ترجمه فارسی مقاله مکان‌های ژنومی با نقشه‌برداری دقیق، ژن‌های خطر اختلال دوقطبی را اصلاح می‌کنند

چکیده

Bipolar disorder (BD) is a heritable mental illness with complex etiology. While the largest published genome-wide association study identified 64 BD risk loci, the causal SNPs and genes within these loci remain unknown. We applied a suite of statistical and functional fine-mapping methods to these loci, and prioritized 17 likely causal SNPs for BD. We mapped these SNPs to genes, and investigated their likely functional consequences by integrating variant annotations, brain cell-type epigenomic annotations, brain quantitative trait loci, and results from rare variant exome sequencing in BD. Convergent lines of evidence supported the roles of genes involved in neurotransmission and neurodevelopment including SCN2A, TRANK1, DCLK3, INSYN2B, SYNE1, THSD7A, CACNA1B, TUBBP5, PLCB3, PRDX5, KCNK4, CRTC3, AP001453.3, TRPT1, FKBP2, DNAJC4, RASGRP1, FURIN, FES, DPH1, GSDMB, MED24 and THRA in BD. These represent promising candidates for functional experiments to understand biological mechanisms and therapeutic potential. Additionally, we demonstrated that fine-mapping effect sizes can improve performance of BD polygenic risk scores across diverse populations, and present a high-throughput fine-mapping pipeline (https://github.com/mkoromina/SAFFARI).

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

اختلال دو قطبی (BD) یک بیماری روانی ارثی با علت پیچیده است.در حالی که بزرگترین مطالعه انجمن ژنوم منتشر شده 64 محل خطر BD را مشخص کرد ، SNP های علی و ژن های موجود در این مکان ها ناشناخته هستند.ما مجموعه ای از روش های آماری و کاربردی نقشه برداری ریز را برای این مکان ها اعمال کردیم و 17 SNP های علّی احتمالی برای BD را در اولویت قرار دادیم.ما این SNP ها را به ژن ها نقشه برداری کردیم و با ادغام حاشیه نویسی های مختلف ، حاشیه نویسی از نوع اپی ژنومیک سلول ، محلول صفت کمی مغز و نتایج حاصل از توالی اگزوم نوع نادر در BD ، پیامدهای عملکردی آنها را بررسی کردیم.خطوط همگرا شواهد از نقش ژنهای درگیر در انتقال عصبی و توسعه عصبی از جمله SCN2A ، TRANK1 ، DCLK3 ، Insyn2b ، Syne1 ، Thsd7a ، Cacna1b ، tubbp5 ، plcb3 ، prdx5 ، kcnk4 ، crtc3 ، ap001453.3 ، trpt1 پشتیبانی می کند.، فورین ، FES ، DPH1 ، GSDMB ، MED24 و THRA در Bd.اینها کاندیداهای امیدوار کننده ای را برای آزمایش های عملکردی برای درک مکانیسم های بیولوژیکی و پتانسیل درمانی نشان می دهند.علاوه بر این ، ما نشان دادیم که اندازه اثر نقشه برداری ریز می تواند عملکرد نمرات ریسک پلی ژنیک BD را در جمعیت های متنوع بهبود بخشد ، و یک خط لوله با سرعت بالا (https://github.com/mkoromina/saffari) ارائه دهد.