دوره پیش‌بینی ساختار پروتئین با LLM همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره پیش‌بینی ساختار پروتئین با LLM

موضوع کلی: مدل‌های زبان بزرگ و هوش مصنوعی مکالمه‌ای

موضوع میانی: تحلیل ژنوم و پروتئوم

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی بیوانفورماتیک و ساختار پروتئین
• 2. بانک‌های اطلاعاتی ساختار پروتئین
• 3. فرمت‌های رایج فایل‌های ساختار پروتئین
• 4. آشنایی با مدل‌سازی مولکولی
• 5. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در بیولوژی
• 6. شبکه‌های عصبی مصنوعی و کاربردهای آن‌ها
• 7. پردازش زبان طبیعی و کاربرد در بیوانفورماتیک
• 8. مقدمه‌ای بر مدل‌های زبانی بزرگ (LLM)
• 9. معماری ترانسفورمر و عملکرد آن
• 10. تعبیه کلمات و توکن‌بندی در LLM
• 11. آماده‌سازی داده‌های پروتئین برای LLM
• 12. انتخاب ویژگی‌های مهم در داده‌های پروتئین
• 13. معرفی مدل‌های LLM پیش‌آموزش شده
• 14. تنظیم دقیق LLM برای پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 15. ارزیابی عملکرد مدل‌های پیش‌بینی ساختار
• 16. متریک‌های ارزیابی کیفیت ساختار پروتئین
• 17. روش‌های اعتبارسنجی ساختار پیش‌بینی شده
• 18. پیش‌بینی ساختار دوم پروتئین با LLM
• 19. پیش‌بینی ساختار سوم پروتئین با LLM
• 20. پیش‌بینی نواحی فعال پروتئین با LLM
• 21. تعیین ساختار پروتئین‌های غشایی با LLM
• 22. پیش‌بینی تعاملات پروتئین-پروتئین با LLM
• 23. استفاده از LLM در طراحی پروتئین
• 24. طراحی پروتئین‌های نو با خواص مطلوب
• 25. بهینه‌سازی ساختار پروتئین برای پایداری
• 26. پیش‌بینی اثرات جهش بر ساختار پروتئین
• 27. تحلیل تغییرات ساختاری پروتئین در بیماری‌ها
• 28. کاربرد LLM در کشف دارو
• 29. شناسایی اهداف دارویی با استفاده از LLM
• 30. طراحی مولکول‌های کوچک با LLM
• 31. پیش‌بینی میل ترکیبی دارو به پروتئین هدف
• 32. ارزیابی پتانسیل دارویی پروتئین‌های پیش‌بینی شده
• 33. مقدمه‌ای بر دینامیک مولکولی
• 34. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با استفاده از LLM
• 35. تحلیل مسیرهای دینامیک مولکولی
• 36. پیش‌بینی رفتار پروتئین در محیط‌های مختلف
• 37. روش‌های کاهش ابعادی داده‌های پروتئین
• 38. تجسم داده‌های ساختار پروتئین
• 39. بهینه‌سازی فرآیند پیش‌بینی با LLM
• 40. استفاده از محاسبات ابری برای پیش‌بینی ساختار
• 41. مقدمه‌ای بر یادگیری تقویتی در بیوانفورماتیک
• 42. کاربرد یادگیری تقویتی در طراحی پروتئین
• 43. چالش‌ها و محدودیت‌های LLM در پیش‌بینی ساختار
• 44. آینده پیش‌بینی ساختار پروتئین با LLM
• 45. اخلاق و مسئولیت‌پذیری در استفاده از LLM