کتاب صوتی دککردن پروتئین: روشها و کاربردهای محاسباتی
🎓 دوره آموزشی جامع
📚 اطلاعات دوره
عنوان دوره: دوره دککردن پروتئین: روشها و کاربردهای محاسباتی
موضوع کلی: بیوانفورماتیک و مدل‌سازی مولکولی
موضوع میانی: روش‌های محاسباتی در بیولوژی ساختاری
📋 سرفصل‌های دوره
- 1. مقدمه‌ای بر دککردن پروتئین و اهمیت آن
- 2. ساختار پروتئین‌ها: بازنگری مفاهیم کلیدی
- 3. مکانیسم‌های مولکولی دککردن پروتئین
- 4. نیروهای درگیر در دککردن پروتئین
- 5. محدودیت‌ها و چالش‌های دککردن پروتئین
- 6. معرفی الگوریتم‌های جستجوی دککردن
- 7. جستجوی فراگیر (Exhaustive Search)
- 8. روش‌های مونت‌کارلو (Monte Carlo) در دککردن
- 9. الگوریتم ژنتیک و کاربرد آن در دککردن
- 10. شبیه‌سازی تبرید تدریجی (Simulated Annealing)
- 11. روش‌های مبتنی بر انرژی
- 12. تابع انرژی در دککردن پروتئین: مفاهیم و پارامترها
- 13. محاسبه انرژی و امتیازدهی به کمپلکس‌ها
- 14. بهینه‌سازی انرژی با استفاده از میدان‌های نیروی مولکولی
- 15. میدان‌های نیروی رایج در دککردن پروتئین (AMBER, CHARMM, GROMOS)
- 16. روش‌های پیش‌بینی انرژی آزاد اتصال
- 17. روش‌های مبتنی بر دانش (Knowledge-based) در دککردن
- 18. استفاده از پایگاه‌های داده ساختاری در دککردن
- 19. روش‌های دککردن مبتنی بر شکل (Shape Complementarity)
- 20. روش‌های دککردن انعطاف‌پذیر (Flexible Docking)
- 21. دککردن با در نظر گرفتن تغییرات ساختاری پروتئین
- 22. روش‌های دککردن با در نظر گرفتن آب و حلال‌ها
- 23. ارزیابی و اعتبارسنجی نتایج دککردن
- 24. معیارهای ارزیابی دککردن (RMSD, GDT_TS, I-RMSD)
- 25. روش‌های Cross-Docking و Docking Challenge
- 26. نقش دککردن در طراحی دارو
- 27. شناسایی ترکیبات دارویی با استفاده از دککردن
- 28. دککردن مجازی و غربالگری ترکیبات
- 29. دککردن پروتئین‌های غشایی
- 30. چالش‌های دککردن پروتئین‌های چند زیرواحدی
- 31. دککردن پروتئین‌ها با لیگاندها
- 32. دککردن پروتئین‌ها با RNA و DNA
- 33. روش‌های دککردن مبتنی بر ابر (Cloud Docking)
- 34. دککردن پروتئین‌های بزرگ و کمپلکس‌ها
- 35. بهینه‌سازی فرایند دککردن: پارامترها و تنظیمات
- 36. استفاده از GPU در محاسبات دککردن
- 37. تحلیل حساسیت دککردن
- 38. پیش‌پردازش و آماده‌سازی ساختار پروتئین برای دککردن
- 39. نرم‌افزارهای محبوب دککردن پروتئین (AutoDock, DOCK, Glide)
- 40. مقایسه و انتخاب نرم‌افزار مناسب دککردن
- 41. کار با AutoDock Vina: آموزش گام به گام
- 42. کار با DOCK: آموزش گام به گام
- 43. کار با Glide: آموزش گام به گام
- 44. دککردن پروتئین‌های بیماری‌زا
- 45. دککردن پروتئین‌ها برای مطالعه تعاملات پروتئین-پروتئین
- 46. تحلیل نتایج دککردن با استفاده از نرم‌افزارهای تجسم مولکولی
- 47. پیش‌بینی و بررسی تعاملات پروتئین-پروتئین
- 48. دککردن و طراحی پروتئین‌های جدید
- 49. کاربردهای دککردن در بیوتکنولوژی
- 50. آینده دککردن پروتئین: روندهای نوظهور
برای آموختن، همیشه لازم نیست بخوانید
گاهی بهترین فرصت یادگیری زمانی است که در مسیر رفت‌وآمد هستید، قدم می‌زنید، استراحت می‌کنید یا کارهای روزمره‌تان را انجام می‌دهید. محتوای صوتی کمک می‌کند از این لحظه‌ها برای شنیدن، اندیشیدن و آشنایی با موضوعات تازه بهره ببرید.
