ترجمه فارسی مقاله نقشه برداری اپی ترانسکریپتوم تغییرات m6A RNA در بافت تومور گلیوما

چکیده

Glioma represents the most common primary central nervous system (CNS) neoplasm in adults. IDH1 mutation is recognized as a hallmark alteration with important diagnostic and prognostic implications. There is considerable evidence for global DNA hypermethylation induced secondary to IDH mutation. However, there is limited understanding of the RNA methylation patterns and its role in glioma biology. In this study, we performed transcriptome wide profiling of N6-methyladenosine (m6A) modifications across IDH mutant (n = 8) and wild-type (n = 7) gliomas using Oxford Nanopore Technologies’ direct RNA sequencing platform. Our approach enabled high-depth coverage of native transcripts, revealing nearly twice as many full-length transcripts in IDH mutant gliomas compared to wild-type. Notable differences in alternative splicing were observed across glioma subtypes, with truncated and non-coding isoforms more prevalent in glioblastoma (GBM). We further identified significant changes in isoform usage within key metabolic (NAMPT, PKM) and immune (CD63, CD151, CD81) pathways. Chromosomal distribution of m6A sites showed a higher prevalence of m6A modifications in IDH mutant gliomas, with the most pronounced differences on chromosomes 19 and 16. Further stratification by TERT, MGMT, and TP53 mutations revealed similar patterns of increased m6A site numbers in mutant groups, highlighting the importance of integrating epigenomic and epitranscriptomic data in glioma research. These findings highlight the role of m6A modifications in the metabolic reprogramming unique to IDH mutant gliomas, providing insights into potential mechanisms of tumorigenesis and therapeutic resistance.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

گلیوما نمایانگر رایج ترین سیستم عصبی مرکزی اصلی (CNS) نئوپلاسم در بزرگسالان است.جهش IDH1 به عنوان یک تغییر مشخصه با پیامدهای مهم تشخیصی و پیش آگهی شناخته می شود.شواهد قابل توجهی برای هیپرمتیلاسیون جهانی DNA ناشی از جهش IDH وجود دارد.با این حال ، درک محدودی از الگوهای متیلاسیون RNA و نقش آن در زیست شناسی گلیوما وجود دارد.در این مطالعه ، ما پروفایل گسترده رونویسی از اصلاحات N6-Methyladenosine (M6A) را در سراسر جهش IDH (8 نفر) و از نوع وحشی (7 نفر) گلیوما با استفاده از بستر توالی مستقیم RNA Technologies Nanopore Technologies انجام دادیم.رویکرد ما پوشش عمق بالایی از رونوشت های بومی را فعال می کند ، و تقریباً دو برابر تعداد رونوشت تمام طول در گلیوما جهش یافته IDH را در مقایسه با نوع وحشی نشان می دهد.تفاوتهای قابل توجه در ترکیب جایگزین در زیرگروه های گلیوما مشاهده شد ، با ایزوفرمهای کوتاه و غیر کد کننده در گلیوبلاستوما (GBM) شیوع بیشتری پیدا کرد.ما بیشتر تغییرات قابل توجهی در استفاده از ایزوفرم در مسیرهای کلیدی متابولیک (NAMPT ، PKM) و ایمنی (CD63 ، CD151 ، CD81) شناسایی کردیم.توزیع کروموزومی سایتهای M6A شیوع بالاتری از اصلاحات M6A در گلیوما جهش یافته IDH را نشان داد ، با بیشترین تفاوت در کروموزوم های 19 و 16.برجسته کردن اهمیت ادغام داده های اپی ژنتیکی و epitranscriptomic در تحقیقات گلیوما.این یافته ها نقش اصلاحات M6A را در برنامه ریزی متابولیک منحصر به فرد برای گلیوما جهش یافته IDH برجسته می کند ، و بینش هایی در مورد مکانیسم های بالقوه توموری و مقاومت درمانی ارائه می دهد.