فلش‌کارت‌های آموزشی اصول و روش‌های پیشرفته در بازسازی و تحلیل داده‌های ژنومیک (Assembly)

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره اصول و روش‌های پیشرفته در بازسازی و تحلیل داده‌های ژنومیک (Assembly)

موضوع کلی: زیست‌شناسی مولکولی و فناوری‌های نوین زیستی

موضوع میانی: بیوانفورماتیک و آنالیز داده‌های توالی‌یابی ژنوم

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی زیست‌شناسی مولکولی و ساختار داده‌های توالی‌یابی نسل جدید
• 2. آشنایی با فرمت‌های استاندارد فایل‌های داده‌های ژنومیک
• 3. کیفیت‌سنجی و پیش‌پردازش داده‌های خام توالی‌یابی
• 4. الگوریتم‌های پایه در بازسازی ژنوم و تئوری گراف‌ها
• 5. اصول و روش‌های بازسازی ژنوم‌های پروکاریوتی
• 6. استراتژی‌های اسمبل در ژنوم‌های یوکاریوتی پیچیده
• 7. بررسی انواع سکانس‌های تکراری و چالش‌های بازسازی آن‌ها
• 8. کاربرد الگوریتم‌های De Bruijn Graph در بازسازی ژنوم
• 9. روش‌های اسمبل بر مبنای هم‌ترازی با ژنوم مرجع
• 10. تکنیک‌های اسمبل De Novo در غیاب ژنوم مرجع
• 11. مدیریت و تحلیل داده‌های توالی‌یابی با طول خوانش بلند
• 12. تلفیق داده‌های توالی‌یابی کوتاه و بلند برای بهبود کیفیت اسمبل
• 13. شناسایی و حذف آلودگی‌های احتمالی در داده‌های ژنومیک
• 14. مراحل پس از بازسازی و ارزیابی کیفیت اسمبلی
• 15. آنالیز تداوم و پیوستگی ژنوم با شاخص‌های آماری
• 16. تفسیر نمودارهای K-mer و برآورد اندازه ژنوم
• 17. روش‌های شناسایی و رفع شکاف‌های ژنومی
• 18. حاشیه نویسی ساختاری ژنوم‌های بازسازی شده
• 19. اصول و روش‌های پیش‌بینی ژن‌ها در توالی‌های اسمبل شده
• 20. استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک در مدل‌سازی ژنی
• 21. مقایسه ابزارهای اسمبل ژنوم در محیط‌های محاسباتی لینوکس
• 22. مدیریت منابع محاسباتی و حافظه در فرآیندهای سنگین بیوانفورماتیکی
• 23. روش‌های اتوماسیون تحلیل داده‌ها با اسکریپت‌نویسی
• 24. آنالیز ژنومیک مقایسه‌ای پس از بازسازی
• 25. شناسایی واریانت‌های ژنتیکی در داده‌های اسمبل شده
• 26. کاربرد اسمبلی در تحلیل‌های پزشکی دقیق و تشخیصی
• 27. اخلاق در پژوهش‌های ژنومیک و صیانت از داده‌های زیستی
• 28. استانداردهای ملی و بین‌المللی در اشتراک‌گذاری داده‌های ژنومیک
• 29. کاربردهای بیوتکنولوژی کشاورزی در بازسازی ژنوم گیاهان
• 30. نقش بازسازی ژنوم در شناخت پاتوژن‌های نوپدید
• 31. چشم‌انداز آینده فناوری‌های توالی‌یابی و تحلیل داده‌های کلان زیستی