فلش‌کارت‌های آموزشی جامع تحلیل داده‌های زیستی با استفاده از بسته‌های Bioconductor برای مطالعات ویروس‌شناسی، گیاه‌شناسی و پزشکی شخصی‌سازی شده

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره جامع تحلیل داده‌های زیستی با استفاده از بسته‌های Bioconductor برای مطالعات ویروس‌شناسی، گیاه‌شناسی و پزشکی شخصی‌سازی شده

موضوع کلی: علوم زیستی و فناوری‌های نوین

موضوع میانی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های ژنتیکی با استفاده از ابزارهای محاسباتی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی و مفاهیم پایه در بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی
• 2. آشنایی با محیط برنامه‌نویسی R و بسته‌های ضروری Bioconductor
• 3. مدیریت داده‌های حجیم زیستی و ساختارهای داده در R
• 4. کار با اشیاء S4 و کلاس‌های داده‌ای در زیست‌شناسی محاسباتی
• 5. پیش‌پردازش و کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی نسل جدید
• 6. روش‌های نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن
• 7. تحلیل افتراقی بیان ژن با استفاده از بسته DESeq2
• 8. تحلیل افتراقی بیان ژن با استفاده از بسته edgeR
• 9. کاربرد بسته‌های بیوانفورماتیکی در مطالعه ژنوم ویروس‌ها
• 10. بررسی تنوع ژنتیکی و تکامل ویروسی با ابزارهای محاسباتی
• 11. آنالیز داده‌های توالی‌یابی RNA در گیاهان برای مطالعات کشاورزی
• 12. شناسایی مسیرهای متابولیک در گیاهان با استفاده از داده‌های ترانسکریپتومیک
• 13. آشنایی با پایگاه‌های داده ژنتیکی معتبر و استخراج داده‌ها
• 14. تفسیر عملکردی ژن‌ها و غنی‌سازی هستی‌شناسی ژن (GO)
• 15. تحلیل شبکه‌های هم‌بیانی ژن در داده‌های زیستی
• 16. کاربرد بیوانفورماتیک در پزشکی شخصی‌سازی شده و تشخیص بیماری‌ها
• 17. شناسایی جهش‌های بیماری‌زا در ژنوم انسان
• 18. تحلیل داده‌های ریزآرایه (Microarray) در مطالعات بالینی
• 19. کاربرد یادگیری ماشین در طبقه‌بندی نمونه‌های زیستی
• 20. تجسم و بصری‌سازی داده‌های پیچیده زیستی با ggplot2
• 21. تحلیل داده‌های تک‌سلولی (Single-cell RNA-seq)
• 22. شناسایی الگوهای اپی‌ژنتیکی در داده‌های توالی‌یابی
• 23. کاربرد ابزارهای محاسباتی در بررسی برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین
• 24. استفاده از Bioconductor در مطالعات متاژنومیک محیطی
• 25. مدیریت و بهینه‌سازی کدهای محاسباتی برای تحلیل‌های بزرگ‌مقیاس
• 26. اخلاق در پژوهش‌های زیستی و حریم خصوصی داده‌های ژنتیکی انسانی
• 27. گزارش‌نویسی علمی و مستندسازی تحلیل‌های بیوانفورماتیکی
• 28. پروژه عملی: تحلیل یکپارچه داده‌های ژنومیک برای شناسایی نشانگرهای زیستی
• 29. اصول امنیت داده‌های زیستی در محیط‌های محاسباتی
• 30. چشم‌انداز کاربرد فناوری‌های نوین در زیست‌شناسی و پزشکی کشور