فلش‌کارت‌های آموزشی ساخت درخت‌های فیلولوژنتیک و تحلیل تکاملی داده‌های زیستی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره ساخت درخت‌های فیلولوژنتیک و تحلیل تکاملی داده‌های زیستی

موضوع کلی: زیست‌شناسی تکاملی

موضوع میانی: تحلیل‌های مولکولی و فیلولوژنتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر فیلولوژنی و تکامل
• 2. اهمیت درخت‌های فیلولوژنتیک در زیست‌شناسی
• 3. انواع داده‌های مورد استفاده در فیلولوژنی (DNA، RNA، پروتئین)
• 4. همترازی توالی‌ها: اصول و روش‌ها
• 5. همترازی چندگانه توالی‌ها: الگوریتم‌ها و نرم‌افزارها
• 6. ارزیابی کیفیت همترازی توالی‌ها
• 7. مدل‌های تکاملی: مفاهیم و انواع
• 8. مدل‌های جایگزینی نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی
• 9. انتخاب مدل تکاملی مناسب
• 10. روش‌های فاصله‌محور در ساخت درخت فیلولوژنتیک
• 11. روش‌های اتصال‌گرایی (Joining Methods)
• 12. روش‌های حداکثر صرفه‌جویی (Maximum Parsimony)
• 13. روش‌های احتمال بیشینه (Maximum Likelihood)
• 14. روش‌های بیزی (Bayesian Inference)
• 15. مقایسه روش‌های مختلف ساخت درخت فیلولوژنتیک
• 16. ارزیابی اعتبار درخت فیلولوژنتیک: بوت‌استرپ
• 17. ارزیابی اعتبار درخت فیلولوژنتیک: Jackknife
• 18. ارزیابی اعتبار درخت فیلولوژنتیک: Posterior probabilities
• 19. تحلیل انشعاب‌های درخت فیلولوژنتیک
• 20. بررسی ریشه‌یابی درخت فیلولوژنتیک
• 21. تحلیل هم‌تکامل (Coevolution)
• 22. تحلیل گزینش مثبت و منفی
• 23. شناسایی ژن‌های تحت گزینش
• 24. تحلیل درخت‌های فیلولوژنتیک برای گونه‌های در حال انقراض
• 25. فیلولوژنتیک جمعیت
• 26. فیلولوژنتیک ویروس‌ها
• 27. فیلولوژنتیک باکتری‌ها
• 28. فیلولوژنتیک قارچ‌ها
• 29. فیلولوژنتیک گیاهان
• 30. فیلولوژنتیک جانوران
• 31. نرم‌افزارهای رایج در فیلولوژنتیک: MEGA
• 32. نرم‌افزارهای رایج در فیلولوژنتیک: MrBayes
• 33. نرم‌افزارهای رایج در فیلولوژنتیک: RAxML
• 34. نرم‌افزارهای رایج در فیلولوژنتیک: BEAST
• 35. نرم‌افزارهای رایج در فیلولوژنتیک: PhyML
• 36. تصویرسازی درخت‌های فیلولوژنتیک
• 37. تفسیر درخت‌های فیلولوژنتیک
• 38. کاربردهای فیلولوژنتیک در پزشکی قانونی
• 39. فیلولوژنتیک و ردیابی بیماری‌ها
• 40. تحلیل فیلولوژنتیک متاژنوم‌ها
• 41. فیلولوژنتیک و طبقه‌بندی موجودات زنده
• 42. آینده فیلولوژنتیک: چالش‌ها و فرصت‌ها