فلش‌کارت‌های آموزشی ژنومیک با CUDA: از صفر تا قهرمان

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره ژنومیک با CUDA: از صفر تا قهرمان

موضوع کلی: پردازش موازی و شتاب‌دهنده‌های گرافیکی

موضوع میانی: استفاده از GPU در ژنومیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی محاسبات با کارایی بالا
• 2. معماری پردازنده‌های گرافیکی NVIDIA
• 3. معرفی CUDA و ابزارهای توسعه
• 4. نصب و پیکربندی CUDA Toolkit
• 5. برنامه‌نویسی CUDA: هسته‌ها و threadها
• 6. مدیریت حافظه در CUDA
• 7. همگام‌سازی threadها در CUDA
• 8. بهینه‌سازی عملکرد هسته‌های CUDA
• 9. معرفی زبان برنامه‌نویسی C++ برای CUDA
• 10. ساختارهای داده‌ای در CUDA
• 11. الگوریتم‌های مرتب‌سازی موازی با CUDA
• 12. الگوریتم‌های جستجو موازی با CUDA
• 13. مقدمه‌ای بر ژنومیک و داده‌های بزرگ
• 14. فرمت‌های فایل‌های ژنومیک (FASTQ, SAM, BAM)
• 15. همترازسازی توالی با CUDA
• 16. شناسایی واریانت‌های ژنتیکی با CUDA
• 17. تحلیل درخت‌های خانوادگی با CUDA
• 18. محاسبه فراوانی آلل با CUDA
• 19. تحلیل ارتباط ژن‌ها با بیماری‌ها با CUDA
• 20. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در ژنومیک
• 21. شبکه‌های عصبی عمیق با CUDA برای ژنومیک
• 22. خوشه‌بندی داده‌های ژنومیک با CUDA
• 23. کاهش ابعاد داده‌های ژنومیک با CUDA
• 24. پیش‌بینی ساختار پروتئین با CUDA
• 25. شبیه‌سازی مولکولی با CUDA
• 26. تحلیل بیان ژن با CUDA
• 27. تحلیل داده‌های متاژنومیک با CUDA
• 28. تحلیل داده‌های اپی‌ژنومیک با CUDA
• 29. بهینه‌سازی الگوریتم‌های ژنومیک با CUDA
• 30. استفاده از کتابخانه‌های CUDA برای ژنومیک (cuBLAS, cuFFT)
• 31. معرفی پلتفرم‌های ابری برای محاسبات ژنومیک
• 32. استفاده از CUDA در محیط ابری
• 33. پردازش تصاویر میکروسکوپی با CUDA
• 34. تحلیل داده‌های طیف‌سنجی جرمی با CUDA
• 35. تحلیل داده‌های RNA-seq با CUDA
• 36. تحلیل داده‌های ChIP-seq با CUDA
• 37. تحلیل داده‌های whole genome sequencing با CUDA
• 38. تحلیل داده‌های exome sequencing با CUDA
• 39. تحلیل داده‌های single-cell sequencing با CUDA
• 40. برنامه‌نویسی CUDA برای پردازش داده‌های ژنومیک در زمان واقعی
• 41. خطایابی و رفع اشکال در برنامه‌های CUDA ژنومیک
• 42. بهینه‌سازی مصرف انرژی در محاسبات CUDA ژنومیک
• 43. استفاده از CUDA برای تسریع الگوریتم‌های فیلتر کردن داده‌های ژنومیک
• 44. توسعه ابزارهای سفارشی CUDA برای تحلیل ژنومیک
• 45. آینده محاسبات CUDA در ژنومیک