کتاب مقیاس‌پذیری و اجرای بهینه Workflowهای MIRACL-seq روی کلاسترهای HPC

انتخاب پلن

افزودنی‌های اختیاری

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 62,488 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره مقیاس‌پذیری و اجرای بهینه Workflowهای MIRACL-seq روی کلاسترهای HPC

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی

موضوع میانی: پردازش و مقیاس‌پذیری داده‌های توالی‌یابی با رایانش ابری و HPC

📋 سرفصل‌های دوره

  • 1. مبانی MIRACL-seq و جایگاه آن در تحلیل داده‌های زیستی
  • 2. ساختار و مراحل اصلی Workflow در MIRACL-seq
  • 3. انواع داده‌های ورودی و خروجی در Workflowهای MIRACL-seq
  • 4. آماده‌سازی داده‌های توالی‌یابی برای پردازش در HPC
  • 5. کنترل کیفیت داده‌های خام پیش از اجرای Workflow
  • 6. پیش‌پردازش و پاک‌سازی داده‌های توالی‌یابی
  • 7. آشنایی با معماری کلاسترهای HPC برای تحلیل زیستی
  • 8. محاسبات گره‌ای و مفهوم Node در کلاسترهای HPC
  • 9. مدیریت منابع پردازشی در محیط HPC
  • 10. پردازنده، حافظه و فضای ذخیره‌سازی در اجرای Workflow
  • 11. سیستم‌های صف و زمان‌بندی Jobها در کلاستر
  • 12. تعریف Jobهای MIRACL-seq برای اجرای Batch
  • 13. تنظیم درخواست CPU و حافظه برای مراحل مختلف Workflow
  • 14. مدیریت فضای موقت و دائمی داده‌ها در HPC
  • 15. سازمان‌دهی فایل‌ها و داده‌های پروژه در کلاستر
  • 16. اجرای دستی مراحل MIRACL-seq برای شناخت وابستگی‌ها
  • 17. تبدیل مراحل دستی به Workflow قابل تکرار
  • 18. مدیریت وابستگی میان مراحل پردازش
  • 19. پارامتری‌سازی Workflow برای اجرای چند نمونه
  • 20. اجرای موازی نمونه‌های مستقل
  • 21. موازی‌سازی مراحل محاسباتی MIRACL-seq
  • 22. تفکیک وظایف CPU-bound و I/O-bound
  • 23. بهینه‌سازی مصرف حافظه در پردازش داده‌های حجیم
  • 24. بهینه‌سازی ورودی و خروجی فایل‌ها در HPC
  • 25. کاهش سربار انتقال داده میان گره‌ها
  • 26. استفاده بهینه از Storage و فایل‌سیستم‌های توزیع‌شده
  • 27. مدیریت تعداد زیاد Sample در یک پروژه MIRACL-seq
  • 28. طراحی ساختار Batch برای پردازش مقیاس‌بالا
  • 29. تنظیم Job Array برای پردازش تعداد زیادی نمونه
  • 30. مدیریت صف‌های HPC برای Workflowهای طولانی
  • 31. کنترل هم‌زمانی Jobها و جلوگیری از اشباع منابع
  • 32. مدیریت خطا در اجرای موازی Workflow
  • 33. ثبت Log و وضعیت اجرای مراحل مختلف
  • 34. ردیابی شکست Jobها و تشخیص علت خطا
  • 35. طراحی مکانیزم Resume برای اجرای مجدد مراحل ناموفق
  • 36. جلوگیری از پردازش تکراری داده‌های موفق
  • 37. اعتبارسنجی خروجی هر مرحله از Workflow
  • 38. کنترل کیفیت خروجی‌های پردازش‌شده
  • 39. مدیریت Metadata نمونه‌ها در اجرای مقیاس‌بالا
  • 40. استانداردسازی نام‌گذاری فایل‌ها و نمونه‌ها
  • 41. نسخه‌بندی پارامترها و تنظیمات Workflow
  • 42. مدیریت محیط نرم‌افزاری و وابستگی‌های MIRACL-seq
  • 43. استفاده از Moduleها در محیط‌های HPC
  • 44. ایجاد محیط‌های ایزوله برای ابزارهای بیوانفورماتیک
  • 45. مدیریت نسخه ابزارها و کتابخانه‌های موردنیاز
  • 46. استفاده از Containerها برای اجرای قابل تکرار Workflow
  • 47. انتقال Containerهای MIRACL-seq به محیط HPC
  • 48. مقایسه اجرای مستقیم و Containerized Workflow
  • 49. مدیریت منابع در Workflowهای Containerized
  • 50. خودکارسازی اجرای MIRACL-seq در HPC
  • 51. طراحی Pipelineهای قابل تکرار و قابل نگهداری
  • 52. پارامتری‌سازی اجرای Workflow برای پروژه‌های مختلف
  • 53. اجرای آزمایشی روی مجموعه‌داده کوچک
  • 54. Benchmark کردن Workflow پیش از مقیاس‌گذاری
  • 55. اندازه‌گیری زمان اجرای مراحل مختلف
  • 56. اندازه‌گیری مصرف CPU و حافظه
  • 57. شناسایی گلوگاه‌های محاسباتی Workflow
  • 58. تحلیل گلوگاه‌های I/O و Storage
  • 59. بهینه‌سازی زمان Turnaround در پردازش مقیاس‌بالا
  • 60. مقایسه اجرای ترتیبی و موازی MIRACL-seq
  • 61. برآورد هزینه منابع محاسباتی و ذخیره‌سازی
  • 62. مقیاس‌گذاری افقی Workflow روی چند گره
  • 63. مقیاس‌گذاری برای صدها یا هزاران نمونه
  • 64. مدیریت بار کاری در اجرای پروژه‌های بزرگ
  • 65. استفاده از Checkpoint برای Workflowهای طولانی
  • 66. مدیریت نتایج میانی و کاهش مصرف Storage
  • 67. پاک‌سازی خودکار داده‌های موقت
  • 68. تضمین بازتولیدپذیری تحلیل MIRACL-seq
  • 69. مستندسازی محیط، پارامترها و نسخه داده‌ها
  • 70. طراحی Workflow مقاوم در برابر خطا برای HPC
  • 71. بهینه‌سازی نهایی Pipeline برای اجرای Production
  • 72. اعتبارسنجی یک اجرای کامل MIRACL-seq در مقیاس بالا
  • 73. طراحی یک پروژه عملی از داده خام تا خروجی نهایی
  • 74. تحلیل عملکرد و مقایسه چند راهکار مقیاس‌پذیری

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.