اکسپرس 24
کتاب طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل زیستی با Snakemake

کتاب طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل زیستی با Snakemake

تگ‌ها: Snakemake آموزش اسنیک‌میک بیوانفورماتیک بیوانفورماتیک پیشرفته پایپ‌لاین بیوانفورماتیک پردازش داده‌های ژنتیکی تحلیل داده‌های زیستی خطوط لوله بیوانفورماتیک خودکارسازی تحلیل داده علوم داده زیستی

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره طراحی و پیاده‌سازی خطوط لوله تحلیل زیستی با Snakemake

موضوع کلی: علوم داده و تحلیل زیستی

موضوع میانی: خودکارسازی فرآیندهای تحلیل داده‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. مقدمه‌ای بر خطوط لوله تحلیل زیستی
  • 2. آشنایی با Snakemake: مفاهیم پایه
  • 3. نصب و پیکربندی Snakemake
  • 4. ساختار فایل Snakefile
  • 5. قواعد (Rules) در Snakemake
  • 6. ورودی‌ها و خروجی‌های قواعد
  • 7. وابستگی‌ها (Dependencies) در Snakemake
  • 8. مدیریت فایل‌ها و مسیرها
  • 9. استفاده از متغیرها و توابع در Snakemake
  • 10. اجرای خطوط لوله Snakemake
  • 11. مدیریت خطاها و گزارش‌گیری
  • 12. مقدمه‌ای بر زبان برنامه‌نویسی پایتون برای تحلیل زیستی
  • 13. کار با فایل‌های متنی و داده‌های جدولی
  • 14. دستکاری رشته‌ها و داده‌ها در پایتون
  • 15. استفاده از کتابخانه‌های پایتون در Snakemake
  • 16. مقدمه‌ای بر فرمت‌های رایج داده‌های زیستی (FASTQ, BAM, VCF)
  • 17. پردازش داده‌های RNA-seq با Snakemake
  • 18. هم‌ترازی (Alignment) داده‌های RNA-seq
  • 19. کمی‌سازی (Quantification) بیان ژن
  • 20. آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها
  • 21. پردازش داده‌های DNA-seq با Snakemake
  • 22. هم‌ترازی داده‌های DNA-seq
  • 23. شناسایی تنوع ژنتیکی (Variant Calling)
  • 24. آنالیز داده‌های ژنومیکس مقایسه‌ای
  • 25. پردازش داده‌های ChIP-seq با Snakemake
  • 26. هم‌ترازی داده‌های ChIP-seq
  • 27. شناسایی نواحی اتصال پروتئین
  • 28. آنالیز enrichment
  • 29. پردازش داده‌های metagenomics با Snakemake
  • 30. هم‌ترازی داده‌های metagenomics
  • 31. طبقه‌بندی و آنالیز فراوانی میکروارگانیسم‌ها
  • 32. کار با پایگاه‌های داده زیستی
  • 33. استفاده از APIها برای دسترسی به داده‌ها
  • 34. ادغام داده‌ها از منابع مختلف
  • 35. مقدمه‌ای بر Docker و Containerization
  • 36. ایجاد تصاویر Docker برای Snakemake
  • 37. اجرای خطوط لوله Snakemake در Docker
  • 38. مدیریت محیط‌های نرم‌افزاری
  • 39. بهینه‌سازی خطوط لوله Snakemake برای پردازش داده‌های بزرگ
  • 40. استفاده از منابع محاسباتی موازی
  • 41. کش (Cache) کردن نتایج میانی
  • 42. مدیریت حافظه و CPU
  • 43. تست و اعتبارسنجی خطوط لوله Snakemake
  • 44. نوشتن تست‌های واحد (Unit Tests)
  • 45. تست‌های یکپارچه‌سازی (Integration Tests)
  • 46. کنترل نسخه (Version Control) با Git
  • 47. همکاری در پروژه‌های Snakemake
  • 48. به اشتراک‌گذاری و انتشار خطوط لوله
  • 49. مقدمه‌ای بر مفاهیم آمار زیستی
  • 50. آزمون‌های آماری رایج در تحلیل زیستی
  • 51. تصحیح چندآزمونی (Multiple Testing Correction)
  • 52. تجسم داده‌های زیستی با ابزارهای پایتون
  • 53. ایجاد نمودارها و تصاویر
  • 54. تحلیل اکتشافی داده‌ها (EDA)
  • 55. کار با داده‌های سری زمانی زیستی
  • 56. آنالیز داده‌های expression profiling
  • 57. تحلیل داده‌های پروتئومیکس
  • 58. آنالیز داده‌های متابولومیکس
  • 59. طراحی خطوط لوله برای داده‌های تک‌سلولی (Single-Cell)
  • 60. پردازش داده‌های Single-Cell RNA-seq
  • 61. آنالیز خوشه‌بندی و طبقه‌بندی سلول‌ها
  • 62. تحلیل مسیرهای سیگنالینگ
  • 63. کار با ابزارهای تحلیل ژنومیکس
  • 64. استفاده از ابزارهای annotation
  • 65. آنالیز عملکردی ژن‌ها
  • 66. کاربرد Snakemake در تحقیقات دارویی
  • 67. شناسایی اهداف دارویی
  • 68. بهینه‌سازی ساختار داروها
  • 69. تحلیل داده‌های بالینی
  • 70. ارتباط بین ژنتیک و بیماری‌ها
  • 71. پیش‌بینی پاسخ به درمان
  • 72. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در زیست‌شناسی
  • 73. الگوریتم‌های یادگیری ماشین رایج
  • 74. استفاده از یادگیری ماشین برای طبقه‌بندی و پیش‌بینی
  • 75. کاربرد Snakemake در تحقیقات کشاورزی
  • 76. بهبود عملکرد محصولات کشاورزی
  • 77. مقاومت به آفات و بیماری‌ها
  • 78. تحلیل داده‌های میکروبیوم
  • 79. شناسایی الگوهای میکروبیوم
  • 80. ارتباط میکروبیوم با سلامتی
  • 81. مقدمه‌ای بر داده‌های پروتئینی
  • 82. آنالیز ساختار پروتئین
  • 83. پیش‌بینی عملکرد پروتئین
  • 84. طراحی پروتئین
  • 85. تحلیل داده‌های ایمونومیکس
  • 86. شناسایی پاسخ‌های ایمنی
  • 87. توسعه واکسن‌ها
  • 88. مقدمه‌ای بر داده‌های تصویربرداری زیستی
  • 89. پردازش تصاویر میکروسکوپی
  • 90. آنالیز تصاویر پزشکی
  • 91. شناسایی الگوها در تصاویر
  • 92. مقدمه‌ای بر تحلیل داده‌های epigenetic
  • 93. تحلیل methylation
  • 94. تحلیل histone modifications
  • 95. تغییرات epigenetic و بیماری‌ها
  • 96. کار با داده‌های transcriptomics
  • 97. آنالیز splicing
  • 98. شناسایی transcript isoforms
  • 99. تنظیم بیان ژن‌ها
  • 100. مقدمه‌ای بر تحلیل داده‌های fluxomics

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.