فلش‌کارت‌های آموزشی تضمین کیفیت و کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی تک‌سلولی با پلتفرم BD Rhapsody

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تضمین کیفیت و کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی تک‌سلولی با پلتفرم BD Rhapsody

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و ژنومیک پیشرفته

موضوع میانی: کنترل کیفیت و تضمین کیفیت در توالی‌یابی تک‌سلولی (Single-Cell Sequencing)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی و اهمیت کنترل کیفیت (QA/QC) در آزمایش‌های توالی‌یابی تک‌سلولی (Single-Cell RNA-seq)
• 2. آشنایی با پلتفرم BD Rhapsody، معماری و اجزای کلیدی سیستم در آماده‌سازی نمونه
• 3. اصول نمونه‌برداری، آماده‌سازی سوسپانسیون سلولی و ارزیابی زنده بودن سلول‌ها (Cell Viability)
• 4. بررسی چالش‌های تجمع سلولی (Cell Aggregates) و حذف بقایای سلولی پیش از بارگذاری
• 5. توزیع و بهینه‌سازی سلول‌ها روی میکروول‌های پلتفرم BD Rhapsody
• 6. کنترل کیفیت پیش از توالی‌یابی (Pre-sequencing QC) و ارزیابی کیفیت کتابخانه ژنومی
• 7. آشنایی با بارکدهای سلولی (Cell Barcodes) و مولکولی (UMIs) و نقش آن‌ها در صحت‌سنجی
• 8. کنترل کیفیت داده‌های خام (Raw Sequencing Data QC) با ابزارهای استاندارد بیوانفورماتیکی
• 9. استفاده از نرم‌افزار BD Rhapsody Analysis Pipeline برای پردازش اولیه داده‌ها
• 10. ارزیابی متریک‌های کلیدی عملکرد پلتفرم شامل نرخ بازیابی سلول و اشباع توالی‌یابی
• 11. شناسایی و فیلتر کردن دابلت‌ها (Doublets) و مولتی‌پلت‌ها در داده‌های تک‌سلولی
• 12. بررسی کیفیت نقشه‌برداری (Mapping Quality) خوانش‌ها به ژنوم مرجع
• 13. شناسایی ژن‌های میتوکندریایی و پالایش سلول‌های آسیب‌دیده یا مرده
• 14. تصحیح خطا و پایش عمق توالی‌یابی (Sequencing Depth) برای هر سلول
• 15. نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن تک‌سلولی و حذف اثر دسته‌ای (Batch Effect Correction)
• 16. تحلیل خوشه‌بندی سلولی (Cell Clustering) و ارزیابی کیفیت تفکیک جمعیت‌های سلولی
• 17. کنترل کیفیت در آنالیزهای پایین‌دستی (Downstream Analysis QC) مانند تعیین هویت سلول
• 18. شناسایی نشانگرهای زیستی (Biomarkers) و اعتبارسنچی نتایج حاصل از آنالیز
• 19. مدیریت خطا، عیب‌یابی مشکلات متداول و خطاهای سیستماتیک در سنجش‌های BD Rhapsody
• 20. مستندسازی، استانداردسازی و تهیه گزارش‌های جامع تضمین کیفیت برای آزمایشگاه‌های ژنومیک