ترجمه فارسی مقاله NXPE1 سیالوگلیکوم را با استیل کردن اسیدهای سیالیک در روده بزرگ انسان تغییر می دهد

چکیده

Mild periodic acid Schiff staining (mPAS) of human colonic tissue has been used to answer a variety of fundamental questions in germline and somatic genetics. mPAS staining is known to reflect sialic acid O-acetylation, but a full accounting of the genes contributing to sialoglycome diversity is incomplete. Using haplotypes derived from whole genome sequencing, we identified a region on chromosome 11 that is associated with inherited differences in mPAS staining. Of the genes in this region, only NXPE1 haplotypes correlated perfectly with mPAS staining in the original cohort used for whole genome sequencing, as well as in a validation cohort. Transcriptomic analysis suggested that one common allele of NXPE1, with a single base pair substitution in its promoter region, greatly reduces expression of the gene. Genetic manipulation of NXPE1 expression confirmed this conclusion and caused changes to modified sialic acid levels. Finally, high-performance liquid chromatography (HPLC) confirms that enzymatically active NXPE1 is capable of transferring an acetyl group from acetyl coenzyme A to sialic acid in vitro. These findings suggest that NXPE1 is the long-sought gene responsible for differences in colon mPAS staining and may be the prototype of a new family of sialic acid O-acetylation-modifying genes.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

رنگ آمیزی خفیف اسید شیف (MPA) از بافت کولون انسانی برای پاسخ به انواع سؤالات اساسی در ژنتیک ژرمین و جسمی استفاده شده است.رنگ آمیزی MPA به منعکس کننده اسید اگزالاسیون اسید سیالیک شناخته شده است ، اما یک حسابداری کامل از ژن های کمک به تنوع سیالگلیوم ناقص است.با استفاده از هاپلوتیپ های به دست آمده از توالی ژنوم کل ، ما منطقه ای را در کروموزوم 11 شناسایی کردیم که با تفاوت های ارثی در رنگ آمیزی MPA همراه است.از ژنهای موجود در این منطقه ، فقط هاپلوتیپ NXPE1 کاملاً با رنگ آمیزی MPA در گروه اصلی مورد استفاده برای توالی ژنوم کامل و همچنین در یک گروه اعتبار سنجی ارتباط دارد.تجزیه و تحلیل transcriptomic نشان می دهد که یک آلل مشترک NXPE1 ، با یک تعویض جفت پایه در منطقه پروموتور آن ، بیان ژن را تا حد زیادی کاهش می دهد.دستکاری ژنتیکی بیان NXPE1 این نتیجه گیری را تأیید کرد و باعث تغییر در سطح اسید سیالیک اصلاح شده شد.سرانجام ، کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) تأیید می کند که NXPE1 آنزیمی فعال قادر به انتقال یک گروه استیل از استیل کوآنزیم A به اسید سیالیک در شرایط آزمایشگاهی است.این یافته ها نشان می دهد که NXPE1 ژن دیرینه ای است که مسئولیت تفاوت در رنگ آمیزی MPA های روده بزرگ را بر عهده دارد و ممکن است نمونه اولیه خانواده جدید ژنهای اصلاح کننده اسید سیالیک باشد.