کتاب صوتی مدل‌سازی فضایی داده‌های تک‌سلولی با رویکرد یادگیری عمیق در زیست‌شناسی محاسباتی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره مدل‌سازی فضایی داده‌های تک‌سلولی با رویکرد یادگیری عمیق در زیست‌شناسی محاسباتی

موضوع کلی: زیست‌فناوری و علوم محاسباتی

موضوع میانی: تحلیل داده‌های بیولوژیکی با استفاده از هوش مصنوعی

📋 سرفصل‌های دوره (100 موضوع)

• 1. مبانی زیست‌شناسی تک‌سلولی و اهمیت داده‌های فضایی
• 2. آشنایی با فناوری‌های توالی‌یابی تک‌سلولی و داده‌های ترانسکریپتومیک
• 3. مقدمه‌ای بر مدل‌سازی محاسباتی در زیست‌شناسی سیستم‌ها
• 4. پیش‌پردازش و کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی تک‌سلولی
• 5. نرمال‌سازی و کاهش نویز در داده‌های بیان ژن
• 6. روش‌های کاهش ابعاد و خوشه‌بندی سلول‌ها
• 7. مبانی یادگیری عمیق در تحلیل داده‌های زیستی
• 8. معماری شبکه‌های عصبی برای داده‌های ساختاریافته بیولوژیکی
• 9. آشنایی با داده‌های فضایی و اهمیت بافت‌شناسی دیجیتال
• 10. پیش‌پردازش تصاویر بافت و استخراج ویژگی‌های مورفولوژیک
• 11. هم‌ترازی داده‌های ترانسکریپتومیک با تصاویر بافتی
• 12. مدل‌های یادگیری عمیق برای قطعه‌بندی سلول‌ها در تصاویر
• 13. تخمین تراکم بیان ژن در فضای دوبعدی بافت
• 14. مدل‌سازی تعاملات سلول-سلول با استفاده از گراف‌های فضایی
• 15. شبکه‌های عصبی گراف (GNN) در تحلیل سازماندهی بافت
• 16. پیش‌بینی موقعیت فضایی سلول‌ها بر اساس پروفایل بیان ژن
• 17. استفاده از مدل‌های مولد (Generative Models) برای داده‌های تک‌سلولی
• 18. تخمین تفاوت‌های بیان ژن در نواحی مختلف بافت
• 19. یکپارچه‌سازی داده‌های چندگانه (Multi-omics) در مدل‌های فضایی
• 20. شناسایی ریزمحیط‌های سلولی با استفاده از یادگیری نظارت‌نشده
• 21. تحلیل مسیرهای سیگنال‌دهی در فضای بافت
• 22. کاربرد هوش مصنوعی در درک سازماندهی ساختاری تومورها
• 23. مدل‌سازی فرآیندهای تمایز سلولی در بافت‌های زنده
• 24. ارزیابی دقت مدل‌های یادگیری عمیق در داده‌های فضایی
• 25. روش‌های بصری‌سازی داده‌های پیچیده فضایی-بیولوژیکی
• 26. چالش‌های محاسباتی در تحلیل داده‌های با ابعاد بالا
• 27. بهینه‌سازی مدل‌های یادگیری عمیق برای پردازش داده‌های حجیم
• 28. کاربرد مدل‌سازی فضایی در مطالعات توسعه‌ای و تکاملی
• 29. بررسی تعاملات بین سلول‌های ایمنی و بافت‌های هدف
• 30. اخلاق در پژوهش‌های زیست‌فناوری و حریم خصوصی داده‌های بیولوژیکی
• 31. آینده‌نگری در توسعه الگوریتم‌های هوش مصنوعی برای زیست‌شناسی محاسباتی
• 32. پروژه‌های عملی و پیاده‌سازی مدل‌های فضایی با پایتون
• 33. تحلیل نهایی و تفسیر بیولوژیکی خروجی‌های مدل