دوره شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با پایتون همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با پایتون

موضوع کلی: برنامه‌نویسی گرافیک و جلوه‌های بصری

موضوع میانی: شبیه‌سازی مولکولی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر دینامیک مولکولی
• 2. مفاهیم ترمودینامیک آماری
• 3. معادلات پایه دینامیک مولکولی
• 4. نیروهای بین‌مولکولی و پتانسیل‌ها
• 5. الگوریتم‌های انتگرال‌گیری زمانی
• 6. شبیه‌سازی سیستم‌های اتمی
• 7. شبیه‌سازی سیستم‌های مولکولی
• 8. تعریف فضای فازی و توابع توزیع
• 9. روش‌های نمونه‌برداری فاز
• 10. همبستگی زمانی و توابع خودهمبستگی
• 11. محاسبه خواص ترمودینامیکی
• 12. محاسبه انرژی آزاد
• 13. شبیه‌سازی مجموعه‌ی بزرگ کانونی
• 14. شبیه‌سازی مجموعه‌ی ایزوباریک-ایزوترمال
• 15. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی در حجم ثابت و دما ثابت
• 16. روش‌های کنترل دما
• 17. روش‌های کنترل فشار
• 18. شبیه‌سازی سیستم‌های پیچیده
• 19. مدل‌سازی پلیمرها
• 20. شبیه‌سازی پروتئین‌ها
• 21. شبیه‌سازی مایعات
• 22. شبیه‌سازی جامدات
• 23. شبیه‌سازی سطوح و رابط‌ها
• 24. روش‌های شتاب‌دهی شبیه‌سازی
• 25. روش‌های موازی‌سازی شبیه‌سازی
• 26. استفاده از کتابخانه‌های پایتون برای دینامیک مولکولی
• 27. کتابخانه MDAnalysis
• 28. کتابخانه Open Babel
• 29. کتابخانه NumPy برای محاسبات عددی
• 30. کتابخانه SciPy برای بهینه‌سازی
• 31. کتابخانه Matplotlib برای تجسم داده‌ها
• 32. تجزیه و تحلیل مسیرهای شبیه‌سازی
• 33. محاسبه خواص انتقال
• 34. محاسبه ضرایب انتشار
• 35. شبیه‌سازی پاسخ خطی
• 36. نظریه پاسخ خطی
• 37. محاسبه طیف‌های فرکانسی
• 38. مدل‌سازی دینامیکی سیستم‌های بزرگ
• 39. روش‌های کاهش ابعاد
• 40. تحلیل مؤلفه‌های اصلی
• 41. یادگیری ماشین در دینامیک مولکولی
• 42. پیش‌بینی رفتار مولکول‌ها با استفاده از یادگیری ماشین
• 43. کاربردهای دینامیک مولکولی در شیمی
• 44. کاربردهای دینامیک مولکولی در فیزیک
• 45. کاربردهای دینامیک مولکولی در زیست‌شناسی