کتاب صوتی آموزش پیشرفته تحلیل داده‌های تک‌سلولی و چندامیکس در بیماری‌های عفونی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره آموزش پیشرفته تحلیل داده‌های تک‌سلولی و چندامیکس در بیماری‌های عفونی

موضوع کلی: زیست‌شناسی محاسباتی و پزشکی مولکولی

موضوع میانی: تحلیل داده‌های تک‌سلولی و امیکس ترکیبی در بیماری‌های عفونی (Single-Cell Multi-Omics)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر فناوری‌های تک‌سلولی (Single-Cell Technologies) و ضرورت آن در مطالعه بیماری‌های عفونی
• 2. آشنایی با مفهوم امیکس ترکیبی (Multi-Omics) و ادغام داده‌های ژنومیک، ترانسکریپتومیک و پروتئومیک
• 3. روش‌های جداسازی سلول‌ها، آماده‌سازی نمونه و پروتکل‌های توالی‌یابی RNA تک‌سلولی (scRNA-seq)
• 4. پیش‌پردازش داده‌های خام تک‌سلولی شامل کنترل کیفیت، فیلتر کردن و حذف سلول‌های مرغوب یا دابلت‌ها
• 5. نرمال‌سازی داده‌ها، کاهش ابزار و شناسایی ژن‌های متغیر در سلول‌های آلوده به پاتوژن
• 6. کاهش ابعاد و الگوریتم‌های خوشه‌بندی سلولی (PCA و UMAP) در شناسایی زیرمجموعه‌های سلول‌های ایمنی
• 7. تشخیص و تفکیک سلول‌های میزبان آلوده از سلول‌های سالم در پاسخ به عفونت‌های ویروسی و باکتریایی
• 8. تحلیل بیان ژن‌های مرتبط با سیستم ایمنی ذاتی و تطبیقی در سطح تک‌سلولی
• 9. روش‌های ردیابی دودمان سلولی (Trajectory Inference) و تحلیل پویایی پاسخ‌های ایمنی
• 10. ادغام داده‌های ترانسکریپتومیک و اپی‌ژنومیک (scATAC-seq) در سلول‌های ایمنی درگیر با عفونت
• 11. تحلیل برهم‌کنش‌های سلول-سلول (Cell-Cell Communication) در ریزمحیط بافت عفونی
• 12. شناسایی پاسخ‌های مولکولی اختصاصی پاتوژن‌ها درون میزبان با روش‌های تک‌سلولی
• 13. تحلیل پروتئومیکس تک‌سلولی و سنجش نشانگرهای سطحی با فناوری‌های سیتومتری جرمی و CITE-seq
• 14. پروفی‌لینگ همزمان رونویسی و پروتئین در سلول‌های منفرد طی پاسخ به عوامل بیماری‌زا
• 15. مدل‌سازی آماری و روش‌های یادگیری ماشین در یکپارچه‌سازی داده‌های چندامیکس تک‌سلولی
• 16. تحلیل پاسخ‌های ایمنی میزبان به عفونت‌های تنفسی و سیستمیک با داده‌های تک‌سلولی
• 17. بررسی ناهمگونی سلولی (Cellular Heterogeneity) و نقش آن در مقاومت دارویی و فرار پاتوژن‌ها
• 18. تشخیص نشانگرهای زیستی جدید برای پیش‌بینی شدت و پیش‌آگهی بیماری‌های عفونی
• 19. تحلیل داده‌های چندامیکس فضایی (Spatial Multi-Omics) و نقش آن در مکان‌یابی عفونت در بافت
• 20. استانداردسازی، مدیریت داده‌های کلان زیستی و ابزارهای بیوانفورماتیکی تخصصی در پایتون و R
• 21. پروژه جامع: تحلیل کامل و یکپارچه داده‌های چندامیکس تک‌سلولی برای شناسایی پاسخ‌های ایمنی میزبان در یک بیماری عفونی فرضی