دوره آموزش جامع محاسبات با عملکرد بالا (HPC) در تحلیلهای ژنومی و پردازش دادههای زیستی حجیم همراه با فلشکارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری
