ترجمه فارسی مقاله سهم انواع کدگذاری در وراثت پذیری انواع سرطان با استفاده از داده های توالی یابی کل اگزوم بیوبانک انگلستان

چکیده

Genome-wide association studies have been highly successful at identifying common variants associated with cancer, however, they do not explain all the inherited risk of cancer. Family-based studies, targeted sequencing and, more recently, exome-wide association studies have identified rare coding variants in some genes associated with cancer risk, but the overall contribution of these variants to the heritability of cancer is less clear. Here we describe a method to estimate the genome-wide contribution of rare coding variants to heritability that fits models to the burden effect sizes using an empirical Bayesian approach. We apply this method to the burden of protein-truncating variants in over 15,000 genes for 11 cancers in UK Biobank, using whole-exome sequencing data on over 400,000 individuals. We extend the method to consider the overlap of genes contributing to pairs of cancers. We found ovarian cancer to have the greatest proportion of heritability attributable to protein-truncating variants in genes (46%). The joint cancer models highlight significant clustering of cancer types, including a near complete overlap in susceptibility genes for breast, ovarian, prostate and pancreatic cancer. Our results provide insights into the contribution of rare coding variants to the heritability of cancer and identify additional genes with strong evidence of susceptibility to multiple cancer types.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

مطالعات انجمن گسترده ژنوم در شناسایی انواع متداول مرتبط با سرطان بسیار موفق بوده است ، با این حال ، آنها تمام خطر ارثی سرطان را توضیح نمی دهند.مطالعات مبتنی بر خانواده ، توالی هدفمند و اخیراً ، مطالعات ارتباط گسترده ای در برخی از ژنهای مرتبط با خطر سرطان ، انواع کد نویسی نادر را شناسایی کرده اند ، اما سهم کلی این انواع در وراثت پذیری سرطان کمتر مشخص است.در اینجا ما روشی را برای برآورد سهم ژنوم در انواع کدگذاری نادر در وراثت پذیری که مدل ها را با استفاده از یک رویکرد تجربی بیزی متناسب می کند ، توصیف می کنیم.ما این روش را برای بار انواع پروتئین در بیش از 15،000 ژن برای 11 سرطان در Biobank انگلستان ، با استفاده از داده های توالی کامل در بیش از 400000 نفر اعمال می کنیم.ما این روش را برای در نظر گرفتن همپوشانی ژن های کمک به جفت سرطان گسترش می دهیم.ما متوجه شدیم که سرطان تخمدان بیشترین میزان وراثت پذیری را به انواع پروتئین در ژن (46 ٪) نسبت داده است.مدلهای سرطان مفصل ، خوشه بندی قابل توجهی از انواع سرطان را نشان می دهد ، از جمله همپوشانی کامل در ژنهای حساسیت برای سرطان پستان ، تخمدان ، پروستات و لوزالمعده.نتایج ما بینشی در مورد سهم انواع کد نویسی نادر در وراثت پذیری سرطان و شناسایی ژن های اضافی با شواهد قوی از حساسیت به انواع سرطان چندین ارائه می دهد.