فلش‌کارت‌های آموزشی جامع شناسایی مسیرهای متابولیک و حاشیه‌نویسی کارکردی ژن‌ها در بیوانفورماتیک

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره جامع شناسایی مسیرهای متابولیک و حاشیه‌نویسی کارکردی ژن‌ها در بیوانفورماتیک

موضوع کلی: زیست‌فناوری و علوم محاسباتی (بیوانفورماتیک)

موضوع میانی: تحلیل داده‌های ژنومی و سامانه‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی و مفاهیم پایه در بیوانفورماتیک و ژنومیک محاسباتی
• 2. ساختار و سازماندهی ژنوم در موجودات مدل و انسان
• 3. مروری بر پایگاه‌های داده‌های زیستی و استانداردهای ذخیره‌سازی داده
• 4. آشنایی با فرمت‌های رایج داده‌های توالی‌یابی مانند FASTA و FASTQ
• 5. الگوریتم‌های هم‌ترازی توالی و جستجوی شباهت‌ها
• 6. اصول کار با ابزار BLAST و تنظیمات تخصصی آن
• 7. مبانی حاشیه‌نویسی ساختاری ژن‌ها و شناسایی نواحی کدکننده
• 8. روش‌های پیش‌بینی ژن در پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها
• 9. مفاهیم حاشیه‌نویسی کارکردی و اهمیت آن در درک بیولوژی سیستم‌ها
• 10. معرفی هستی‌شناسی ژن Gene Ontology و کاربرد آن در تحلیل‌ها
• 11. طبقه‌بندی آنزیم‌ها و کدگذاری اختصاصی EC
• 12. آشنایی با پایگاه‌های داده‌های مسیرهای متابولیک نظیر KEGG و MetaCyc
• 13. روش‌های ترسیم و مدل‌سازی مسیرهای متابولیک سلولی
• 14. تحلیل شبکه‌های واکنش‌های بیوشیمیایی و گره‌های کلیدی
• 15. آنالیز غنی‌سازی عملکردی و شناسایی مسیرهای پرکاربرد
• 16. روش‌های شناسایی پروتئین‌های عملکردی و دامنه‌های حفاظت‌شده
• 17. کاربرد مدل‌های پنهان مارکوف HMM در شناسایی خانواده‌های پروتئینی
• 18. تحلیل شبکه‌های برهم‌کنش پروتئین-پروتئین و استخراج زیرشبکه‌ها
• 19. مبانی شبیه‌سازی مدل‌های متابولیک در مقیاس ژنوم
• 20. الگوریتم‌های بهینه‌سازی جریان در شبکه‌های متابولیک
• 21. روش تحلیل تعادل شار FBA و کاربردهای آن در زیست‌فناوری
• 22. پیش‌بینی اثرات جهش‌های ژنتیکی بر کارکرد مسیرهای متابولیک
• 23. تلفیق داده‌های ترانسکریپتومیک با مدل‌های متابولیک
• 24. کاربرد یادگیری ماشین در پیش‌بینی کارکرد ژن‌های ناشناخته
• 25. روش‌های آماری برای تحلیل معناداری مسیرهای متابولیک
• 26. ابزارهای بصری‌سازی گراف‌های متابولیک و شبکه‌های زیستی
• 27. شناسایی مسیرهای متابولیک ثانویه و محصولات زیستی ارزشمند
• 28. کاربرد بیوانفورماتیک در مهندسی متابولیک و بهینه‌سازی سویه‌ها
• 29. اعتبارسنجی محاسباتی مسیرهای بیوسنتزی پیشنهاد شده
• 30. روش‌های یکپارچه‌سازی داده‌های چندگانه Omics در تحلیل‌های سیستمی
• 31. مدیریت و پردازش داده‌های حجیم ژنومی در محیط‌های محاسباتی
• 32. اصول اخلاق در پژوهش‌های ژنتیک و بیوانفورماتیک
• 33. گزارش‌نویسی علمی و تفسیر نتایج تحلیل‌های بیوانفورماتیکی
• 34. پروژه عملی شناسایی یک مسیر متابولیک خاص در یک ارگانیسم هدف