فلش‌کارت‌های آموزشی راهنمای کاربردی تحلیل داده‌های اپی‌ژنتیک با استفاده از فناوری scATAC-seq در پژوهش‌های زیست‌پزشکی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره راهنمای کاربردی تحلیل داده‌های اپی‌ژنتیک با استفاده از فناوری scATAC-seq در پژوهش‌های زیست‌پزشکی

موضوع کلی: زیست‌فناوری و علوم محاسباتی (بیوانفورماتیک)

موضوع میانی: تحلیل داده‌های توالی‌یابی تک‌سلولی (Single-cell Sequencing)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی زیست‌شناسی اپی‌ژنتیک و ساختار کروماتین در سلول‌های یوکاریوتی
• 2. آشنایی با فناوری توالی‌یابی تک‌سلولی و جایگاه scATAC-seq در زیست‌شناسی مدرن
• 3. اصول و مکانیسم فناوری توالی‌یابی در دسترس‌پذیری کروماتین
• 4. مراحل آزمایشگاهی آماده‌سازی کتابخانه برای توالی‌یابی تک‌سلولی
• 5. آشنایی با فرمت‌های داده‌ای خروجی در پروژه‌های توالی‌یابی
• 6. مدیریت و کنترل کیفیت داده‌های خام توالی‌یابی
• 7. پیش‌پردازش داده‌های scATAC-seq و حذف نویزهای سیگنالی
• 8. تراز کردن توالی‌ها و نگاشت به ژنوم مرجع انسانی
• 9. اصول شناسایی قطعات و کاهش ابعاد داده‌های تک‌سلولی
• 10. کاهش ابعاد و تصویرسازی داده‌ها با استفاده از الگوریتم‌های استاندارد
• 11. خوشه‌بندی سلول‌ها بر اساس پروفایل در دسترس‌پذیری کروماتین
• 12. شناسایی نواحی تنظیم‌کننده ژنوم در مقیاس تک‌سلولی
• 13. تخمین فعالیت ژن‌ها بر اساس داده‌های در دسترس‌پذیری کروماتین
• 14. تجزیه و تحلیل فراوانی موتیف‌های متصل‌شونده به فاکتورهای رونویسی
• 15. تفسیر بیولوژیک نواحی باز کروماتین در انواع سلول‌های انسانی
• 16. روش‌های ادغام داده‌های چندگانه برای تحلیل‌های مقایسه‌ای
• 17. شناسایی تغییرات اپی‌ژنتیک در فرآیندهای تمایز سلولی
• 18. بررسی ناهمگونی سلولی در بافت‌های سالم و بیمار
• 19. تطبیق داده‌های scATAC-seq با داده‌های بیان ژن تک‌سلولی
• 20. کاربرد تحلیل‌های هم‌ترازی در مطالعه شبکه‌های تنظیمی ژن
• 21. اخلاق در پژوهش‌های ژنتیکی و حفاظت از داده‌های زیستی بیماران
• 22. استانداردهای گزارش‌دهی در پروژه‌های تحلیل داده‌های زیستی
• 23. آشنایی با ابزارهای نرم‌افزاری متن‌باز و کتابخانه‌های تخصصی زیست‌داده‌شناسی
• 24. عیب‌یابی و رفع خطاهای متداول در خط لوله پردازش داده‌ها
• 25. یکپارچه‌سازی نتایج بیوانفورماتیکی با مشاهدات بالینی
• 26. روش‌های تجسم‌سازی پیشرفته برای ارائه نتایج در مقالات علمی
• 27. کاربرد مدل‌های محاسباتی در پیش‌بینی پیامدهای اپی‌ژنتیک
• 28. آشنایی با پایگاه‌های داده معتبر بین‌المللی و ملی در حوزه اپی‌ژنتیک
• 29. تحلیل مسیرهای سیگنال‌دهی مبتنی بر داده‌های کروماتین
• 30. ملاحظات محاسباتی در تحلیل‌های کلان‌داده‌های زیستی
• 31. آینده‌پژوهی در فناوری‌های توالی‌یابی تک‌سلولی و پزشکی دقیق
• 32. جمع‌بندی و تدوین گزارش نهایی پروژه تحلیل داده‌های اپی‌ژنتیک