ترجمه فارسی مقاله شناسایی افراد در معرض خطر تنگی آئورت فوق دریچه جراحی از طریق امتیاز خطر چند ژنی با فنوتیپ درجه بندی شده

چکیده

In a previous pathway-based, extreme phenotype study, we identified 1064 variants associated with supravalvar aortic stenosis (SVAS) severity in people with Williams syndrome (WS) and either no SVAS or surgical SVAS. Here, we use those variants to develop and test polygenic risk scores (PRS). We used the clumping and thresholding (CT) approach on the full 1064 variants and a 427-variant subset that was part of 13 biologically relevant pathways identified in the previous study. We also used a lasso approach on the full set. We were able to achieve an area under the curve (AUC) of >0.99 for the two CT PRS methods, using only 622 and 320 variants respectively when 2/3 of the initial 217 participants data were used for training and 1/3 for testing. The lasso performed less well. We then evaluated the performance of those PRS variant sets on an additional group of 138 patients with WS with intermediate severity SVAS and found a misclassification rate of <10% between the surgical and intermediate groups, suggesting potential for clinical utility of the score.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

در یک مطالعه فنوتیپ شدید مبتنی بر مسیر ، ما 1064 نوع مرتبط با تنگی آئورت Supravalvar (SVA) در افراد مبتلا به سندرم ویلیامز (WS) و یا SVA یا SVA های جراحی را شناسایی کردیم.در اینجا ، ما از این انواع برای توسعه و آزمایش نمرات خطر پلی ژنیک (PRS) استفاده می کنیم.ما از روش جمع آوری و آستانه (CT) در انواع 1064 نوع و یک زیر مجموعه 427 متمایز استفاده کردیم که بخشی از 13 مسیر بیولوژیکی مرتبط با مطالعه قبلی بود.ما همچنین از یک رویکرد لاسو در مجموعه کامل استفاده کردیم.ما توانستیم برای دو روش CT PRS به یک منطقه تحت منحنی (AUC)> 0.99 دست یابیم ، به ترتیب تنها با استفاده از 622 و 320 نوع به ترتیب وقتی 2/3 از داده های اولیه 217 شرکت کننده برای آموزش و 1/3 برای آزمایش استفاده شدبشرلاسو عملکرد کمتری داشت.ما سپس عملکرد آن مجموعه های مختلف PRS را در یک گروه اضافی از 138 بیمار مبتلا به WS با شدت متوسط ​​SVA ارزیابی کردیم و میزان طبقه بندی نادرست <10 ٪ بین گروه های جراحی و متوسط ​​را پیدا کردیم ، که نشان دهنده پتانسیل کاربرد بالینی نمره است. [sc name="papertranslation"][/sc]