کتاب صوتی پیش‌بینی ساختار ثانویه RNA: از تئوری تا عمل

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره پیش‌بینی ساختار ثانویه RNA: از تئوری تا عمل

موضوع کلی: بیوانفورماتیک

موضوع میانی: تحلیل توالی RNA

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر RNA و ساختار آن
• 2. اهمیت ساختار ثانویه RNA در بیولوژی
• 3. انواع ساختارهای ثانویه RNA
• 4. قواعد جفت‌شدگی بازها در RNA
• 5. انرژی آزاد و پایداری ساختارهای RNA
• 6. روش‌های تجربی تعیین ساختار ثانویه RNA
• 7. مقدمه‌ای بر الگوریتم‌های پیش‌بینی ساختار ثانویه
• 8. الگوریتم‌های برنامه‌نویسی پویا (Dynamic Programming)
• 9. الگوریتم Nussinov
• 10. الگوریتم Zuker
• 11. تفسیر نتایج الگوریتم‌های Nussinov و Zuker
• 12. محدودیت‌های الگوریتم‌های برنامه‌نویسی پویا
• 13. روش‌های مبتنی بر انرژی ترمودینامیکی
• 14. مدل‌سازی انرژی آزاد ساختارهای RNA
• 15. تأثیر یون‌ها و حلال‌ها بر ساختار RNA
• 16. روش‌های مبتنی بر یادگیری ماشین
• 17. شبکه‌های عصبی برای پیش‌بینی ساختار RNA
• 18. ماشین‌های بردار پشتیبان (SVM) در پیش‌بینی RNA
• 19. روش‌های انسامبل (Ensemble Methods)
• 20. استفاده از داده‌های فیلتر شده برای آموزش مدل‌ها
• 21. ارزیابی عملکرد مدل‌های پیش‌بینی
• 22. معیارهای ارزیابی: حساسیت، ویژگی، دقت
• 23. مقایسه روش‌های مختلف پیش‌بینی ساختار RNA
• 24. نرم‌افزارهای محبوب پیش‌بینی ساختار RNA (RNAfold, mfold, ViennaRNA Package)
• 25. کاربرد عملی RNAfold
• 26. کاربرد عملی mfold
• 27. کاربرد عملی ViennaRNA Package
• 28. تحلیل ساختارهای شبه‌گره (Pseudoknot)
• 29. روش‌های پیش‌بینی ساختارهای شبه‌گره
• 30. اهمیت ساختارهای شبه‌گره در عملکرد RNA
• 31. پیش‌بینی ساختار RNA در شرایط مختلف
• 32. تأثیر دما و غلظت نمک بر ساختار RNA
• 33. پیش‌بینی ساختار RNA با توالی‌های غیر استاندارد
• 34. پیش‌بینی ساختار RNA در موجودات مختلف
• 35. کاربردهای پیش‌بینی ساختار RNA در داروسازی
• 36. شناسایی اهداف دارویی با استفاده از ساختار RNA
• 37. طراحی RNAهای مداخله‌گر (RNAi)
• 38. کاربردهای پیش‌بینی ساختار RNA در بیوتکنولوژی
• 39. مهندسی RNA برای کاربردهای مختلف
• 40. پیش‌بینی ساختار RNA و بیماری‌ها
• 41. نقش ساختار RNA در بروز بیماری‌ها
• 42. تحلیل ساختار RNA در مقیاس ژنوم
• 43. روش‌های پیش‌بینی ساختار RNA در مقیاس بزرگ
• 44. چالش‌ها و آینده پیش‌بینی ساختار RNA
• 45. تکنیک‌های جدید و نوظهور در پیش‌بینی ساختار RNA
• 46. مقدمه‌ای بر ساختار سه بعدی RNA
• 47. ارتباط بین ساختار ثانویه و سه بعدی RNA