فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی با تئوری گراف

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی با تئوری گراف

موضوع کلی: علوم زیستی

موضوع میانی: بیوانفورماتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر تئوری گراف و کاربردهای آن در زیست‌شناسی
• 2. شبکه‌های بیولوژیکی: انواع و ویژگی‌ها
• 3. نمایش داده‌های بیولوژیکی به صورت گراف
• 4. مفاهیم پایه تئوری گراف: راس، یال، مسیر، دور
• 5. درجه راس و توزیع درجه در شبکه‌های بیولوژیکی
• 6. انواع گراف‌ها: جهت‌دار، غیرجهت‌دار، وزن‌دار
• 7. ماتریس مجاورت و لیست مجاورت
• 8. مرکزیت در شبکه‌ها: درجه مرکزیت
• 9. مرکزیت بینابینی (Betweenness Centrality)
• 10. مرکزیت نزدیکی (Closeness Centrality)
• 11. مرکزیت بردار ویژه (Eigenvector Centrality)
• 12. تشخیص هاب‌ها (Hubs) و بطری‌گردن‌ها (Bottlenecks)
• 13. جامعه‌بندی شبکه‌ها (Community Detection)
• 14. الگوریتم Louvain برای جامعه‌بندی
• 15. الگوریتم Leiden برای جامعه‌بندی
• 16. مدل‌های تصادفی شبکه‌ها: مدل Erdos-Renyi
• 17. مدل‌های ترجیحی اتصال (Preferential Attachment)
• 18. شبکه‌های مقیاس‌ناپذیر (Scale-Free Networks)
• 19. ماژولاریتی و ارزیابی کیفیت جامعه‌بندی
• 20. شبکه‌های تعامل پروتئین-پروتئین (PPI)
• 21. شبکه‌های تنظیم ژن (Gene Regulatory Networks)
• 22. شبکه‌های متابولیکی (Metabolic Networks)
• 23. شبکه‌های انتقال بیماری (Disease Networks)
• 24. تحلیل مسیرها (Pathways) در شبکه‌های بیولوژیکی
• 25. جستجوی کوتاه‌ترین مسیر
• 26. تحلیل زیرگراف‌ها (Subgraphs) و موتیف‌ها (Motifs)
• 27. کاربرد تئوری گراف در کشف دارو
• 28. پیش‌بینی تعاملات ژن و پروتئین
• 29. تحلیل شبکه‌های هم‌تنظیمی (Co-expression Networks)
• 30. شبکه‌های فیلوژنتیک و تئوری گراف
• 31. تحلیل شبکه‌های غذایی (Food Webs)
• 32. تحلیل شبکه‌های میکروبی (Microbial Networks)
• 33. تحلیل شبکه‌های عصبی (Neural Networks)
• 34. استفاده از گراف‌ها در مدل‌سازی سیستم‌های بیولوژیکی
• 35. مقدمه‌ای بر الگوریتم‌های گراف برای مسائل بیولوژیکی
• 36. تحلیل شبکه‌های پویا (Dynamic Networks)
• 37. شبکه‌های چندلایه‌ای (Multilayer Networks)
• 38. ابزارهای نرم‌افزاری برای تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی: Cytoscape
• 39. ابزارهای نرم‌افزاری برای تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی: Gephi
• 40. ابزارهای نرم‌افزاری برای تحلیل شبکه‌های بیولوژیکی: NetworkX
• 41. آینده تئوری گراف در بیولوژی و بیوانفورماتیک
• 42. مطالعه موردی: تحلیل شبکه سرطان
• 43. مطالعه موردی: تحلیل شبکه ایمنی