دوره پیش‌بینی پروتئین‌ها: از توالی تا ساختار همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره پیش‌بینی پروتئین‌ها: از توالی تا ساختار

موضوع کلی: یادگیری ماشینی پیشرفته

موضوع میانی: پیش‌بینی رفتار سیستم‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. پیش‌بینی ساختار پروتئین از توالی اسید آمینه
• 2. بانک‌های اطلاعاتی پروتئین و منابع داده
• 3. روش‌های هم‌ترازی توالی
• 4. درخت‌های فیلوژنتیک و روابط تکاملی
• 5. مقدمه‌ای بر ساختار پروتئین
• 6. ساختارهای اولیه، ثانویه و سوم پروتئین‌ها
• 7. پیوندهای شیمیایی در ساختار پروتئین
• 8. ساختار مارپیچ آلفا و ورقه‌ی بتا
• 9. ساختارهای فوق‌العاده پروتئین
• 10. پیش‌بینی ساختار ثانویه با روش‌های آماری
• 11. روش‌های پیش‌بینی ساختار سوم با استفاده از همولوگی
• 12. جستجوی ساختار همولوگ در پایگاه‌های داده PDB
• 13. روش‌های مدل‌سازی همولوگی
• 14. بهینه‌سازی ساختار پیش‌بینی شده
• 15. ارزیابی کیفیت مدل‌های پروتئین
• 16. روش‌های پیش‌بینی ساختار *ab initio*
• 17. الگوریتم‌های جستجوی فضای conformation
• 18. تابع انرژی و بهینه‌سازی ساختار
• 19. روش‌های مونت کارلو و دینامیک مولکولی
• 20. پیش‌بینی ساختار با استفاده از یادگیری ماشین
• 21. شبکه‌های عصبی و پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 22. روش‌های پیش‌بینی ساختار مبتنی بر contact map
• 23. پیش‌بینی ساختار پروتئین‌های غشایی
• 24. مشکلات و چالش‌های پیش‌بینی ساختار
• 25. تاثیر محیط بر ساختار پروتئین
• 26. پیش‌بینی ساختار پروتئین در شرایط مختلف pH
• 27. پیش‌بینی ساختار پروتئین در حضور لیگاندها
• 28. روش‌های docking مولکولی
• 29. تحلیل پایداری ساختار پروتئین
• 30. بررسی تغییرات conformational پروتئین
• 31. بررسی نقش جهش‌های آمینواسیدی بر ساختار پروتئین
• 32. پیش‌بینی ساختار کمپلکس‌های پروتئینی
• 33. مطالعه تعاملات پروتئین-پروتئین
• 34. روش‌های پیش‌بینی ناحیه‌های اتصال پروتئین
• 35. پیش‌بینی تاثیر داروها بر ساختار پروتئین
• 36. طراحی پروتئین‌های جدید با ساختارهای خاص
• 37. مهندسی پروتئین و تغییر ساختار
• 38. استفاده از پیش‌بینی ساختار در کشف دارو
• 39. کاربردهای پیش‌بینی ساختار در بیوانفورماتیک
• 40. نرم‌افزارهای رایج پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 41. آشنایی با پایگاه داده‌های ساختار پروتئین
• 42. روش‌های اعتبارسنجی ساختارهای پیش‌بینی شده
• 43. تفسیر اطلاعات ساختاری پروتئین
• 44. بررسی ساختار پروتئین‌های بیماری‌زا
• 45. پیش‌بینی ساختار پروتئین‌های ویروسی