فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل ژنومیکس با ترنسفورمرها: از تئوری تا کاربرد

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل ژنومیکس با ترنسفورمرها: از تئوری تا کاربرد

موضوع کلی: علوم داده و بیوانفورماتیک

موضوع میانی: یادگیری عمیق در بیوانفورماتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر ترنسفورمرها و کاربردهای آن‌ها در بیوانفورماتیک
• 2. پردازش زبان طبیعی (NLP) و ژنومیکس: شباهت‌ها و تفاوت‌ها
• 3. مبانی معماری ترنسفورمر: Attention Mechanism
• 4. Encoder-Decoder Structure در ترنسفورمرها
• 5. Position Encoding و اهمیت آن در داده‌های ژنومی
• 6. BERT و مشتقات آن: کاربرد در پیش‌بینی توالی DNA
• 7. Transformer-XL و مدل‌سازی وابستگی‌های بلندمدت در ژنوم
• 8. رویکردهای Self-Supervised Learning در ژنومیکس با ترنسفورمرها
• 9. Fine-tuning ترنسفورمرها برای وظایف خاص ژنومی
• 10. پیش‌بینی ساختار پروتئین با استفاده از ترنسفورمرها (AlphaFold و غیره)
• 11. شناسایی مناطق تنظیم‌کننده ژن با ترنسفورمرها
• 12. پیش‌بینی اسپلیسینگ جایگزین با ترنسفورمرها
• 13. تحلیل واریانت‌های ژنتیکی با استفاده از ترنسفورمرها
• 14. تشخیص توالی‌های غیرکدینگ عملکردی با ترنسفورمرها
• 15. مدل‌سازی تعاملات پروتئین-پروتئین با ترنسفورمرها
• 16. پیش‌بینی بیان ژن با استفاده از داده‌های ترنسکریپتومیک و ترنسفورمرها
• 17. ترنسفورمرها در تشخیص بیماری‌های ژنتیکی
• 18. کاربرد ترنسفورمرها در متاژنومیکس
• 19. تحلیل داده‌های تک‌سلولی با استفاده از ترنسفورمرها
• 20. ترنسفورمرها و ایمونواینفورماتیک: پیش‌بینی اپی‌توپ‌ها
• 21. بهینه‌سازی ترنسفورمرها برای داده‌های ژنومی بزرگ
• 22. استفاده از ترنسفورمرها در طراحی دارو
• 23. ترنسفورمرها و CRISPR-Cas9: پیش‌بینی اثرات هدایت‌گر
• 24. تفسیرپذیری مدل‌های ترنسفورمر در بیوانفورماتیک
• 25. چالش‌ها و محدودیت‌های استفاده از ترنسفورمرها در ژنومیکس
• 26. روش‌های ارزیابی و اعتبارسنجی مدل‌های ترنسفورمر
• 27. ابزارهای محبوب و کتابخانه‌های پایتون برای کار با ترنسفورمرها
• 28. پیاده‌سازی یک مدل ترنسفورمر ساده برای یک مسئله ژنومی
• 29. مطالعه موردی: یک پروژه کاربردی تحلیل ژنومیکس با ترنسفورمرها
• 30. آینده ترنسفورمرها در بیوانفورماتیک و ژنومیکس