فلش‌کارت‌های آموزشی حل مسائل زیست‌شناسی محاسباتی با استفاده از زبان برنامه‌نویسی پایتون

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره حل مسائل زیست‌شناسی محاسباتی با استفاده از زبان برنامه‌نویسی پایتون

موضوع کلی: علوم رایانه و فناوری اطلاعات

موضوع میانی: الگوریتم‌ها و برنامه‌نویسی پیشرفته

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر زیست‌شناسی محاسباتی و نقش پایتون
• 2. نصب و راه‌اندازی محیط برنامه‌نویسی برای تحلیل داده‌های زیستی
• 3. آشنایی با ساختار رشته‌های DNA و عملیات پایه در پایتون
• 4. شمارش نوکلئوتیدها در رشته‌های DNA
• 5. تبدیل رشته DNA به RNA
• 6. یافتن رشته مکمل معکوس در توالی‌های ژنتیکی
• 7. محاسبه محتوای GC در توالی‌های DNA
• 8. محاسبه فاصله همینگ و تشخیص جهش‌های نقطه‌ای
• 9. یافتن زیررشته‌های الگو در توالی‌های طولانی
• 10. شناسایی کدهای آغازین و پایان در توالی‌های RNA
• 11. محاسبه احتمال وقوع یک رخداد در مدل‌های ژنتیکی
• 12. ترجمه توالی‌های RNA به پروتئین بر اساس جدول کدون‌ها
• 13. شناسایی موتیف‌های تکرار شونده در توالی DNA
• 14. تحلیل فراوانی کدون‌ها در توالی‌های پروتئینی
• 15. الگوریتم‌های جستجوی زیررشته‌های هم‌پوشان
• 16. محاسبه تراز توالی‌های DNA با استفاده از الگوریتم‌های پایه
• 17. آشنایی با ماتریس‌های امتیازدهی برای تراز توالی
• 18. پیاده‌سازی الگوریتم نیدلمن-وانش برای تراز سراسری
• 19. پیاده‌سازی الگوریتم اسمیت-واترمن برای تراز محلی
• 20. تحلیل توالی‌های پروموتر و شناسایی سایت‌های اتصال
• 21. مدل‌سازی آماری توالی‌های ژنومی با زنجیره‌های مارکوف
• 22. تخمین نرخ جهش در توالی‌های DNA
• 23. بررسی تغییرات تکاملی در توالی‌های پروتئینی
• 24. استفاده از ساختارهای داده‌ای پایتون برای ذخیره توالی‌های حجیم
• 25. کار با فرمت‌های استاندارد فایل‌های بیوانفورماتیکی مانند FASTA
• 26. استخراج ویژگی‌های آماری از داده‌های توالی‌یابی
• 27. الگوریتم‌های خوشه‌بندی برای تحلیل داده‌های بیان ژن
• 28. آشنایی با کتابخانه‌های پایتون برای تحلیل داده‌های زیستی
• 29. بصری‌سازی توالی‌های زیستی با استفاده از ابزارهای نموداری
• 30. حل مسائل بهینه‌سازی در چینش توالی‌ها
• 31. تحلیل ساختار ثانویه پروتئین‌ها با روش‌های محاسباتی
• 32. بررسی ارتباط بین توالی و عملکرد پروتئین
• 33. استفاده از الگوریتم‌های جستجوی حریصانه در مسائل بیوانفورماتیک
• 34. برنامه‌نویسی پویا در حل مسائل تراز توالی
• 35. اعتبارسنجی نتایج محاسباتی با استفاده از پایگاه‌های داده زیستی
• 36. پروژه نهایی: طراحی یک اسکریپت جامع برای تحلیل توالی‌های ژنی