فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل کاربردی بیان ژن در تحقیقات پزشکی و کشاورزی با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل کاربردی بیان ژن در تحقیقات پزشکی و کشاورزی با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک

موضوع کلی: علوم زیستی و بیوتکنولوژی

موضوع میانی: ژنتیک مولکولی و زیست‌شناسی سامانه‌ها

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی زیست‌شناسی مولکولی و ساختار اسیدهای نوکلئیک
• 2. سازوکار رونویسی و تنظیم بیان ژن در پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها
• 3. نقش اپی‌ژنتیک در کنترل بیان ژن و تمایز سلولی
• 4. آشنایی با پایگاه‌های داده‌های ژنومی و بیوانفورماتیک
• 5. اصول طراحی و آماده‌سازی نمونه برای تحلیل بیان ژن
• 6. روش‌های استخراج و ارزیابی کیفیت RNA کل
• 7. سنتز cDNA و بهینه‌سازی واکنش‌های رونویسی معکوس
• 8. تکنیک واکنش زنجیره‌ای پلیمراز کمی در لحظه (RT-qPCR)
• 9. طراحی پرایمرهای اختصاصی و بررسی کارایی واکنش
• 10. روش‌های نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن با استفاده از ژن‌های مرجع
• 11. اصول تحلیل داده‌های ریزآرایه (Microarray) در مطالعات زیستی
• 12. مقدمه‌ای بر توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و کاربرد آن در تحلیل بیان ژن
• 13. آماده‌سازی کتابخانه برای توالی‌یابی RNA (RNA-Seq)
• 14. کنترل کیفیت داده‌های خام توالی‌یابی با ابزارهای بیوانفورماتیک
• 15. تراز کردن توالی‌ها (Alignment) به ژنوم مرجع
• 16. شمارش خوانش‌ها و تبدیل داده‌های خام به ماتریس بیان
• 17. تحلیل بیان ژن‌های افتراقی (Differential Gene Expression)
• 18. روش‌های آماری برای شناسایی ژن‌های با بیان تغییریافته
• 19. تجسم داده‌ها با استفاده از نمودارهای آتشفشانی و نقشه‌های حرارتی
• 20. آشنایی با زبان برنامه‌نویسی R و بسته‌های بیوانفورماتیکی مرتبط
• 21. آنالیز هستی‌شناسی ژن (GO) و مسیرهای متابولیکی (KEGG)
• 22. تحلیل شبکه‌های هم‌بیانی ژن‌ها (WGCNA)
• 23. کاربرد تحلیل بیان ژن در شناسایی نشانگرهای زیستی بیماری‌ها
• 24. نقش بیوتکنولوژی در اصلاح نباتات و بهبود عملکرد محصولات کشاورزی
• 25. تحلیل بیان ژن در پاسخ به تنش‌های محیطی در گیاهان
• 26. شناسایی ژن‌های درگیر در مقاومت به آفات و بیماری‌های گیاهی
• 27. مدل‌سازی زیست‌شناسی سامانه‌ها برای درک برهم‌کنش‌های مولکولی
• 28. یکپارچه‌سازی داده‌های ترانسکریپتومیکس با سایر داده‌های اومیکس
• 29. اعتبارسنجی نتایج بیوانفورماتیکی با استفاده از روش‌های آزمایشگاهی
• 30. اخلاق حرفه‌ای در پژوهش‌های ژنتیکی و بیوتکنولوژی
• 31. مدیریت داده‌های حجیم زیستی و زیرساخت‌های محاسباتی در ایران
• 32. ارائه گزارش علمی و تفسیر نتایج تحلیل بیان ژن در مقالات پژوهشی