فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل توالی‌های زیستی و تکامل مولکولی: از تئوری تا عمل

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل توالی‌های زیستی و تکامل مولکولی: از تئوری تا عمل

موضوع کلی: زیست‌شناسی مولکولی

موضوع میانی: تکامل مولکولی و بیوانفورماتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر تکامل مولکولی و اهمیت آن
• 2. مفاهیم پایه در زیست‌شناسی مولکولی برای تحلیل توالی
• 3. نظریه تکامل و مبانی ژنتیکی آن
• 4. جهش‌ها و نرخ جهش در ژنوم
• 5. جانشینی نوکلئوتیدی و اسید آمینه
• 6. الگوریتم‌های هم‌ترازی توالی: نیاز و انواع
• 7. هم‌ترازی جفتی توالی: الگوریتم نیازمن و اسمیت-واترمن
• 8. ماتریس‌های جایگزینی: PAM و BLOSUM
• 9. هم‌ترازی چندگانه توالی: روش‌ها و چالش‌ها
• 10. درخت‌های فیلوژنتیکی: مفاهیم و اصول
• 11. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیکی: UPGMA، Neighbor-Joining
• 12. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیکی: Maximum Parsimony
• 13. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیکی: Maximum Likelihood
• 14. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیکی: Bayesian Inference
• 15. ارزیابی و اعتبار سنجی درخت‌های فیلوژنتیکی
• 16. تحلیل Bootstrap و Jackknife
• 17. تکامل ژن‌ها و پروتئین‌ها: مدل‌ها و مفاهیم
• 18. مدل‌های تکامل مولکولی: Jukes-Cantor, Kimura 2-parameter
• 19. مدل‌های تکامل مولکولی: GTR
• 20. انتخاب مدل تکاملی مناسب با استفاده از آزمون‌های آماری
• 21. تحلیل انتخاب طبیعی در توالی‌های DNA و پروتئین
• 22. شناسایی نواحی تحت انتخاب مثبت و منفی
• 23. بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت‌ها
• 24. تحلیل Haplotyping و linkage disequilibrium
• 25. تحلیل جمعیت با استفاده از نشانگرهای مولکولی
• 26. نقش نوترکیبی در تنوع ژنتیکی
• 27. تکامل ژنوم: تکرارها، جابجایی‌ها و تغییرات ساختاری
• 28. تحلیل مقایسه‌ای ژنوم‌ها
• 29. شناسایی ژن‌های همولوگ و پارالوگ
• 30. تحلیل عملکردی ژن‌ها و پروتئین‌ها
• 31. بررسی تغییرات در رگولاتوری ژن
• 32. مقدمه‌ای بر متاژنومیک و تحلیل داده‌های Next-Generation Sequencing
• 33. تحلیل داده‌های RNA-Seq و بررسی بیان ژن
• 34. تحلیل داده‌های ChIP-Seq و شناسایی مناطق اتصال پروتئین
• 35. تحلیل داده‌های Whole Genome Sequencing
• 36. شناسایی تغییرات تک‌نوکلئوتیدی (SNPs) و Indels
• 37. تحلیل واریانت‌های ساختاری در ژنوم
• 38. کاربرد تحلیل توالی در تشخیص بیماری‌های ژنتیکی
• 39. کاربرد تحلیل توالی در داروشناسی و پزشکی شخصی
• 40. تحلیل توالی در تحقیقات تکاملی و شناسایی گونه‌ها
• 41. تحلیل توالی در تشخیص مقاومت آنتی‌بیوتیکی
• 42. مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک و پایگاه‌های داده توالی
• 43. استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی رایگان و تجاری
• 44. تحلیل توالی‌های غیرکدشونده RNA (microRNA, lncRNA)
• 45. تحلیل توالی پروتئین‌ها و پیش‌بینی ساختار آن‌ها
• 46. پیش‌بینی ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها
• 47. تحلیل عملکرد پروتئین‌ها با استفاده از homology modeling
• 48. تحلیل پروتئین‌های غشایی و پیش‌بینی توپولوژی آن‌ها
• 49. تحلیل توالی‌های ویروسی و بررسی تکامل آن‌ها
• 50. تحلیل توالی‌های باکتریایی و بررسی مقاومت آنتی‌بیوتیکی
• 51. تحلیل توالی‌های قارچی و بررسی پاتوژنیسیته آن‌ها
• 52. تحلیل توالی‌های گیاهی و بررسی سازگاری با محیط
• 53. تحلیل توالی‌های جانوری و بررسی تنوع ژنتیکی
• 54. بررسی اثرات جهش‌های خاص بر عملکرد پروتئین
• 55. تحلیل توالی‌های توالی‌های CRISPR/Cas9