دوره مدل‌سازی مولکولی واریانت‌های ژنتیکی: از تئوری تا کاربرد همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره مدل‌سازی مولکولی واریانت‌های ژنتیکی: از تئوری تا کاربرد

موضوع کلی: علوم زیستی

موضوع میانی: بیوانفورماتیک و مدل‌سازی مولکولی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر واریانت‌های ژنتیکی و اهمیت مدل‌سازی مولکولی
• 2. پایه‌های شیمی و بیوشیمی برای مدل‌سازی مولکولی
• 3. آشنایی با ساختار اسیدهای نوکلئیک و پروتئین‌ها
• 4. مفاهیم ترمودینامیک در مدل‌سازی مولکولی
• 5. روش‌های مدل‌سازی مولکولی: یک نمای کلی
• 6. مدل‌سازی همسان‌سازی (Homology Modeling): اصول و مراحل
• 7. انتخاب الگو (Template Selection) در مدل‌سازی همسان‌سازی
• 8. ساخت مدل اولیه (Initial Model Building)
• 9. بهینه‌سازی هندسه مدل (Geometry Optimization)
• 10. ارزیابی کیفیت مدل‌های پروتئینی
• 11. مدل‌سازی حلقه‌ای (Loop Modeling) و نواحی بدون ساختار
• 12. مدل‌سازی جهش‌ها (Mutations) و واریانت‌های ژنتیکی
• 13. پیش‌بینی اثرات ساختاری و عملکردی واریانت‌ها
• 14. مدل‌سازی دینامیک مولکولی (Molecular Dynamics Simulation): اصول و کاربردها
• 15. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی برای بررسی پایداری ساختار
• 16. بررسی تعاملات پروتئین-پروتئین (Protein-Protein Interactions)
• 17. شبیه‌سازی اتصال لیگاند (Ligand Binding) و طراحی دارو
• 18. روش‌های امتیازدهی (Scoring Functions) در مدل‌سازی مولکولی
• 19. تفسیر نتایج مدل‌سازی مولکولی
• 20. استفاده از نرم‌افزارهای مدل‌سازی مولکولی: PyMOL
• 21. استفاده از نرم‌افزارهای مدل‌سازی مولکولی: Chimera
• 22. استفاده از نرم‌افزارهای مدل‌سازی مولکولی: Rosetta
• 23. استفاده از نرم‌افزارهای مدل‌سازی مولکولی: GROMACS
• 24. بررسی دیتابیس‌های ساختاری: PDB و سایر منابع
• 25. اعتبارسنجی مدل‌های مولکولی با داده‌های تجربی
• 26. تحلیل واریانت‌های ژنتیکی مرتبط با بیماری‌ها
• 27. مدل‌سازی بیماری‌های ژنتیکی: فیبروز کیستیک
• 28. مدل‌سازی بیماری‌های ژنتیکی: بیماری آلزایمر
• 29. مدل‌سازی بیماری‌های ژنتیکی: سرطان
• 30. مدل‌سازی واریانت‌های ژنتیکی در داروشناسی
• 31. فارماکوژنومیک و مدل‌سازی مولکولی
• 32. پیش‌بینی اثرات واریانت‌های ژنتیکی بر پاسخ به دارو
• 33. کاربردهای مدل‌سازی مولکولی در تشخیص مولکولی
• 34. تکنیک‌های پیشرفته مدل‌سازی مولکولی: MD با میدان‌های نیرو قطبی‌شونده
• 35. تکنیک‌های پیشرفته مدل‌سازی مولکولی: روش‌های کوانتومی
• 36. تکنیک‌های پیشرفته مدل‌سازی مولکولی: مدل‌سازی ensemble
• 37. مدل‌سازی مولکولی RNA و ساختارهای پیچیده
• 38. چالش‌ها و محدودیت‌های مدل‌سازی مولکولی
• 39. آینده مدل‌سازی مولکولی و واریانت‌های ژنتیکی
• 40. اخلاق در مدل‌سازی مولکولی و استفاده از داده‌های ژنتیکی