فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل پیشرفتهٔ شبکه‌های تنظیم‌گر ژنی با رویکرد تک‌سلولی (Single-Cell)

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل پیشرفتهٔ شبکه‌های تنظیم‌گر ژنی با رویکرد تک‌سلولی (Single-Cell)

موضوع کلی: زیست‌شناسی مولکولی و مهندسی ژنتیک

موضوع میانی: تنظیم بیان ژن و تحلیل داده‌های تک‌سلولی

📋 سرفصل‌های دوره (100 موضوع)

• 1. مبانی بیولوژی مولکولی و ساختار ژنوم یوکاریوتی
• 2. مفاهیم پایه در تنظیم بیان ژن و عوامل رونویسی
• 3. آشنایی با فناوری‌های توالی‌یابی تک‌سلولی
• 4. اصول آماده‌سازی کتابخانه‌های توالی‌یابی تک‌سلولی
• 5. پیش‌پردازش داده‌های خام توالی‌یابی تک‌سلولی
• 6. کنترل کیفیت و حذف نویز در داده‌های تک‌سلولی
• 7. نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن تک‌سلولی
• 8. کاهش ابعاد و تحلیل مؤلفه‌های اصلی در داده‌های تک‌سلولی
• 9. خوشه‌بندی سلول‌ها و شناسایی انواع سلولی
• 10. تخمین مسیرهای تمایز سلولی با الگوریتم‌های شبه‌زمان
• 11. تحلیل بیان ژن‌های افتراقی در سطوح تک‌سلولی
• 12. مبانی معماری کروماتین و دسترسی‌پذیری ژنوم
• 13. تحلیل داده‌های تک‌سلولی دسترسی‌پذیری کروماتین
• 14. شناسایی نواحی تنظیمی و تقویت‌کننده‌های ژنی
• 15. مدل‌سازی گرامر تنظیمی در توالی‌های غیرکدکننده
• 16. تحلیل موتیف‌های عوامل رونویسی در داده‌های تک‌سلولی
• 17. بررسی برهم‌کنش‌های فیزیکی کروماتین و نقش آن در تنظیم ژن
• 18. یکپارچه‌سازی داده‌های چندگانه (Multi-omics) در سطح تک‌سلولی
• 19. ساخت شبکه‌های تنظیمی ژنی از داده‌های توالی‌یابی
• 20. استنتاج برهم‌کنش‌های عامل رونویسی و ژن هدف
• 21. تحلیل پویایی تنظیم بیان ژن در طول چرخه سلولی
• 22. مدل‌سازی ریاضی در شبکه‌های تنظیمی ژنی
• 23. تحلیل نوسانات بیان ژن و نویز در بیان پروتئین‌ها
• 24. پیش‌بینی پاسخ سلول‌ها به محرک‌های محیطی
• 25. کاربرد یادگیری ماشین در تحلیل شبکه‌های تنظیمی
• 26. شناسایی زیرشبکه‌های تنظیمی در بیماری‌های پیچیده
• 27. بررسی تغییرات اپی‌ژنتیک در تکامل سلولی
• 28. تحلیل ارتباط بین مکانیسم‌های پس‌رونویسی و بیان ژن
• 29. کاربرد تحلیل تک‌سلولی در مطالعات توسعه‌ای
• 30. اصول اخلاق زیستی در پژوهش‌های ژنتیک مولکولی
• 31. چالش‌های محاسباتی در تحلیل داده‌های حجیم ژنومی
• 32. روش‌های اعتبارسنجی تجربی شبکه‌های تنظیمی پیش‌بینی‌شده
• 33. تحلیل هم‌بیانی ژن‌ها و شناسایی ماژول‌های تنظیمی
• 34. بررسی نقش عوامل اپی‌ژنتیک در کنترل بیان ژن
• 35. تکنیک‌های تصویربرداری فضایی و ارتباط آن با داده‌های تک‌سلولی
• 36. یکپارچه‌سازی داده‌های تک‌سلولی با اطلس‌های مرجع بافتی
• 37. تحلیل تغییرات در شبکه تنظیمی طی فرآیندهای ترمیم بافتی
• 38. مدل‌سازی اثر جهش‌ها بر گرامر تنظیمی ژنوم
• 39. کاربردهای مهندسی ژنتیک در اصلاح مسیرهای تنظیمی
• 40. چشم‌انداز آینده فناوری‌های تک‌سلولی در علوم زیستی