فلش‌کارت‌های آموزشی اصول و روش‌های پیشرفته در تحلیل فیلوژنی و پیش‌بینی عملکرد پروتئین‌ها با استفاده از داده‌های توالی‌یابی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره اصول و روش‌های پیشرفته در تحلیل فیلوژنی و پیش‌بینی عملکرد پروتئین‌ها با استفاده از داده‌های توالی‌یابی

موضوع کلی: زیست‌شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک

موضوع میانی: تحلیل تکاملی و عملکردی توالی‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی زیست‌شناسی محاسباتی و اهمیت تحلیل توالی‌های زیستی
• 2. مفاهیم پایه در بیوانفورماتیک و ذخیره‌سازی داده‌های ژنومیک
• 3. آشنایی با پایگاه‌های داده‌های زیستی معتبر و استانداردهای دسترسی به توالی‌ها
• 4. اصول هم‌ترازی توالی‌ها و الگوریتم‌های مبتنی بر برنامه‌نویسی پویا
• 5. تحلیل هم‌ترازی چندگانه توالی‌ها و کاربرد آن در شناسایی نواحی حفاظت‌شده
• 6. مدل‌های جایگزینی آماری برای تحلیل‌های تکاملی
• 7. بررسی ماتریس‌های جایگزینی اسیدهای آمینه و نوکلئوتیدی
• 8. روش‌های مبتنی بر فاصله در بازسازی درخت‌های فیلوژنتیک
• 9. الگوریتم‌های پارسیمونی حداکثری در استنتاج فیلوژنی
• 10. روش‌های حداکثر درست‌نمایی در تحلیل روابط تکاملی
• 11. استنتاج بیزی در بازسازی درخت‌های تبارشناختی
• 12. ارزیابی قابلیت اطمینان درخت‌های فیلوژنتیک با روش بوت‌استرپ
• 13. تحلیل نرخ تکامل در جایگاه‌های مختلف توالی‌های پروتئینی
• 14. شناسایی انتخاب طبیعی با استفاده از نسبت نرخ‌های جایگزینی
• 15. اصول پیش‌بینی عملکرد پروتئین بر اساس تشابه توالی
• 16. روش‌های مبتنی بر پروفایل و مدل‌های مارکوف پنهان در شناسایی خانواده‌های پروتئینی
• 17. تحلیل دامنه‌های عملکردی و موتیف‌های ساختاری در پروتئین‌ها
• 18. پیش‌بینی ساختار دوم پروتئین‌ها با استفاده از داده‌های تکاملی
• 19. اصول مدل‌سازی همولوژی برای پیش‌بینی ساختار سوم پروتئین‌ها
• 20. ارزیابی دقت مدل‌های ساختاری پروتئین
• 21. پیش‌بینی برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین بر اساس هم‌تکاملی
• 22. تحلیل شبکه‌های عملکردی و جایگاه پروتئین‌ها در سیستم‌های زیستی
• 23. کاربرد تحلیل‌های فیلوژنتیک در مطالعات تنوع زیستی و تکامل مولکولی
• 24. آنالیز داده‌های توالی‌یابی نسل جدید در مقیاس ژنومی
• 25. روش‌های محاسباتی برای شناسایی ژن‌های ارتوگلوگ و پارالوگ
• 26. تفسیر عملکردی ژنوم‌ها و حاشیه‌نویسی توالی‌های ناشناخته
• 27. روش‌های محاسباتی در بررسی تنوع ژنتیکی و فیلودینامیک
• 28. تلفیق داده‌های ساختاری و تکاملی برای پیش‌بینی عملکرد آنزیم‌ها
• 29. کاربردهای بیوانفورماتیک در طراحی دارو و مهندسی پروتئین
• 30. اخلاق در پژوهش‌های زیستی و مدیریت داده‌های ژنومی در چارچوب قوانین ملی
• 31. چالش‌های محاسباتی در تحلیل داده‌های حجیم زیستی
• 32. آینده‌پژوهی در زیست‌شناسی محاسباتی و هوش مصنوعی در تحلیل توالی‌ها