فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل محاسباتی و مدل‌سازی داده‌های رونوشت‌برداری فضایی (Spatial Transcriptomics) برای مطالعات پزشکی و زیستی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل محاسباتی و مدل‌سازی داده‌های رونوشت‌برداری فضایی (Spatial Transcriptomics) برای مطالعات پزشکی و زیستی

موضوع کلی: زیست‌فناوری و علوم محاسباتی (بیوانفورماتیک)

موضوع میانی: تحلیل داده‌های پیشرفته در زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی و مفاهیم پایه در رونوشت‌برداری فضایی
• 2. مرور تکنولوژی‌های تعیین توالی با حفظ موقعیت مکانی
• 3. آشنایی با فرمت‌های داده‌های زیستی در مقیاس فضایی
• 4. پیش‌پردازش و کنترل کیفیت داده‌های رونوشت‌برداری فضایی
• 5. روش‌های نرمال‌سازی داده‌ها برای حذف اثرات تکنیکال
• 6. تکنیک‌های کاهش ابعاد و خوشه‌بندی داده‌های فضایی
• 7. شناسایی ژن‌های با بیان وابسته به مکان
• 8. تحلیل قطعه‌بندی تصاویر در داده‌های بافت‌شناسی
• 9. تلفیق داده‌های توالی‌یابی تک‌سلولی با داده‌های فضایی
• 10. مدل‌سازی آماری برای استنباط موقعیت سلول‌ها
• 11. الگوریتم‌های جای‌گذاری سلول‌های تک‌سلولی در بافت
• 12. تحلیل برهم‌کنش‌های سلول-سلول در محیط فضایی
• 13. تشخیص دامنه‌های بافتی با استفاده از یادگیری ماشین
• 14. مدل‌سازی تغییرات بیان ژن در امتداد محورهای بافتی
• 15. تحلیل مسیرهای پیام‌رسانی با رویکرد فضایی
• 16. کاربرد یادگیری عمیق در تحلیل تصاویر بافتی
• 17. استفاده از شبکه‌های عصبی گراف برای داده‌های فضایی
• 18. ارزیابی پایداری و تکرارپذیری در تحلیل‌های فضایی
• 19. مدل‌سازی ریاضی تغییرات رونوشت‌ها در مقیاس میکرونی
• 20. تحلیل داده‌های چندموضعی برای بررسی ناهمگونی تومور
• 21. روش‌های مبتنی بر احتمال برای تخمین ترکیب سلولی
• 22. شناسایی جایگاه‌های فعال ژنوم در سطح بافت
• 23. یکپارچه‌سازی داده‌های امیکس در مدل‌های محاسباتی
• 24. مدل‌سازی رشد و تکامل بافت با داده‌های رونوشت‌برداری
• 25. بهینه‌سازی محاسباتی برای پردازش داده‌های بزرگ‌مقیاس
• 26. تفسیر زیستی خوشه‌های فضایی و دامنه‌های بافتی
• 27. تکنیک‌های تصویربرداری و انطباق با نقشه‌های ژنی
• 28. تحلیل حساسیت و عدم قطعیت در مدل‌های آماری
• 29. کاربرد مدل‌سازی فضایی در مطالعات پزشکی دقیق
• 30. چالش‌های محاسباتی در تحلیل‌های بافت‌شناسی دیجیتال
• 31. استانداردهای گزارش‌دهی داده‌های رونوشت‌برداری فضایی
• 32. آینده‌نگری و توسعه روش‌های جدید در بیوانفورماتیک فضایی