فلش‌کارت‌های آموزشی فیلوژنی مبتنی بر فاصله: روش‌ها و کاربردها

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره فیلوژنی مبتنی بر فاصله: روش‌ها و کاربردها

موضوع کلی: زیست‌شناسی تکاملی

موضوع میانی: روش‌های بیوانفورماتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر فیلوژنی و درخت‌های تکاملی
• 2. اهمیت فیلوژنی در علوم زیستی
• 3. فاصله ژنتیکی: تعریف و انواع
• 4. محاسبه فاصله ژنتیکی از داده‌های DNA
• 5. محاسبه فاصله ژنتیکی از داده‌های پروتئین
• 6. مدل‌های تکاملی و تاثیر آن‌ها بر محاسبه فاصله
• 7. روش‌های همسایگی پیوندی (Neighbor-Joining)
• 8. الگوریتم UPGMA: اصول و کاربردها
• 9. تفسیر و ارزیابی درخت‌های حاصل از روش‌های همسایگی پیوندی
• 10. روش‌های مبتنی بر حداقل مربعات (Least Squares)
• 11. روش Fitch-Margoliash: شرح و کاربرد
• 12. روش NeighborNet: شبکه‌های فیلوژنتیک
• 13. مقایسه روش‌های همسایگی پیوندی و حداقل مربعات
• 14. بررسی تاثیر پارامترهای مختلف بر نتایج فیلوژنی
• 15. روش‌های بوت‌استرپ در ارزیابی استحکام درخت‌ها
• 16. استفاده از داده‌های چندگانه (Multilocus) در فیلوژنی
• 17. فیلوژنی مولکولی در مطالعات جمعیت
• 18. کاربرد فیلوژنی در شناسایی گونه‌ها
• 19. فیلوژنی و طبقه‌بندی موجودات زنده
• 20. فیلوژنی و بررسی روابط تکاملی بین ویروس‌ها
• 21. فیلوژنی و مطالعه تاریخچه بیماری‌ها
• 22. تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از نرم‌افزار MEGA
• 23. تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از نرم‌افزار PAUP*
• 24. تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از نرم‌افزار BEAST
• 25. آشنایی با فرمت‌های داده‌های فیلوژنتیک (Nexus, Phylip)
• 26. خطاهای رایج در تحلیل‌های فیلوژنتیک و راه‌های رفع آن‌ها
• 27. نرم‌افزارهای آنلاین برای فیلوژنی مبتنی بر فاصله
• 28. مقدمه‌ای بر فیلوژنی بیزی (Bayesian Phylogeny)
• 29. فیلوژنی مبتنی بر فاصله و داده‌های ژنوم کامل
• 30. کاربرد فیلوژنی در پزشکی قانونی