فلش‌کارت‌های آموزشی بهینه‌سازی ورک‌فلوهای ژنومیک با GPU

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره بهینه‌سازی ورک‌فلوهای ژنومیک با GPU

موضوع کلی: پردازش موازی و شتاب‌دهنده‌های گرافیکی

موضوع میانی: استفاده از GPU در ژنومیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر محاسبات ژنومیک و GPU
• 2. معماری GPU و کاربردهای آن در ژنومیک
• 3. نصب و پیکربندی ابزارهای توسعه GPU
• 4. بررسی کتابخانه‌های CUDA و OpenCL
• 5. مفاهیم پایه‌ای برنامه‌نویسی موازی
• 6. بهینه‌سازی الگوریتم‌های ژنومیک برای GPU
• 7. هم‌ترازی توالی با استفاده از GPU
• 8. تحلیل تنوع ژنتیکی با استفاده از GPU
• 9. شناسایی جهش‌های تک‌نوکلئوتیدی (SNPs) با GPU
• 10. تحلیل داده‌های RNA-Seq با GPU
• 11. تحلیل داده‌های ChIP-Seq با GPU
• 12. تحلیل داده‌های metagenomics با GPU
• 13. پیش‌پردازش داده‌های ژنومیک برای GPU
• 14. مدیریت حافظه GPU در محاسبات ژنومیک
• 15. بهینه‌سازی انتقال داده بین CPU و GPU
• 16. استفاده از GPU برای ساخت درختان فیلوژنتیک
• 17. مدل‌سازی ساختاری پروتئین با GPU
• 18. شبیه‌سازی مولکولی با استفاده از GPU
• 19. پیش‌بینی ساختار RNA با GPU
• 20. تحلیل شبکه‌های ژنی با GPU
• 21. یادگیری ماشین در ژنومیک با GPU
• 22. دسته‌بندی داده‌های ژنومیک با استفاده از GPU
• 23. خوشه‌بندی داده‌های ژنومیک با GPU
• 24. کاهش ابعاد داده‌های ژنومیک با GPU
• 25. تحلیل مسیرهای متابولیکی با GPU
• 26. پیش‌بینی بیان ژن با GPU
• 27. پیش‌بینی بیماری با استفاده از داده‌های ژنومیک و GPU
• 28. طراحی پرایمر با استفاده از GPU
• 29. آنالیز واریانت‌های ساختاری با GPU
• 30. تحلیل داده‌های ژنومیکس مقایسه‌ای با GPU
• 31. شتاب‌دهی BLAST با GPU
• 32. شتاب‌دهی Smith-Waterman با GPU
• 33. ارزیابی عملکرد الگوریتم‌های GPU در ژنومیک
• 34. مقایسه عملکرد GPU و CPU در تحلیل ژنومیک
• 35. خطایابی و دیباگینگ برنامه‌های GPU
• 36. استفاده از GPU در محاسبات ابری ژنومیک
• 37. بهینه‌سازی مصرف انرژی GPU در ژنومیک
• 38. کاربرد GPU در ژنومیک شخصی
• 39. تحلیل داده‌های ژنومیک در مقیاس بزرگ با GPU
• 40. استفاده از GPU برای تجزیه و تحلیل داده‌های ژنومی بیماران
• 41. مبانی پایگاه داده‌های ژنومیک و GPU
• 42. کاربرد GPU در آنالیز داده‌های ژنومی کشاورزی
• 43. تحلیل داده‌های ژنومیک در تحقیقات دارویی با GPU
• 44. استفاده از GPU برای طراحی داروهای جدید
• 45. تحلیل داده‌های ژنومیک در تحقیقات سرطان با GPU