فلش‌کارت‌های آموزشی ابزارهای زیست‌اطلاعاتی برای کشف ژنومی: از داده‌های خام تا تفسیر بیولوژیکی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره ابزارهای زیست‌اطلاعاتی برای کشف ژنومی: از داده‌های خام تا تفسیر بیولوژیکی

موضوع کلی: زیست‌شناسی محاسباتی و داده‌کاوی

موضوع میانی: تحلیل داده‌های ژنومی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر زیست‌اطلاعاتی و ژنومیک
• 2. بانک‌های داده ژنومی: منابع و دسترسی
• 3. فرمت‌های داده‌های ژنومی: FASTA, GenBank, GFF
• 4. کنترل کیفیت داده‌های ژنومی
• 5. همترازسازی توالی: اصول و الگوریتم‌ها
• 6. همترازسازی توالی: BLAST و مشتقات آن
• 7. همترازسازی توالی: الگوریتم‌های Smith-Waterman و Needleman-Wunsch
• 8. همترازسازی توالی: همترازسازی چندگانه
• 9. شناسایی ژن‌ها: پیش‌بینی ژن در ژنوم
• 10. شناسایی ژن‌ها: روش‌های مبتنی بر شواهد
• 11. شناسایی ژن‌ها: روش‌های مبتنی بر مدل‌های آماری
• 12. آنوتاسیون ژن‌ها: تخصیص عملکرد به ژن‌ها
• 13. آنوتاسیون ژن‌ها: استفاده از پایگاه‌های داده آنوتاسیون
• 14. تحلیل پروتئومیک: معرفی و اصول
• 15. تحلیل پروتئومیک: طیف‌سنجی جرمی
• 16. تحلیل پروتئومیک: شناسایی و کمی‌سازی پروتئین‌ها
• 17. تحلیل بیان ژن: آرایه‌های DNA
• 18. تحلیل بیان ژن: RNA-Seq و تحلیل داده‌های آن
• 19. تحلیل بیان ژن: نرمال‌سازی و تحلیل تفاضلی بیان
• 20. تحلیل مسیرهای متابولیکی: معرفی و اهمیت
• 21. تحلیل مسیرهای متابولیکی: پایگاه‌های داده مسیرهای متابولیکی
• 22. تحلیل مسیرهای متابولیکی: آنالیز غنی‌سازی مسیر
• 23. تحلیل تنوع ژنتیکی: SNPها و ایندِل‌ها
• 24. تحلیل تنوع ژنتیکی: مطالعات ارتباط (GWAS)
• 25. تحلیل جمعیت: اصول و روش‌ها
• 26. تحلیل جمعیت: ساختار ژنتیکی جمعیت‌ها
• 27. تحلیل فیلوژنتیکی: ساخت درخت‌های فیلوژنتیکی
• 28. تحلیل فیلوژنتیکی: روش‌های مبتنی بر توالی
• 29. تحلیل فیلوژنتیکی: روش‌های مبتنی بر ژنوتیپ
• 30. یادگیری ماشین در زیست‌اطلاعاتی: معرفی و کاربردها
• 31. یادگیری ماشین: طبقه‌بندی و رگرسیون
• 32. یادگیری ماشین: خوشه‌بندی و کاهش ابعاد
• 33. شبکه‌های زیستی: ساخت و تحلیل
• 34. شبکه‌های تعامل پروتئین-پروتئین
• 35. شبکه‌های تنظیم بیان ژن
• 36. تحلیل داده‌های metagenomics
• 37. تحلیل داده‌های single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)
• 38. تحلیل داده‌های ChIP-Seq
• 39. تحلیل داده‌های ATAC-Seq
• 40. پیش‌پردازش داده‌های ژنومی: حذف نویز و نرمال‌سازی
• 41. تحلیل داده‌های epigenetic
• 42. تحلیل داده‌های transcriptomic
• 43. تحلیل داده‌های metabolomic
• 44. ابزارهای متن‌باز زیست‌اطلاعاتی: معرفی و کاربرد
• 45. زبان‌های برنامه‌نویسی در زیست‌اطلاعاتی: Python و R
• 46. مدیریت داده‌های زیست‌اطلاعاتی: پایگاه‌های داده رابطه‌ای
• 47. مدیریت داده‌های زیست‌اطلاعاتی: پایگاه‌های داده NoSQL
• 48. تحلیل داده‌های بزرگ ژنومی: چالش‌ها و راهکارها
• 49. محاسبات ابری در زیست‌اطلاعاتی
• 50. امنیت داده‌های ژنومی و حریم خصوصی
• 51. تصویرسازی داده‌های ژنومی: اصول و ابزارها
• 52. تحلیل داده‌های CRISPR
• 53. تحلیل داده‌های RNA ویروسی
• 54. تحلیل داده‌های پروتئین‌های ساختاری
• 55. تحلیل داده‌های داده‌های ژنومیک مقایسه‌ای
• 56. تحلیل داده‌های ژنومیک گیاهی
• 57. تحلیل داده‌های ژنومیک حیوانی
• 58. پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 59. تحلیل داده‌های metagenomics میکروبی
• 60. تحلیل داده‌های ژنومیک انسانی
• 61. تحلیل داده‌های ژنومیک باکتریایی
• 62. مدل‌سازی و شبیه‌سازی سیستم‌های زیستی
• 63. تحلیل داده‌های ژنومی در بیماری‌های ژنتیکی
• 64. تحلیل داده‌های ژنومی در سرطان
• 65. تحلیل داده‌های ژنومی در داروشناسی
• 66. Bioinformatics Pipelines: طراحی و اجرا
• 67. تحلیل داده‌های ژنومی در کشاورزی
• 68. تحلیل داده‌های ژنومی در محیط زیست
• 69. تحلیل داده‌های ژنومی در پزشکی قانونی
• 70. تحلیل داده‌های ژنومی در تکامل
• 71. تحلیل داده‌های ژنومی در ایمونولوژی
• 72. تحلیل داده‌های ژنومی در نوروژنومیک
• 73. تحلیل داده‌های ژنومی در بیوشیمی
• 74. تحلیل داده‌های ژنومی در بیوفیزیک