فلش‌کارت‌های آموزشی روش‌های پیشرفته تحلیل غنی‌سازی فاکتورهای رونویسی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره روش‌های پیشرفته تحلیل غنی‌سازی فاکتورهای رونویسی

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های ژنومیکس

موضوع میانی: تحلیل بیان ژن و تنظیم‌کننده‌های ژنی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک و ژنومیکس
• 2. بانک‌های داده ژنومیکس و دسترسی به آن‌ها
• 3. فرمت‌های داده‌های بیان ژن (Microarray و RNA-seq)
• 4. پیش‌پردازش داده‌های RNA-seq
• 5. نرم‌افزارهای رایج برای تحلیل RNA-seq
• 6. طراحی آزمایش‌های RNA-seq
• 7. نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن
• 8. شناسایی ژن‌های با بیان متفاوت (Differential Gene Expression)
• 9. روش‌های آماری تصحیح چندآزمونی (Multiple Testing Correction)
• 10. مقدمه‌ای بر فاکتورهای رونویسی
• 11. ساختار و عملکرد فاکتورهای رونویسی
• 12. بانک‌های داده فاکتورهای رونویسی
• 13. مجموعه‌های جایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی (Transcription Factor Binding Sites -TFBS)
• 14. روش‌های پیش‌بینی جایگاه‌های اتصال فاکتورهای رونویسی
• 15. تحلیل غنی‌سازی فاکتورهای رونویسی: اصول و مبانی
• 16. مقدمه‌ای بر روش‌های تحلیل غنی‌سازی (Enrichment Analysis)
• 17. نرم‌افزار MEME: تحلیل Motif
• 18. نرم‌افزار HOMER: تحلیل غنی‌سازی
• 19. نرم‌افزار JASPAR: پایگاه داده فاکتورهای رونویسی
• 20. تحلیل غنی‌سازی با استفاده از پایگاه داده TRANSFAC
• 21. تحلیل مسیرهای سیگنالینگ (Pathway Analysis)
• 22. ادغام تحلیل بیان ژن و تحلیل مسیرهای سیگنالینگ
• 23. تحلیل شبکه‌های تنظیم‌کننده ژنی (Gene Regulatory Networks)
• 24. مقدمه‌ای بر شبکه‌های تنظیم‌کننده ژنی
• 25. نرم‌افزارهای تحلیل شبکه‌های تنظیم‌کننده ژنی
• 26. تحلیل هم‌تنظیمی ژن‌ها (Co-expression Analysis)
• 27. روش‌های خوشه‌بندی (Clustering) برای تحلیل بیان ژن
• 28. تحلیل بیان ژن در شرایط مختلف استرس
• 29. تحلیل بیان ژن در پاسخ به داروها
• 30. تحلیل بیان ژن در بیماری‌های ژنتیکی
• 31. تحلیل بیان ژن در سرطان
• 32. تحلیل بیان ژن در سلول‌های بنیادی
• 33. تحلیل بیان ژن در تکامل
• 34. تحلیل بیان ژن در ایمونولوژی
• 35. تحلیل بیان ژن در کشاورزی
• 36. تحلیل بیان ژن در میکروبیولوژی
• 37. تحلیل بیان ژن در علوم اعصاب
• 38. تحلیل بیان ژن در زیست‌شناسی گیاهی
• 39. تحلیل بیان ژن در زیست‌شناسی دریایی
• 40. تحلیل بیان ژن در زیست‌فناوری
• 41. تحلیل بیان ژن و اپی‌ژنتیک
• 42. مقدمه‌ای بر اپی‌ژنتیک
• 43. تحلیل متیلاسیون DNA
• 44. تحلیل تغییرات هیستونی
• 45. تحلیل RNAهای غیرکدشونده (Non-coding RNAs)
• 46. کاربرد هوش مصنوعی در تحلیل بیان ژن
• 47. یادگیری ماشین و پیش‌بینی بیان ژن
• 48. تحلیل داده‌های تک‌سلولی (Single-cell RNA-seq)
• 49. مقدمه‌ای بر داده‌های تک‌سلولی
• 50. تحلیل واریانس در داده‌های تک‌سلولی
• 51. خوشه‌بندی سلول‌ها در داده‌های تک‌سلولی
• 52. تحلیل مسیرهای سلولی در داده‌های تک‌سلولی
• 53. تصویربرداری و تحلیل بیان ژن در بافت (In situ Hybridization)
• 54. مقدمه‌ای بر تصویربرداری و تحلیل بیان ژن
• 55. تحلیل داده‌های میکروسکوپی
• 56. تحلیل داده‌های ایمنی‌شناسی محاسباتی
• 57. تحلیل داده‌های فارماکوژنومیک
• 58. تحلیل داده‌های متابولومیک
• 59. تحلیل داده‌های پروتئومیک و ارتباط آن با بیان ژن
• 60. اعتبارسنجی نتایج تحلیل بیان ژن (Validation)
• 61. طراحی آزمایش‌های اعتبارسنجی
• 62. روش‌های PCR کمی (Quantitative PCR)
• 63. روش‌های Western Blotting
• 64. روش‌های ایمونوفلورسانس (Immunofluorescence)
• 65. نگارش گزارش‌های علمی در زمینه تحلیل بیان ژن
• 66. اخلاق در تحلیل داده‌های ژنومیکس
• 67. محافظت از حریم خصوصی داده‌ها
• 68. استفاده مسئولانه از داده‌های ژنومیکس