فلش‌کارت‌های آموزشی آموزش جامع بیوانفورماتیک و تحلیل الگوریتم‌های ژنتیکی با پایتون (بر پایه مسائل علمی Rosalind)

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره آموزش جامع بیوانفورماتیک و تحلیل الگوریتم‌های ژنتیکی با پایتون (بر پایه مسائل علمی Rosalind)

موضوع کلی: علوم زیستی و فناوری اطلاعات (Bioinformatics)

موضوع میانی: تحلیل داده‌های زیستی با استفاده از زبان برنامه‌نویسی پایتون

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی بیوانفورماتیک و اهمیت تحلیل داده‌های زیستی
• 2. آشنایی با محیط برنامه‌نویسی پایتون برای علوم زیستی
• 3. ساختار داده‌ها و رشته‌های متنی در بیوانفورماتیک
• 4. شمارش نوکلئوتیدهای DNA با استفاده از الگوریتم‌های پایتون
• 5. تبدیل رشته‌های DNA به RNA و مفاهیم رونویسی
• 6. محاسبه مکمل معکوس رشته‌های DNA
• 7. الگوریتم‌های شمارش زیررشته‌های پرکاربرد در ژنوم
• 8. تحلیل محتوای GC در توالی‌های DNA
• 9. محاسبه فاصله همینگ و تعیین جهش‌های نقطه‌ای
• 10. یافتن نقوش مشترک در توالی‌های زیستی
• 11. مدل‌سازی رشد جمعیت و توالی‌های فیبوناچی
• 12. محاسبه احتمالات در توالی‌های ژنتیکی
• 13. ترجمه توالی‌های RNA به پروتئین
• 14. یافتن جایگاه‌های آغاز و پایان در توالی‌های کدکننده
• 15. تحلیل توزیع فراوانی کدون‌ها
• 16. الگوریتم‌های جستجوی توالی در پایگاه‌های داده
• 17. آشنایی با فرمت‌های استاندارد ذخیره‌سازی داده‌های زیستی
• 18. مقدمه‌ای بر ترازسازی توالی‌ها
• 19. معرفی الگوریتم‌های برنامه‌نویسی پویا در بیوانفورماتیک
• 20. محاسبه امتیاز ترازسازی محلی و سراسری
• 21. پیاده‌سازی ماتریس‌های جایگزینی پروتئین
• 22. تحلیل ساختار دوم RNA و پیش‌بینی جفت‌شدگی بازها
• 23. الگوریتم‌های خوشه‌بندی برای داده‌های بیان ژن
• 24. آشنایی با کتابخانه‌های پایتون ویژه بیوانفورماتیک
• 25. کار با کتابخانه Biopython برای تحلیل توالی‌ها
• 26. استخراج داده از پایگاه‌های اطلاعاتی NCBI
• 27. تجزیه و تحلیل داده‌های میکرایری (Microarray)
• 28. روش‌های آماری در تحلیل داده‌های توالی‌یابی نسل جدید
• 29. کنترل کیفیت داده‌های خام توالی‌یابی
• 30. الگوریتم‌های اسمبلی توالی‌های کوتاه
• 31. شناسایی موتیف‌های تنظیمی در نواحی پیش‌برنده
• 32. مدل‌سازی زنجیره‌های مارکوف در تحلیل توالی‌های زیستی
• 33. کاربرد پنهان مدل‌های مارکوف در شناسایی نواحی ژنی
• 34. تحلیل درخت‌های فیلوژنتیک با استفاده از پایتون
• 35. روش‌های فاصله-محور در بازسازی درخت‌های تبارشناسی
• 36. تحلیل تنوع ژنتیکی در جمعیت‌ها
• 37. کاربرد یادگیری ماشین در طبقه‌بندی پروتئین‌ها
• 38. پیش‌بینی ساختار سوم پروتئین‌ها با ابزارهای محاسباتی
• 39. تحلیل تعاملات پروتئین-پروتئین
• 40. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی ساده
• 41. بهینه‌سازی کدهای پایتون برای پردازش داده‌های حجیم ژنومی
• 42. اخلاق در پژوهش‌های ژنتیکی و حفاظت از داده‌های زیستی
• 43. پروژه نهایی: طراحی یک خط لوله تحلیل داده‌های ژنومی