دوره برنامه‌نویسی پایتون برای بیوانفورماتیک همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره برنامه‌نویسی پایتون برای بیوانفورماتیک

موضوع کلی: ژنومیک و انقلاب زیستی دیجیتال

موضوع میانی: بیوانفورماتیک (Bioinformatics)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر پایتون و بیوانفورماتیک
• 2. نصب و راه‌اندازی محیط برنامه‌نویسی پایتون
• 3. انواع داده‌ها و متغیرها در پایتون
• 4. عملگرهای ریاضی و منطقی در پایتون
• 5. ساختارهای کنترلی: شرط‌ها و حلقه‌ها
• 6. توابع در پایتون و کاربرد آن‌ها در بیوانفورماتیک
• 7. کار با فایل‌ها در پایتون
• 8. ماژول‌های پایتون و مدیریت پکیج‌ها
• 9. آشنایی با کتابخانه‌های پرکاربرد بیوانفورماتیک
• 10. کتابخانه Biopython: مقدمه و نصب
• 11. خواندن و نوشتن فایل‌های FASTA با Biopython
• 12. پردازش توالی‌های DNA با Biopython
• 13. پردازش توالی‌های RNA با Biopython
• 14. ترجمه توالی‌های DNA به پروتئین با Biopython
• 15. محاسبه ویژگی‌های توالی (GC content، طول و غیره)
• 16. جستجوی توالی در پایگاه داده‌ها (BLAST)
• 17. کار با فایل‌های GenBank با Biopython
• 18. تجزیه و تحلیل فایل‌های GTF/GFF
• 19. نمایش داده‌های بیولوژیکی با Matplotlib
• 20. آشنایی با NumPy و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
• 21. داده‌های آرایه‌ای (Arrays) و محاسبات آماری با NumPy
• 22. کار با داده‌های بزرگ در بیوانفورماتیک
• 23. مقدمه‌ای بر Pandas و تحلیل داده‌های جدولی
• 24. خواندن و پردازش فایل‌های CSV با Pandas
• 25. تجزیه و تحلیل داده‌های بیان ژن با Pandas
• 26. تصویرسازی داده‌های بیان ژن
• 27. آشنایی با کتابخانه SciPy و کاربردهای آن
• 28. بهینه‌سازی کد پایتون برای بیوانفورماتیک
• 29. برنامه‌نویسی شیءگرا در پایتون
• 30. طراحی کلاس‌های بیولوژیکی (ژن، پروتئین و غیره)
• 31. آشنایی با الگوریتم‌های جستجو و مرتب‌سازی
• 32. الگوریتم‌های هم‌ترازی توالی (Sequence Alignment)
• 33. برنامه‌نویسی موازی در پایتون
• 34. کاربرد پایتون در فیلتر کردن داده‌های NGS
• 35. تحلیل داده‌های ChIP-seq
• 36. تحلیل داده‌های RNA-seq
• 37. تحلیل داده‌های metagenomics
• 38. پیش‌پردازش داده‌های ژنومیک
• 39. آشنایی با پایگاه‌های داده ژنومیک
• 40. کار با APIهای پایگاه داده‌های ژنومیک
• 41. توسعه ابزارهای خط فرمان با پایتون
• 42. ساخت پایپ‌لاین‌های بیوانفورماتیک
• 43. استفاده از Docker برای مدیریت محیط‌های بیوانفورماتیک
• 44. تست و اشکال‌زدایی کد پایتون
• 45. مستندسازی کد پایتون