ترجمه فارسی مقاله انتقال در چشم انداز میکروبیوتای ریه با الگوهای متمایز پیشرفت پنومونی مرتبط است

چکیده

The precise microbial determinants driving clinical outcomes in severe pneumonia are unknown. Competing ecological forces produce dynamic microbiota states in health; infection and treatment effects on microbiota state must be defined to improve pneumonia therapy. Here, we leverage our unique clinical setting, which includes systematic and serial bronchoscopic sampling in patients with suspected pneumonia, to determine lung microbial ecosystem dynamics throughout pneumonia therapy. We combine 16S rRNA gene amplicon, metagenomic, and transcriptomic sequencing with bacterial load quantification to reveal clinically-relevant pneumonia progression drivers. Microbiota states are predictive of pneumonia category and exhibit differential stability and pneumonia therapy response. Disruptive forces, like aspiration, associate with cohesive changes in gene expression and microbial community structure. In summary, we show that host and microbiota landscapes change in unison with clinical phenotypes and that microbiota state dynamics reflect pneumonia progression. We suggest that distinct pathways of lung microbial community succession mediate pneumonia progression.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

تعیین کننده های دقیق میکروبی که نتایج بالینی را در ذات الریه شدید هدایت می کنند ناشناخته هستند.نیروهای اکولوژیکی رقیب حالتهای میکروبیوتای پویا در سلامت تولید می کنند.برای بهبود درمان ذات الریه باید اثرات عفونت و درمانی بر وضعیت میکروبیوتا تعریف شود.در اینجا ، ما از تنظیمات بالینی منحصر به فرد خود استفاده می کنیم ، که شامل نمونه گیری برونکوسکوپی سیستماتیک و سریال در بیماران مبتلا به پنومونی مشکوک ، برای تعیین دینامیک اکوسیستم میکروبی ریه در طول درمان پنومونی است.ما توالی ژن RRNA 16S RRNA را با اندازه گیری بار باکتریایی ترکیب می کنیم تا درایورهای پیشرفت پنومونی مرتبط با بالینی را نشان دهیم.حالت های میکروبی پیش بینی کننده طبقه پنومونی هستند و پایداری دیفرانسیل و پاسخ درمانی پنومونی را نشان می دهند.نیروهای مختل کننده ، مانند آسپیراسیون ، با تغییرات منسجم در بیان ژن و ساختار جامعه میکروبی ارتباط دارند.به طور خلاصه ، ما نشان می دهیم که مناظر میزبان و میکروبی در یونیسون با فنوتیپ های بالینی تغییر می کنند و پویایی حالت میکروبیوتا نشان دهنده پیشرفت ذات الریه است.ما پیشنهاد می کنیم که مسیرهای متمایز جانشینی جامعه میکروبی ریه ، پیشرفت پنومونی را واسطه می کند.