اما شناسایی انواع و ژن های علی دقیق در هر مکان به دلیل عدم تعادل پیوند و ماهیت عمدتاً غیر رمزگذاری آنها چالش برانگیز است.برای پرداختن به این موضوع ، ما یک روش گزارشگر موازی به طور موازی از 3576 نوع مرتبط با AD در ماکروفاژهای THP-1 در هر دو حالت استراحت و التهابی انجام دادیم و 47 نوع تعریف کننده بیان (EMVARS) را شناسایی کردیم.برای درک زمینه کروماتین درون زا از EMVARS ، ما یک مدل فعالیت به صورت تماس با استفاده از نقشه های اپی ژنتیکی التهاب ماکروفاژ و جفت های تقویت کننده تقویت کننده خاص از وضعیت استنباط شده ایجاد کردیم.تقاطع EMVARS با جفت های تقویت کننده-پروموتر و بیان میکروگلیا ، جایگاه کمی صفت به ما امکان اتصال 39 EMVARS را به 76 ژن خطر AD قلمداد شده برای امضاهای مولکولی مرتبط با AD می دهد.به طور کلی ، خصوصیات سیستماتیک انواع مرتبط با AD ، درک ما از مکانیسم های نظارتی اساسی پاتوژنز AD را تقویت می کند.