فلش‌کارت‌های آموزشی آموزش جامع ژنومیک کارکردی و طراحی، تحلیل و اعتبارسنجی غربالگری CRISPR

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره آموزش جامع ژنومیک کارکردی و طراحی، تحلیل و اعتبارسنجی غربالگری CRISPR

موضوع کلی: زیست‌شناسی سیستم‌ها و ژنومیک کارکردی

موضوع میانی: از داده‌های چندامیکی تا طراحی و تحلیل غربالگری CRISPR

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. نقشه راه ژنومیک کارکردی و غربالگری CRISPR
• 2. مفاهیم پایه اتصال ژنوتیپ به فنوتیپ
• 3. ساختار و کیفیت ژنوم‌های مرجع
• 4. پیامدگذاری ژن‌ها و عناصر تنظیمی
• 5. تنوع ژنتیکی و تفسیر اثرات واریانت‌ها
• 6. اصول و کاربردهای RNA-seq
• 7. آماده‌سازی کتابخانه‌های ترنسکریپتوم
• 8. پلتفرم‌های توالی‌یابی نسل جدید
• 9. کنترل کیفیت داده‌های Omics
• 10. هم‌نشانی و یکپارچه‌سازی خوانش‌ها
• 11. اندازه‌گیری بیان و تراکم ژن
• 12. آزمون بیان متفاوت
• 13. کشف آیزوفرم و انتخاب بدیل
• 14. تحلیل بیان آللی
• 15. شناسایی RNAهای غیرکدکننده
• 16. رمزگذاری حالت‌های سلولی در بیان ژن
• 17. اصول Single-cell RNA-seq
• 18. پیش‌پردازش و کنترل کیفیت سلول‌ها
• 19. دستهبندی و خوشه‌بندی سلول‌ها
• 20. برچسب‌گذاری نوع سلول
• 21. تحلیل مسیر حرکت سلولی
• 22. هم‌نشانی و یکپارچه‌سازی مجموعه‌داده‌ها
• 23. ترنسکریپتومیک فضایی
• 24. ATAC-seq و دسترس‌پذیری کروماتین
• 25. ChIP-seq و نقشه‌گذاری اتصال فاکتورهای رونویسی
• 26. اپی‌ژنومیک و متیلاسیون DNA
• 27. سازوکار سه‌بعدی کروموزوم
• 28. ادغام چندلایه‌ای داده‌های Omics
• 29. ترتیب پروتئومیک در تفسیر کارکرد ژن
• 30. متابولومیک و اتصال ژنوتیپ به فنوتیپ
• 31. ساخت شبکه‌های مولکولی
• 32. استنباط علی در داده‌های پیچیده
• 33. منابع داده و پایگاه‌های اطلاعاتی
• 34. یکپارچه‌سازی داده‌ها در چارچوب زیست‌شناسی سیستم‌ها
• 35. اصول طراحی آزمایش‌های ژنومیک کارکردی
• 36. نمونه‌گیری زیستی و تکرارها
• 37. برآورد توان آماری و اندازه اثر
• 38. معماری سامانه‌های CRISPR
• 39. انتخاب نوکلئاز و واریانت‌های Cas
• 40. طراحی راهنمای CRISPR
• 41. پیش‌بینی و کاهش اثرات خارج‌هدف
• 42. روش‌های تحویل CRISPR به سلول
• 43. طراحی کتابخانه‌های راهنما
• 44. معماری و پوشش کتابخانه‌های غربالگری
• 45. کنترل‌های مثبت و منفی در غربالگری
• 46. انتخاب مدل سلولی مناسب
• 47. تنظیم زمان و دوز اختلال ژنتیکی
• 48. اصول غربالگری تجمیعی
• 49. طراحی خوانش‌های فنوتیپی
• 50. غربالگری مبتنی بر فلوسایتومتری
• 51. تصویربرداری سلولی و پردازش خودکار
• 52. سنجش بقای سلول‌ها
• 53. بررسی پاسخ به دارو و مقاومت دارویی
• 54. بهینه‌سازی آلودگی و نسبت راهنما به سلول
• 55. غربالگری CRISPR در سطح تک‌سلول
• 56. اصول Perturb-seq
• 57. کاربرد CROP-seq در اتصال اختلال و بیان
• 58. CRISPRi برای سرکوب دقیق بیان
• 59. CRISPRa برای فعال‌سازی بیان
• 60. غربالگری حذف ژن با Cas9
• 61. ویرایش پایه برای ایجاد تغییرات نقطه‌ای
• 62. ویرایش پرایم برای جابه‌جایی‌های دقیق نوکلئوتیدی
• 63. ویرایش اپی‌ژنتیکی و تنظیم بدون تغییر توالی
• 64. غربالگری‌های ترکیبی و چندرشته‌ای
• 65. استخراج DNA و RNA از نمونه‌های اختلال‌یافته
• 66. ساخت کتابخانه توالی‌یابی برای غربالگری
• 67. ردیابی راهنماها در هر نمونه
• 68. پیش‌پردازش داده‌های کتابخانه CRISPR
• 69. ساخت و اعتبارسنجی ماتریس شمارش راهنماها
• 70. کنترل کیفیت راهنماها و سلول‌ها
• 71. آمار سطح راهنما برای غربالگری‌های تجمیعی
• 72. آزمون‌های سطح ژن برای شناسایی برنده‌ها
• 73. تحلیل مجموعه‌ژنی و مسیرهای زیستی
• 74. اصلاح اثر دسته‌ای و تکنیکال
• 75. مدل‌سازی مخدوش‌کننده‌ها و اثرات سلولی
• 76. اصلاح آزمون‌های چندگانه و کنترل FDR
• 77. رتبه‌بندی و اولویت‌بندی برنده‌های بالقوه
• 78. تفسیر برنده‌ها در شبکه‌های مولکولی
• 79. کاربرد یادگیری ماشین در پیش‌بینی برنده‌ها
• 80. اعتبارسنجی مستقل برنده‌های غربالگری
• 81. استفاده از راهنماهای مستقل برای تأیید علت‌مندی
• 82. آزمایش‌های Rescue برای اثبات اختصاصی بودن اثر
• 83. بررسی وابستگی دوز و زمان
• 84. تأیید اثرات خارج‌هدف و تکرارپذیری
• 85. اعمال غربالگری در مدل‌های in vivo
• 86. استفاده از اورگانوئید و سلول‌های اولیه
• 87. از یافته‌های غربالگری تا کاربرد بالینی
• 88. اصول Reproducible Research در ژنومیک
• 89. گزارش‌دهی استاندارد داده‌ها و کدها
• 90. ملاحظات اخلاقی و ایمنی ویرایش ژن
• 91. طراحی پروژه پایانی از سؤال زیستی تا نتیجه معتبر