فلش‌کارت‌های آموزشی فیلوانفورماتیک: تحلیل تکاملی و تنوع زیستی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره فیلوانفورماتیک: تحلیل تکاملی و تنوع زیستی

موضوع کلی: علوم زیستی و محاسباتی

موضوع میانی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر فیلوانفورماتیک و بیوانفورماتیک
• 2. مفاهیم پایه درختان تکاملی
• 3. روش‌های ساخت درختان فیلوژنتیک: فاصله‌محور
• 4. روش‌های ساخت درختان فیلوژنتیک: حداکثر صرفه‌جویی
• 5. روش‌های ساخت درختان فیلوژنتیک: احتمال بیشینه
• 6. ارزیابی و اعتبارسنجی درختان فیلوژنتیک
• 7. معیارهای ارزیابی درختان تکاملی
• 8. بوت‌استرپ و روش‌های نمونه‌برداری مجدد
• 9. تحلیل هم‌راستایی توالی‌ها
• 10. الگوریتم‌های هم‌راستایی چندگانه توالی
• 11. نرم‌افزارهای هم‌راستایی توالی: Muscle، ClustalW، MAFFT
• 12. مقدمه‌ای بر تبارشناسی مولکولی
• 13. نقش مارکرهای مولکولی در تبارشناسی
• 14. DNA میتوکندریایی و تبارشناسی پستانداران
• 15. مارکرهای مولکولی در تبارشناسی گیاهان
• 16. تحلیل تنوع ژنتیکی با استفاده از میکروساتلایت‌ها
• 17. تحلیل تنوع ژنتیکی با استفاده از SNPها
• 18. مفاهیم پایه تنوع زیستی
• 19. اندازه‌گیری تنوع زیستی: شاخص‌های آلفا، بتا و گاما
• 20. بررسی الگوهای تنوع زیستی در مقیاس‌های مختلف
• 21. نقش فیلوانفورماتیک در حفاظت از تنوع زیستی
• 22. تحلیل فیلوژنتیک برای شناسایی گونه‌های در معرض خطر
• 23. بررسی اثرات تغییرات آب و هوایی بر تنوع زیستی با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 24. تحلیل جغرافیایی جمعیت‌ها با استفاده از داده‌های مولکولی
• 25. مقدمه‌ای بر بیوگرافی و پراکندگی گونه‌ها
• 26. تحلیل مسیرهای مهاجرت گونه‌ها با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 27. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی منشاء و تکامل بیماری‌ها
• 28. شناسایی میزبان‌های اصلی بیماری‌زاها با استفاده از درختان تکاملی
• 29. بررسی تکامل مقاومت آنتی‌بیوتیکی در باکتری‌ها
• 30. تحلیل ژنوم مقایسه‌ای
• 31. شناسایی ژن‌های کلیدی در فرآیندهای تکاملی
• 32. بررسی تغییرات ساختاری ژنوم با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 33. مقدمه‌ای بر متاژنومیک و فیلوانفورماتیک
• 34. تحلیل داده‌های متاژنومی برای بررسی تنوع میکروبی
• 35. شناسایی ژن‌های عملکردی در متاژنوم‌ها
• 36. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی روابط بین میکروارگانیسم‌ها
• 37. کاربرد فیلوانفورماتیک در اکولوژی مولکولی
• 38. بررسی تعاملات بین گونه‌ها با استفاده از داده‌های مولکولی
• 39. تحلیل شبکه‌های غذایی با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 40. مقدمه‌ای بر سیستماتیک یکپارچه
• 41. ترکیب داده‌های مورفولوژیک و مولکولی در تحلیل‌های تکاملی
• 42. تحلیل داده‌های ژنومیکس و ترنسکریپتومیکس
• 43. مفاهیم پایه داده‌های RNA-seq
• 44. تحلیل بیان ژن با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 45. تحلیل داده‌های ChIP-seq
• 46. شناسایی مناطق تنظیم‌کننده ژن با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 47. مقدمه‌ای بر طراحی آزمایش‌های فیلوانفورماتیکی
• 48. انتخاب مارکرهای مولکولی مناسب
• 49. بهینه‌سازی شرایط PCR و توالی‌یابی
• 50. تحلیل و تفسیر داده‌های فیلوانفورماتیکی
• 51. مقدمه‌ای بر پایگاه‌های داده فیلوانفورماتیکی
• 52. NCBI، GenBank، EMBL
• 53. TreeBASE و PhyloTree
• 54. نرم‌افزارهای پیشرفته فیلوانفورماتیکی: BEAST، MrBayes
• 55. تحلیل درختان بزرگ با استفاده از روش‌های محاسباتی
• 56. بررسی اثرات نرخ تکامل متفاوت بر درختان فیلوژنتیک
• 57. مقدمه‌ای بر مدل‌های تکاملی
• 58. مدل‌های جایگزینی نوکلئوتیدی
• 59. مدل‌های تکامل پروتئین
• 60. بررسی اثرات انتخاب طبیعی بر درختان فیلوژنتیک
• 61. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی تکامل صفات کمی
• 62. مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک ساختاری
• 63. تحلیل ساختار پروتئین‌ها با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 64. پیش‌بینی ساختار پروتئین‌ها با استفاده از همولوژی
• 65. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی تکامل ساختار RNA
• 66. مقدمه‌ای بر علم ژنوم تطبیقی
• 67. شناسایی ژن‌های سازگار شده با محیط
• 68. تحلیل ژنوم تطبیقی در جمعیت‌های مختلف
• 69. بررسی اثرات انتخاب جهت‌دار بر ژنوم
• 70. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی تکامل مسیرهای متابولیکی
• 71. شناسایی ژن‌های مرتبط با متابولیسم در گونه‌های مختلف
• 72. بررسی تکامل آنزیم‌ها با استفاده از فیلوانفورماتیک
• 73. کاربرد فیلوانفورماتیک در کشاورزی و اصلاح نباتات
• 74. شناسایی ژن‌های مرتبط با صفات مطلوب در گیاهان
• 75. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی تکامل مقاومت به آفات و بیماری‌ها
• 76. تحلیل فیلوژنتیک برای بررسی منشاء و تکامل ویروس‌ها
• 77. شناسایی میزبان‌های اصلی ویروس‌ها با استفاده از درختان تکاملی
• 78. بررسی تکامل ویروس‌های مقاوم به دارو
• 79. مقدمه‌ای بر داده‌کاوی و یادگیری ماشین در فیلوانفورماتیک
• 80. استفاده از الگوریتم‌های یادگیری ماشین برای طبقه‌بندی گونه‌ها
• 81. پیش‌بینی روابط فیلوژنتیک با استفاده از داده‌کاوی
• 82. تحلیل داده‌های بزرگ فیلوانفورماتیکی با استفاده از محاسبات ابری
• 83. مفاهیم پایه امنیت داده در فیلوانفورماتیک
• 84. حفاظت از داده‌های ژنتیکی و اطلاعات شخصی
• 85. رعایت ملاحظات اخلاقی در استفاده از داده‌های فیلوانفورماتیکی