کتاب طراحی و اجرای خطوط تولید داده ژنومیکس با Snakemake: از داده خام تا نتایج قابل اعتماد

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره طراحی و اجرای خطوط تولید داده ژنومیکس با Snakemake: از داده خام تا نتایج قابل اعتماد

موضوع کلی: تحلیل داده‌های زیستی و ژنومیکس

موضوع میانی: اتوماسیون و مدیریت جریان کار در ژنومیکس

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. مقدمه‌ای بر تحلیل داده‌های ژنومیکس
  • 2. آشنایی با خطوط تولید داده در ژنومیکس
  • 3. مراحل اصلی یک خط تولید داده ژنومی
  • 4. معرفی Snakemake: یک ابزار اتوماسیون خط تولید
  • 5. نصب و پیکربندی Snakemake
  • 6. نحوه‌ی تعریف قوانین (Rules) در Snakemake
  • 7. ورودی‌ها و خروجی‌های قوانین
  • 8. استفاده از متغیرها در Snakemake
  • 9. اجرای خطوط تولید Snakemake
  • 10. مدیریت وابستگی‌ها در Snakemake
  • 11. آشنایی با فایل‌های پیکربندی (Config files)
  • 12. استفاده از فایل‌های پیکربندی در Snakemake
  • 13. مدیریت محیط‌های نرم‌افزاری با Conda
  • 14. ادغام Conda با Snakemake
  • 15. بهینه‌سازی خطوط تولید با موازی‌سازی
  • 16. استفاده از خوشه‌های محاسباتی با Snakemake
  • 17. آشنایی با داده‌های RNA-seq
  • 18. کنترل کیفیت داده‌های RNA-seq
  • 19. هم‌ترازی (Alignment) داده‌های RNA-seq
  • 20. تعدادگذاری (Quantification) بیان ژن
  • 21. تحلیل بیان افتراقی (Differential Expression)
  • 22. آشنایی با داده‌های ChIP-seq
  • 23. کنترل کیفیت داده‌های ChIP-seq
  • 24. هم‌ترازی داده‌های ChIP-seq
  • 25. شناسایی نواحی اتصال پروتئین
  • 26. آشنایی با داده‌های DNA-seq
  • 27. کنترل کیفیت داده‌های DNA-seq
  • 28. هم‌ترازی داده‌های DNA-seq
  • 29. شناسایی تنوع ژنتیکی (Variants)
  • 30. آشنایی با داده‌های Metagenomics
  • 31. کنترل کیفیت داده‌های Metagenomics
  • 32. پردازش داده‌های Metagenomics
  • 33. تحلیل طبقه‌بندی (Taxonomic Profiling)
  • 34. آشنایی با پایگاه‌های داده ژنومیکس
  • 35. استفاده از پایگاه‌های داده در Snakemake
  • 36. ایجاد گزارش‌های آماری با Snakemake
  • 37. مستندسازی خطوط تولید با Snakemake
  • 38. کنترل نسخه خطوط تولید (Version Control)
  • 39. استفاده از Git و GitHub با Snakemake
  • 40. آشنایی با مفهوم Reproducibility
  • 41. تضمین Reproducibility در خطوط تولید ژنومیکس
  • 42. تست خطوط تولید Snakemake
  • 43. اشکال‌زدایی (Debugging) خطوط تولید Snakemake
  • 44. استفاده از Snakemake برای تحلیل داده‌های تک‌سلولی (Single-cell)
  • 45. آشنایی با داده‌های ATAC-seq
  • 46. کنترل کیفیت داده‌های ATAC-seq
  • 47. هم‌ترازی داده‌های ATAC-seq
  • 48. شناسایی نواحی باز کروماتین
  • 49. آشنایی با داده‌های Hi-C
  • 50. پردازش داده‌های Hi-C
  • 51. تحلیل ساختار کروماتین
  • 52. تبدیل فرمت‌های داده ژنومیکس
  • 53. استفاده از Snakemake برای ادغام داده‌ها
  • 54. آشنایی با خطوط لوله (Pipelines) آماده
  • 55. استفاده از خطوط لوله موجود در Snakemake
  • 56. ایجاد خطوط لوله سفارشی
  • 57. مقایسه Snakemake با سایر ابزارهای اتوماسیون
  • 58. بهینه‌سازی مصرف حافظه در Snakemake
  • 59. بهینه‌سازی زمان اجرا در Snakemake
  • 60. استفاده از Snakemake برای تحلیل داده‌های پروتئومیکس
  • 61. آشنایی با داده‌های Metabolomics
  • 62. پردازش داده‌های Metabolomics
  • 63. تحلیل آماری داده‌های ژنومیکس با R و Snakemake
  • 64. مصورسازی داده‌های ژنومیکس با Python و Snakemake
  • 65. آشنایی با ابزارهای وب برای نمایش نتایج
  • 66. انتشار نتایج تحلیل ژنومیکس
  • 67. آشنایی با استانداردهای داده ژنومیکس
  • 68. امنیت داده‌های ژنومیکس
  • 69. مدیریت داده‌های بزرگ در ژنومیکس
  • 70. آشنایی با مفاهیم Cloud Computing
  • 71. اجرای Snakemake در محیط Cloud
  • 72. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در ژنومیکس
  • 73. استفاده از Snakemake برای آموزش مدل‌های یادگیری ماشین
  • 74. آشنایی با هوش مصنوعی در ژنومیکس
  • 75. استفاده از Snakemake برای تحلیل داده‌های پیچیده ژنومیکس
  • 76. اتوماسیون تحلیل‌های چند‌-اُمیکی (Multi-omics)
  • 77. آشنایی با مفاهیم Genome Assembly
  • 78. استفاده از Snakemake برای Assembly ژنوم
  • 79. آشنایی با مفاهیم Genome Annotation
  • 80. استفاده از Snakemake برای Annotation ژنوم
  • 81. آشنایی با داده‌های epigenetic
  • 82. بررسی تغییرات epigenetic با Snakemake
  • 83. آشنایی با Snakemake در تحقیقات پزشکی
  • 84. آشنایی با Snakemake در کشاورزی و اصلاح نباتات
  • 85. آشنایی با Snakemake در تحقیقات دارویی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.