اکسپرس 24
کتاب طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل RNA-Seq با Nextflow

کتاب طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل RNA-Seq با Nextflow

تگ‌ها: Nextflow Nextflow ایران RNA-Seq آنالیز RNA بیوانفورماتیک پایپ‌لاین RNA-Seq تحلیل RNA-Seq خطوط لوله داده‌های زیستی ژنومیکس

انتخاب پلن

افزودنی‌های اختیاری

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل RNA-Seq با Nextflow

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی

موضوع میانی: تحلیل داده‌های RNA-Seq و ژنومیکس

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. مقدمه‌ای بر داده‌های RNA-Seq
  • 2. کیفیت داده‌های RNA-Seq و کنترل آن
  • 3. فرمت‌های رایج فایل‌های RNA-Seq
  • 4. همترازسازی (Alignment) داده‌های RNA-Seq
  • 5. آشنایی با نرم‌افزار همترازساز STAR
  • 6. آشنایی با نرم‌افزار همترازساز HISAT2
  • 7. بررسی و ارزیابی نتایج همترازسازی
  • 8. کوانتیفیکاسیون (Quantification) بیان ژن
  • 9. آشنایی با نرم‌افزار featureCounts
  • 10. آشنایی با نرم‌افزار HTSeq-count
  • 11. نرمال‌سازی داده‌های RNA-Seq
  • 12. روش‌های نرمال‌سازی RPKM، FPKM و TPM
  • 13. آشنایی با نرم‌افزار DESeq2 برای تحلیل بیان تفاضلی
  • 14. آشنایی با نرم‌افزار edgeR برای تحلیل بیان تفاضلی
  • 15. تحلیل بیان تفاضلی و شناسایی ژن‌های تنظیم‌شده
  • 16. تفسیر نتایج تحلیل بیان تفاضلی
  • 17. اصطلاحات آماری در تحلیل RNA-Seq (P-value, FDR)
  • 18. تصحیح چندآزمونی در تحلیل RNA-Seq
  • 19. آشنایی با آنالیز مسیرهای متابولیکی (Pathway Analysis)
  • 20. آشنایی با ابزار DAVID برای آنالیز مسیرهای متابولیکی
  • 21. آشنایی با ابزار KEGG برای آنالیز مسیرهای متابولیکی
  • 22. آشنایی با ابزار GOseq برای آنالیز GO
  • 23. تحلیل داده‌های RNA-Seq در سلول‌های منفرد (Single-Cell RNA-Seq)
  • 24. مقدمه‌ای بر تحلیل داده‌های scRNA-Seq
  • 25. پیش‌پردازش داده‌های scRNA-Seq
  • 26. کلاسترینگ (Clustering) سلول‌ها در داده‌های scRNA-Seq
  • 27. شناسایی نشانگرهای اختصاصی سلولی در داده‌های scRNA-Seq
  • 28. تجسم داده‌های scRNA-Seq با استفاده از t-SNE و UMAP
  • 29. آشنایی با نرم‌افزار Seurat برای تحلیل scRNA-Seq
  • 30. آشنایی با نرم‌افزار Scanpy برای تحلیل scRNA-Seq
  • 31. مقدمه‌ای بر Nextflow
  • 32. نصب و پیکربندی Nextflow
  • 33. نوشتن اولین خط لوله Nextflow
  • 34. مفاهیم کلیدی در Nextflow (processes, channels, workflows)
  • 35. مدیریت وابستگی‌ها در Nextflow
  • 36. پارامترسازی خطوط لوله Nextflow
  • 37. اجرای خطوط لوله Nextflow
  • 38. نظارت بر اجرای خطوط لوله Nextflow
  • 39. مدیریت लॉग‌ها در Nextflow
  • 40. آشنایی با Docker و Singularity
  • 41. استفاده از Docker و Singularity در Nextflow
  • 42. ایجاد کانتینر برای خطوط لوله RNA-Seq
  • 43. بهینه‌سازی خطوط لوله Nextflow برای اجرا در محیط‌های مختلف
  • 44. خط لوله‌های RNA-Seq آماده برای استفاده
  • 45. ساخت خط لوله کامل RNA-Seq با Nextflow
  • 46. تحلیل واریانت‌های ژنتیکی از داده‌های RNA-Seq
  • 47. شناسایی فیوژن‌های ژنی با استفاده از RNA-Seq
  • 48. بررسی جایگزین‌های اسپلایسینگ (Alternative Splicing) با استفاده از RNA-Seq
  • 49. شناسایی RNAهای غیرکُدشونده (non-coding RNAs) با استفاده از RNA-Seq
  • 50. تحلیل RNA-Seq در شرایط مختلف (مثلاً پاسخ به درمان)
  • 51. تحلیل RNA-Seq در مطالعات بیماری
  • 52. تحلیل RNA-Seq در مطالعات تفاوت‌های فردی
  • 53. مقدمه‌ای بر داده‌های Long-Read RNA-Seq (PacBio, Nanopore)
  • 54. تحلیل داده‌های Long-Read RNA-Seq
  • 55. ادغام داده‌های Short-Read و Long-Read RNA-Seq
  • 56. کنترل نسخه (Version Control) با Git در پروژه‌های Nextflow
  • 57. همکاری در پروژه‌های Nextflow با استفاده از GitHub
  • 58. مقدمه‌ای بر CI/CD برای خطوط لوله Nextflow
  • 59. تست و اعتبارسنجی خطوط لوله RNA-Seq
  • 60. مستندسازی خطوط لوله RNA-Seq
  • 61. بهبود قابلیت اطمینان و تکرارپذیری خطوط لوله RNA-Seq
  • 62. تحلیل داده‌های RNA-Seq در محیط ابری (Cloud)
  • 63. استفاده از AWS، Google Cloud یا Azure برای تحلیل RNA-Seq
  • 64. مقایسه روش‌های مختلف تحلیل RNA-Seq
  • 65. انتخاب روش مناسب برای تحلیل RNA-Seq با توجه به سوال پژوهشی
  • 66. آشنایی با پایگاه‌های داده RNA-Seq (مثلاً GEO, ArrayExpress)
  • 67. استفاده از پایگاه‌های داده RNA-Seq برای طراحی آزمایش‌ها
  • 68. آشنایی با ابزارهای تجسم داده‌های RNA-Seq
  • 69. آشنایی با نرم‌افزار IGV برای تجسم داده‌های RNA-Seq
  • 70. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در تحلیل RNA-Seq
  • 71. استفاده از یادگیری ماشین برای پیش‌بینی بیان ژن
  • 72. تحلیل داده‌های RNA-Seq در بافت‌های فضایی (Spatial Transcriptomics)
  • 73. مقدمه‌ای بر Spatial Transcriptomics
  • 74. تحلیل داده‌های Spatial Transcriptomics با استفاده از Nextflow

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.