کتاب صوتی اصول بصری‌سازی داده برای نمایش ساختار مولکولی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره اصول بصری‌سازی داده برای نمایش ساختار مولکولی

موضوع کلی: برنامه نویسی

موضوع میانی: بصری‌سازی داده (Data Visualization)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی علم داده
• 2. مقدمه ای بر بصری سازی داده
• 3. اهمیت بصری سازی داده در علم
• 4. چرا بصری سازی داده برای ساختار مولکولی مهم است؟
• 5. تاریخچه بصری سازی داده
• 6. انواع داده ها در بصری سازی
• 7. داده های ساختاری
• 8. داده های مولکولی
• 9. داده های سه بعدی
• 10. انواع نمودارها و گرافیک ها
• 11. نمودارهای اسکنتر (Scatter Plots)
• 12. نمودارهای خطی (Line Charts)
• 13. نمودارهای میله ای (Bar Charts)
• 14. نمودارهای هیستوگرام (Histograms)
• 15. نمودارهای پای (Pie Charts)
• 16. نمودارهای جعبه ای (Box Plots)
• 17. نمودارهای حرارتی (Heatmaps)
• 18. نقشه های درختی (Treemaps)
• 19. نمودارهای شبح (Network Graphs)
• 20. نمودارهای شعاعی (Radial Charts)
• 21. چارت های گانت (Gantt Charts)
• 22. کدهای رنگی (Color Coding)
• 23. استفاده از اندازه (Size Encoding)
• 24. استفاده از شکل (Shape Encoding)
• 25. استفاده از موقعیت (Position Encoding)
• 26. اصول طراحی بصری
• 27. تئوری رنگ در بصری سازی
• 28. تطابق رنگ (Color Harmony)
• 29. پالت های رنگی (Color Palettes)
• 30. خوانایی و وضوح
• 31. سادگی و مینیمالیسم
• 32. کارایی (Efficiency)
• 33. دقت (Accuracy)
• 34. ارتباط (Perception)
• 35. خطاهای بصری رایج
• 36. راه های اجتناب از خطا
• 37. انواع ساختارهای مولکولی
• 38. اتم ها و پیوندها
• 39. مولکول های کوچک
• 40. پروتئین ها
• 41. DNA و RNA
• 42. کربوهیدرات ها
• 43. لیپیدها
• 44. کاربرد بصری سازی در زیست شناسی مولکولی
• 45. تجزیه و تحلیل ساختار پروتئین
• 46. پیش بینی ساختار پروتئین
• 47. تعاملات پروتئین-پروتئین
• 48. طراحی دارو
• 49. شناسایی اهداف دارویی
• 50. مطالعه دینامیک مولکولی
• 51. شبیه سازی مولکولی
• 52. تفسیر نتایج شبیه سازی
• 53. بصری سازی مدل های سه بعدی مولکولی
• 54. نرم افزارهای بصری سازی داده
• 55. معرفی نرم افزارهای عمومی
• 56. معرفی نرم افزارهای تخصصی ساختار مولکولی
• 57. آشنایی با PyMOL
• 58. آشنایی با VMD
• 59. آشنایی با ChimeraX
• 60. آشنایی با NGL Viewer
• 61. یادگیری زبان برنامه نویسی پایتون
• 62. مبانی پایتون
• 63. انواع داده در پایتون
• 64. ساختار کنترل در پایتون
• 65. توابع در پایتون
• 66. مدیریت خطا در پایتون
• 67. کتابخانه های پایتون برای بصری سازی داده
• 68. معرفی Matplotlib
• 69. معرفی Seaborn
• 70. معرفی Plotly
• 71. معرفی Bokeh
• 72. کتابخانه های پایتون برای کار با ساختارهای مولکولی
• 73. معرفی Biopython
• 74. معرفی RDKit
• 75. آشنایی با فرمت های فایل مولکولی (PDB, SDF, Mol2)
• 76. کار با فایل های PDB در پایتون
• 77. کار با فایل های SDF در پایتون
• 78. کار با فایل های Mol2 در پایتون
• 79. تولید نمودارهای دوبعدی از داده های مولکولی
• 80. رسم نمودار پراکندگی (Scatter Plot) از خواص مولکولی
• 81. رسم نمودار خطی برای نمایش تغییرات
• 82. رسم هیستوگرام برای توزیع خواص
• 83. بصری سازی داده های سه بعدی مولکولی
• 84. نمایش اتم ها و پیوندها
• 85. نمایش ساختار ثانویه پروتئین (Alpha Helix, Beta Sheet)
• 86. نمایش سطوح مولکولی (Van der Waals, Solvent Accessible)
• 87. استفاده از کد رنگی برای نمایش ویژگی های مولکولی
• 88. نمایش برهمکنش ها و اتصالات
• 89. بصری سازی دینامیک مولکولی
• 90. انیمیشن سازی مولکولی
• 91. ایجاد اسلایدهای تصویری از ساختارهای مولکولی
• 92. طراحی داشبوردهای تعاملی
• 93. استفاده از Plotly برای داشبوردهای تعاملی
• 94. استفاده از Bokeh برای داشبوردهای تعاملی
• 95. توسعه وب اپلیکیشن برای بصری سازی مولکولی
• 96. کار با JavaScript و کتابخانه های بصری سازی وب
• 97. معرفی Three.js
• 98. معرفی WebGL
• 99. تکنیک های پیشرفته بصری سازی مولکولی
• 100. بصری سازی ساختارهای برهم کنش کننده