◷
یادگیری در دل روزمرگی
از زمان رفت‌وآمد، پیاده‌روی یا استراحت برای شنیدن محتوای مفید استفاده کنید؛ بدون آنکه همیشه به کتاب چاپی یا صفحه نمایش نیاز داشته باشید.
◎
تجربه‌ای شنیداری و دلنشین
با روایت صوتی، توضیحات گفتاری و فضای شنیداری هر محتوا همراه شوید و متناسب با سلیقه خود، شیوه تازه‌ای برای دریافت مطالب تجربه کنید.
✦
گسترش دانش و دیدگاه
با موضوعات متنوع آشنا شوید، ایده‌های تازه کشف کنید و فرصت بیشتری برای یادگیری مستمر و پرورش کنجکاوی خود بسازید.
♫
همراه با سبک زندگی شما
محتوای صوتی را متناسب با برنامه روزانه خود انتخاب کنید و در زمان مناسب، شنیدن را به بخشی از عادت‌های شخصی‌تان تبدیل کنید.
کتاب صوتی یا پادکست؟
کتاب صوتی
راهی برای همراه شدن با محتوای یک کتاب از طریق شنیدن. بسته به اثر، می‌توانید داستان‌ها، آموزش‌ها، مفاهیم تخصصی یا مطالب کاربردی را در قالب روایت و بیان صوتی دنبال کنید.
مناسب برای شنیدن و مرور محتوای کتاب‌ها
پادکست آموزشی
فرصتی برای دنبال کردن موضوعات مشخص در قالب گفت‌وگو، روایت، توضیح آموزشی یا مجموعه‌ای از قسمت‌های صوتی؛ مناسب برای کشف ایده‌ها و آشنایی با دیدگاه‌های گوناگون.
مناسب برای یادگیری موضوعی و شنیدن دیدگاه‌های تازه
هر جا که هستید، شنیدن را آغاز کنید
با دستگاه مناسب خود، محتوای صوتی را به آسانی دنبال کنید.
▯
گوشی هوشمند
اندروید و آیفون
▣
تبلت
برای شنیدن و دنبال کردن محتوا
▤
رایانه و لپ‌تاپ
با پخش‌کننده صوتی سازگار
♫
هدفون و بلندگو
برای شنیدن متناسب با محیط
چطور از تجربه شنیدن بیشتر بهره ببریم؟
✦ زمان مناسبی برای شنیدن انتخاب کنید؛ زمانی که بتوانید با آرامش به محتوا توجه داشته باشید.
✦ برای مطالب آموزشی، نکته‌های مهم را یادداشت کنید یا پس از پایان شنیدن، آن‌ها را مرور کنید.
✦ اگر محتوا طولانی است، آن را در چند نوبت دنبال کنید تا فرصت بیشتری برای درک و مرور داشته باشید.
✦ هنگام رانندگی یا انجام کارهای نیازمند تمرکز، ایمنی را در اولویت قرار دهید و از شیوه شنیدنی استفاده کنید که حواس شما را مختل نکند.
هر شنیدن، فرصتی برای کشف است
با کتاب‌های صوتی و پادکست‌های آموزشی، دنیای تازه‌ای از ایده‌ها، روایت‌ها و آموختنی‌ها را به لحظه‌های خود اضافه کنید.
express24.ir
امکانات پخش، ادامه شنیدن و دسترسی آفلاین به نوع فایل، دستگاه و نرم‌افزار مورد استفاده بستگی دارد.
تگ‌ها:
AutoDock
bioinformatics
computational biology
DOCK
drug discovery
Glide
in silico
molecular dynamics
molecular interaction
molecular modeling
protein docking
protein structure
protein-protein interaction
structural biology
virtual screening
نظرات
هنوز نظری ثبت نشده است.
وارد شوید تا نظر ثبت کنید.