کتاب آموزش نرم‌افزار DAPC برای خوشه‌بندی دادگان بزرگ ژنومیکس جمعیت

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره آموزش نرم‌افزار DAPC برای خوشه‌بندی دادگان بزرگ ژنومیکس جمعیت

موضوع کلی: ژنتیک تکاملی و جمعیت

موضوع میانی: نرم‌افزارهای تخصصی ژنتیک جمعیت

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. بررسی اجمالی DAPC در ژنتیک جمعیت
  • 2. مفاهیم اصلی: تحلیل تطبیقی و مؤلفه‌های اصلی
  • 3. نصب و پیکربندی R برای کاربردهای DAPC
  • 4. ایجاد پروژه RStudio برای مجموعه‌های دادهٔ ژنومیک بزرگ
  • 5. وارد کردن داده‌های SNP از VCF به داده‌های R
  • 6. پیش‌پردازش: حذف نمونه‌ها و متغیرهای با کیفیت پایین
  • 7. فیلتر کردن بر اساس فرکانس آلل کوچک (MAF)
  • 8. مدیریت داده‌های گمشده در ماتریس‌های ژنوتایپی
  • 9. تبدیل قالب‌های ژنوتایپ برای DAPC (مانند .gen, .csv)
  • 10. زیرمجموعه‌سازی داده‌های بزرگ برای مدیریت آسان‌تر
  • 11. استراتژی‌های مدیریت حافظه برای داده‌های ژنومیک بزرگ
  • 12. پردازش موازی با بسته‌های Bioconductor
  • 13. انجام PCA به عنوان مرحلهٔ مقدماتی
  • 14. انتخاب تعداد مؤلفه‌های اصلی برای DAPC
  • 15. تجسم نتایج PCA برای بازبینی اولیه
  • 16. اعمال تحلیل تطبیقی بر روی داده‌های کاهش‌یافتهٔ PCA
  • 17. تعیین تعداد بهینهٔ تابع‌های تطبیقی
  • 18. اعتبارسنجی متقاطع برای دقت خوشه‌بندی DAPC
  • 19. استفاده از تابع `dapc` از بسته `adegenet`
  • 20. آموزش مدل DAPC با برچسب‌های جمعیت شناخته‌شده
  • 21. پیش‌بینی عضویت خوشه‌ها برای نمونه‌های جدید
  • 22. ارزیابی نرخ موفقیت طبقه‌بندی
  • 23. ایجاد ماتریس‌های گیج برای نتایج DAPC
  • 24. پلوت پراکندگی DAPC با رنگ‌های گروهی
  • 25. ایجاد بی‌پلات برای نمایش مشارکت متغیرها
  • 26. ذخیره و بارگذاری مجدد مدل‌های DAPC برای بازتولید
  • 27. ادغام نتایج DAPC با خروجی STRUCTURE/ADMIXTURE
  • 28. مقایسه تحلیل: DAPC در مقابل خوشه‌بندی K‑means
  • 29. خوشه‌بندی سلسله‌مراتبی به عنوان روش جایگزین
  • 30. استفاده از بسته `poppr` برای تحلیل ساختار جمعیت
  • 31. ادغام نتایج DAPC با اطلاعات جغرافیایی
  • 32. نقشه‌برداری از خوشه‌های جمعیت بر روی نمودارهای مکانی
  • 33. صادرات نتایج DAPC به PDF و گرافیک‌های برداری
  • 34. صادرات اختصاص‌های خوشه‌ها به CSV برای استفادهٔ بعدی
  • 35. پایپ‌لاین‌های خودکار با `snakemake` برای داده‌های بزرگ
  • 36. استفاده از کانتینرهای Docker برای بازتولیدپذیری DAPC
  • 37. اجرای DAPC بر روی Cloud در AWS EC2
  • 38. استفاده از Google Cloud Platform برای پردازش داده‌های ژنومیک
  • 39. مانیتورینگ زندهٔ محاسبات DAPC با Jupyter Notebooks
  • 40. بنچمارکینگ عملکرد DAPC بر روی داده‌های شبیه‌سازی‌شده
  • 41. رفع اشکال رایج در `adegenet` DAPC
  • 42. مدیریت داده‌های پراکنده در تحلیل تطبیقی
  • 43. تنظیم اندازه‌های گروه قبلی در DAPC
  • 44. ادغام متغیرهای محیطی در DAPC
  • 45. استفاده از بسته `vegan` برای شبیه‌سازی‌های اکولوژیکی
  • 46. تفسیر بارهای DAPC برای شناسایی لوك‌های اطلاعاتی
  • 47. شناسایی نقاط خارجی با استفاده از باقیمانده‌های DAPC
  • 48. اعمال DAPC بر روی داده‌های DNA باستانی
  • 49. استفاده از DAPC برای نظارت بر جهش ژنتیکی در طول زمان
  • 50. مطالعه موردی 1: ساختار جمعیت جهانی انسان
  • 51. مطالعه موردی 2: جمعیت‌های حشره‌ای مدل تحت استرس آب و هوایی
  • 52. مطالعه موردی 3: منابع ژنتیکی گیاهان اهلی
  • 53. ادغام DAPC با مطالعات GWAS
  • 54. استفاده از DAPC برای محدودیت‌های گونه
  • 55. ملاحظات اخلاقی در تحقیقات ژنتیک جمعیت
  • 56. بهترین روش‌های به اشتراک‌گذاری داده‌های ژنومیک
  • 57. پژوهش بازتولیدپذیر با RMarkdown و `knitr`
  • 58. ایجاد تجسمات تعاملی با `shiny`
  • 59. مدیریت نسخه برای اسکریپت‌های تحلیل ژنوم (Git)
  • 60. ساخت ماژول آموزشی DAPC برای دوره‌های زیست‌شناسی
  • 61. تعیین اندازه نمونه برای خوشه‌بندی قابل اعتماد DAPC
  • 62. تحلیل توان برای تشخیص تمایز جمعیت
  • 63. شبیه‌سازی ژنوم‌های بزرگ با `simuPOP` برای آزمایش DAPC
  • 64. گسترش DAPC به داده‌های چند-امومی (مانند ترنسکریپتومیک)
  • 65. استفاده از `ggplot2` برای تجسمات سفارشی DAPC
  • 66. خودکارسازی گزارش‌های QC با `reportr` یا `rmarkdown`
  • 67. مدیریت داده‌های چندپلیدر در DAPC
  • 68. ادغام شاخص‌های عدم تعادل پیوند در DAPC
  • 69. استفاده از `Biostrings` برای DAPC مبتنی بر توالی
  • 70. جهت‌گیری‌های آینده: بهبودهای یادگیری ماشین برای DAPC

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.