فلش‌کارت‌های آموزشی شناسایی پاتوژن‌ها با متا ترانسکریپتومیکس: از داده تا تشخیص

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره شناسایی پاتوژن‌ها با متا ترانسکریپتومیکس: از داده تا تشخیص

موضوع کلی: علوم زیستی

موضوع میانی: میکروبیولوژی و ژنتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر متا ترانسکریپتومیکس و کاربردهای آن در تشخیص پاتوژن
• 2. مفاهیم کلیدی در ترانسکریپتومیکس و تفاوت آن با سایر روش‌های omics
• 3. مزیای متا ترانسکریپتومیکس نسبت به روش‌های سنتی تشخیص پاتوژن
• 4. نمونه‌برداری مناسب برای متا ترانسکریپتومیکس در محیط‌های مختلف
• 5. استخراج RNA از نمونه‌های محیطی پیچیده
• 6. آماده‌سازی کتابخانه cDNA برای متا ترانسکریپتومیکس
• 7. توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و انتخاب پلتفرم مناسب
• 8. کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی
• 9. پیش‌پردازش داده‌های ترانسکریپتومیک: حذف آداپتورها و فیلتر کردن داده‌ها
• 10. هم‌ترازی (Alignment) داده‌های ترانسکریپتومیک به ژنوم‌های مرجع
• 11. تخمین فراوانی ترانسکریپت‌ها
• 12. شناسایی پاتوژن‌ها بر اساس پروفایل‌های بیان ژن
• 13. تحلیل تفاضلی بیان ژن برای شناسایی پاتوژن‌های فعال
• 14. استفاده از پایگاه‌های داده ژنومی برای شناسایی پاتوژن‌ها
• 15. بررسی تنوع ژنتیکی پاتوژن‌ها از طریق متا ترانسکریپتومیکس
• 16. شناسایی ژن‌های مقاومت به آنتی‌بیوتیک در محیط‌های مختلف
• 17. تحلیل مسیرهای متابولیکی پاتوژن‌ها با استفاده از متا ترانسکریپتومیکس
• 18. شناسایی ویروس‌های جدید و نوظهور
• 19. کاربرد متا ترانسکریپتومیکس در تشخیص بیماری‌های عفونی در انسان
• 20. کاربرد متا ترانسکریپتومیکس در تشخیص بیماری‌های عفونی در دام
• 21. کاربرد متا ترانسکریپتومیکس در تشخیص بیماری‌های گیاهی
• 22. مطالعه میکروبیوم انسانی با استفاده از متا ترانسکریپتومیکس
• 23. شناسایی نشانگرهای زیستی (Biomarkers) برای تشخیص پاتوژن‌ها
• 24. تحلیل داده‌های متا ترانسکریپتومیک با استفاده از زبان برنامه‌نویسی R
• 25. تحلیل داده‌های متا ترانسکریپتومیک با استفاده از پایپ‌لاین‌های آماده
• 26. تصویرسازی داده‌های متا ترانسکریپتومیک
• 27. تفسیر نتایج متا ترانسکریپتومیک و ارائه گزارش
• 28. محدودیت‌های متا ترانسکریپتومیکس و راهکارهای غلبه بر آن‌ها
• 29. کنترل‌های کیفی و اعتبارسنجی نتایج
• 30. متا ترانسکریپتومیکس و اخلاق زیستی
• 31. آینده متا ترانسکریپتومیکس در تشخیص پاتوژن‌ها
• 32. مطالعات موردی: شناسایی پاتوژن‌های ناشناخته در یک شیوع بیماری
• 33. تکنیک‌های پیشرفته در متا ترانسکریپتومیکس: single-cell metatranscriptomics
• 34. متا ترانسکریپتومیکس و هوش مصنوعی