کتاب طراحی حرفه‌ای آزمایش‌های داکینگ مولکولی؛ از آماده‌سازی ساختار تا اعتبارسنجی نتایج

انتخاب پلن

افزودنی‌های اختیاری

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره طراحی حرفه‌ای آزمایش‌های داکینگ مولکولی؛ از آماده‌سازی ساختار تا اعتبارسنجی نتایج

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی

موضوع میانی: طراحی و تحلیل آزمایش‌های داکینگ مولکولی

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. مبانی داکینگ مولکولی و نقش آن در کشف دارو
  • 2. مفاهیم برهم‌کنش لیگاند و گیرنده
  • 3. انواع روش‌های Molecular Docking
  • 4. تفاوت داکینگ سخت، انعطاف‌پذیر و نیمه‌انعطاف‌پذیر
  • 5. فضای جست‌وجوی پوزهای اتصال
  • 6. توابع امتیازدهی و پیش‌بینی انرژی اتصال
  • 7. محدودیت‌ها و فرضیات آزمایش‌های داکینگ
  • 8. طراحی سؤال پژوهشی برای یک آزمایش داکینگ
  • 9. انتخاب پروتئین هدف مناسب
  • 10. انتخاب ساختار سه‌بعدی پروتئین از پایگاه‌های داده
  • 11. مقایسه ساختارهای تجربی و مدل‌سازی‌شده
  • 12. انتخاب ساختار پروتئین بر اساس Resolution و کیفیت
  • 13. شناسایی جایگاه فعال و محل اتصال لیگاند
  • 14. بررسی لیگاندهای هم‌بلور و ساختارهای کمپلکس
  • 15. آماده‌سازی ساختار پروتئین برای داکینگ
  • 16. مدیریت آب‌های ساختاری در جایگاه اتصال
  • 17. بررسی کوفاکتورها و یون‌های فلزی
  • 18. تعیین وضعیت پروتوناسیون پروتئین
  • 19. مدیریت باقی‌مانده‌های انعطاف‌پذیر
  • 20. شناسایی و اصلاح خطاهای ساختاری پروتئین
  • 21. انتخاب و آماده‌سازی لیگاندها
  • 22. استانداردسازی ساختار شیمیایی لیگاند
  • 23. تعیین Protonation State لیگاند
  • 24. مدیریت Tautomerها و ایزومرها
  • 25. تولید Conformerهای سه‌بعدی لیگاند
  • 26. بهینه‌سازی هندسه و انرژی لیگاند
  • 27. مدیریت Chiral Centerها و Stereo-isomerها
  • 28. انتخاب مجموعه لیگاند برای Virtual Screening
  • 29. تعریف Binding Site و Grid Box
  • 30. انتخاب ابعاد مناسب فضای جست‌وجو
  • 31. تنظیم پارامترهای جست‌وجوی داکینگ
  • 32. کنترل Exhaustiveness و Sampling
  • 33. مدیریت انعطاف‌پذیری لیگاند در فرآیند داکینگ
  • 34. مدیریت انعطاف‌پذیری گیرنده
  • 35. انتخاب الگوریتم مناسب برای Docking
  • 36. اجرای آزمایش داکینگ با AutoDock و AutoDock Vina
  • 37. اجرای داکینگ با روش‌های مبتنی بر Scoring Function
  • 38. طراحی آزمایش برای چندین لیگاند
  • 39. طراحی آزمایش برای چندین پروتئین یا Target
  • 40. مدیریت Batch Docking و پردازش خودکار
  • 41. ثبت پارامترها و شرایط اجرای آزمایش
  • 42. کنترل کیفیت خروجی‌های داکینگ
  • 43. بررسی Poseهای اتصال پیش‌بینی‌شده
  • 44. تحلیل انرژی و امتیازهای Docking
  • 45. مقایسه Ranking لیگاندها
  • 46. تحلیل برهم‌کنش‌های هیدروژنی
  • 47. تحلیل برهم‌کنش‌های آب‌گریز
  • 48. تحلیل برهم‌کنش‌های π-π و π-cation
  • 49. تحلیل برهم‌کنش‌های الکترواستاتیکی
  • 50. بررسی فاصله و هندسه برهم‌کنش‌ها
  • 51. تحلیل Residueهای کلیدی در جایگاه اتصال
  • 52. خوشه‌بندی Poseهای مشابه
  • 53. انتخاب بهترین Pose از میان نتایج
  • 54. مقایسه نتایج با لیگاند مرجع
  • 55. Redocking و ارزیابی بازتولید حالت اتصال
  • 56. اعتبارسنجی پروتکل داکینگ با RMSD
  • 57. تحلیل حساسیت نتایج نسبت به پارامترهای داکینگ
  • 58. بررسی پایداری Ranking لیگاندها
  • 59. مقایسه چند Scoring Function
  • 60. شناسایی False Positive و False Negative
  • 61. ارزیابی Virtual Screening و معیارهای عملکرد
  • 62. تحلیل ROC و Precision-Recall در غربالگری مجازی
  • 63. کنترل Bias در طراحی آزمایش داکینگ
  • 64. مقایسه نتایج محاسباتی با داده‌های تجربی
  • 65. ترکیب Docking با Molecular Dynamics
  • 66. استفاده از Molecular Dynamics برای اعتبارسنجی Poseها
  • 67. تحلیل Binding Free Energy پس از داکینگ
  • 68. کاربرد MM-PBSA و MM-GBSA در ارزیابی اتصال
  • 69. طراحی Pipeline کامل برای آزمایش داکینگ
  • 70. اتوماسیون آزمایش‌های داکینگ با Python
  • 71. پردازش و تحلیل انبوه نتایج داکینگ
  • 72. مدیریت داده‌ها و Reproducibility آزمایش
  • 73. مستندسازی کامل پروتکل محاسباتی
  • 74. تفسیر علمی نتایج و تشخیص ادعاهای بیش‌ازحد
  • 75. طراحی یک مطالعه داکینگ قابل انتشار
  • 76. ساخت Workflow نهایی از آماده‌سازی تا اعتبارسنجی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.