فلش‌کارت‌های آموزشی فیلژنومیکس: بازسازی تاریخچهٔ تکامل

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره فیلژنومیکس: بازسازی تاریخچهٔ تکامل

موضوع کلی: زیست‌شناسی تکاملی

موضوع میانی: ژنتیک تکاملی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر فیلژنومیکس و جایگاه آن در زیست‌شناسی تکاملی
• 2. تکامل درخت‌های فیلوژنتیک: از روش‌های سنتی تا فیلژنومیکس
• 3. مفاهیم کلیدی در فیلژنومیکس: ژن، لوکوس، تبار
• 4. انتخاب داده‌های ژنومی مناسب برای تحلیل فیلژنتیک
• 5. همترازی توالی‌های ژنومی: چالش‌ها و راهکارها
• 6. روش‌های همترازی چندتوالی (MSA)
• 7. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک: فاصله-محور
• 8. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک: بیشینه صرفه‌جویی (Maximum Parsimony)
• 9. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک: حداکثر درست‌نمایی (Maximum Likelihood)
• 10. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک: بیزی (Bayesian Inference)
• 11. ارزیابی اعتبار درخت‌های فیلوژنتیک: بوت‌استرپ
• 12. ارزیابی اعتبار درخت‌های فیلوژنتیک: Jackknife
• 13. ارزیابی اعتبار درخت‌های فیلوژنتیک: Bayesian posterior probabilities
• 14. مقدمه‌ای بر مدل‌های تکاملی
• 15. مدل‌های جایگزینی نوکلئوتیدی: Jukes-Cantor، Kimura 2-parameter، GTR
• 16. مدل‌های نرخ تکامل متغیر در طول زمان
• 17. مدل‌های تکامل آمینو اسید
• 18. شناسایی ژن‌های تحت انتخاب مثبت
• 19. تحلیل ژن‌های تحت انتخاب طبیعی
• 20. فیلژنومیکس جمعیت: بررسی تنوع ژنتیکی درون‌گونه‌ای
• 21. فیلژنومیکس جمعیت: شناسایی ساختار جمعیتی
• 22. بررسی ریشه‌زایی (rooting) درختان فیلوژنتیک
• 23. فیلژنومیکس و گونه‌زایی (Speciation)
• 24. فیلژنومیکس و بیوژرافی (Biogeography)
• 25. فیلژنومیکس و همه‌گیرشناسی (Epidemiology)
• 26. فیلژنومیکس و کشف دارو
• 27. فیلژنومیکس و اصلاح نباتات
• 28. کاربرد فیلژنومیکس در بررسی تکامل ویروس‌ها
• 29. تحلیل‌های کل‌ژنومی (Genome-wide analysis)
• 30. کاربرد داده‌های ژنومی کلان (Big Genomic Data) در فیلژنومیکس
• 31. ابزارهای نرم‌افزاری رایج در فیلژنومیکس: RAxML
• 32. ابزارهای نرم‌افزاری رایج در فیلژنومیکس: MrBayes
• 33. ابزارهای نرم‌افزاری رایج در فیلژنومیکس: BEAST
• 34. ابزارهای نرم‌افزاری رایج در فیلژنومیکس: IQ-TREE
• 35. تجسم و تفسیر درخت‌های فیلوژنتیک
• 36. تحلیل شبکه های فیلژنتیک
• 37. فیلژنومیکس و متاژنومیکس
• 38. فیلژنومیکس و ترانسکرپتومیکس
• 39. اصول طراحی مطالعه فیلژنومیک
• 40. چالش‌های محاسباتی در فیلژنومیکس
• 41. تفسیر نتایج فیلژنومیک و ارائه گزارش
• 42. اخلاق در فیلژنومیکس و حفاظت از داده‌ها