فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل مسیرهای بیولوژیکی: شبکه‌های ژنی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل مسیرهای بیولوژیکی: شبکه‌های ژنی

موضوع کلی: ژنومیک و انقلاب زیستی دیجیتال

موضوع میانی: بیوانفورماتیک (Bioinformatics)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر مسیرهای بیولوژیکی و شبکه‌های ژنی
• 2. اهمیت تحلیل مسیرهای بیولوژیکی در تحقیقات زیستی
• 3. مفاهیم کلیدی در شبکه‌های ژنی: گره‌ها و یال‌ها
• 4. انواع شبکه‌های ژنی: رگولاتوری، فیزیکی، هم‌عباری
• 5. منابع داده برای ساخت شبکه‌های ژنی
• 6. پایگاه‌های داده تعامل پروتئین-پروتئین (PPI)
• 7. پایگاه‌های داده تنظیم بیان ژن (Transcription Factor Binding Sites)
• 8. ادغام داده‌های چندگانه برای ساخت شبکه‌های ژنی
• 9. فرمت‌های رایج شبکه‌های ژنی (SIF, GML, GraphML)
• 10. نرم‌افزارهای بصری‌سازی شبکه‌های ژنی (Cytoscape, Gephi)
• 11. معیارهای مرکزی در شبکه‌های ژنی (Degree, Betweenness, Closeness)
• 12. شناسایی ماژول‌های عملکردی در شبکه‌های ژنی
• 13. الگوریتم‌های خوشه‌بندی شبکه‌های ژنی
• 14. تحلیل زیرشبکه‌ای (Subnetwork Analysis)
• 15. تحلیل غنی‌سازی ژنی (Gene Enrichment Analysis)
• 16. استفاده از آنتولوژی ژن (Gene Ontology) در تحلیل مسیرها
• 17. آنتولوژی مسیرهای کیه‌نو (KEGG Pathway Database)
• 18. پایگاه داده مسیرهای Reactome
• 19. تحلیل مسیرهای دیفرانسیلی بیان ژن (Differential Gene Expression)
• 20. تحلیل مسیرهای مبتنی بر RNA-seq
• 21. تحلیل مسیرهای مبتنی بر مایکروارایه‌ها
• 22. تحلیل مسیرهای مبتنی بر داده‌های پروتئومیکس
• 23. نقش رگولاتورهای بیان ژن در شبکه‌های ژنی
• 24. تحلیل فاکتورهای رونویسی و شبکه‌های رگولاتوری
• 25. شناسایی شبکه تنظیم ژن (Gene Regulatory Network)
• 26. مدل‌سازی ریاضی شبکه‌های ژنی
• 27. معادلات دیفرانسیل در مدل‌سازی شبکه‌های ژنی
• 28. شبیه‌سازی شبکه‌های ژنی
• 29. تحلیل پایداری شبکه‌های ژنی
• 30. تحلیل حساسیت شبکه‌های ژنی
• 31. شبکه‌های ژنی و بیماری‌ها
• 32. شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری‌ها با استفاده از شبکه‌های ژنی
• 33. تحلیل مسیرهای مرتبط با بیماری‌های خاص
• 34. پیش‌بینی پاسخ به درمان با استفاده از شبکه‌های ژنی
• 35. کاربرد شبکه‌های ژنی در دارورسانی (Drug Repurposing)
• 36. تحلیل شبکه‌های ژنی در سرطان
• 37. تحلیل شبکه‌های ژنی در بیماری‌های عصبی
• 38. تحلیل شبکه‌های ژنی در بیماری‌های ایمنی
• 39. تحلیل شبکه‌های ژنی در متابولیسم
• 40. تحلیل شبکه‌های ژنی در تکامل
• 41. تحلیل شبکه‌های ژنی در گیاهان
• 42. تحلیل شبکه‌های ژنی در باکتری‌ها
• 43. تحلیل شبکه‌های ژنی در ویروس‌ها
• 44. تحلیل شبکه‌های ژنی تک‌سلولی (Single-Cell)
• 45. ادغام شبکه‌های ژنی تک‌سلولی
• 46. تحلیل مسیرهای بیولوژیکی در داده‌های فضایی (Spatial Transcriptomics)
• 47. روش‌های یادگیری ماشین در تحلیل شبکه‌های ژنی
• 48. شبکه‌های عصبی در تحلیل شبکه‌های ژنی
• 49. تحلیل شبکه‌های ژنی با استفاده از برنامه‌نویسی پایتون
• 50. تحلیل شبکه‌های ژنی با استفاده از R
• 51. چالش‌ها و محدودیت‌های تحلیل شبکه‌های ژنی
• 52. آینده تحلیل مسیرهای بیولوژیکی و شبکه‌های ژنی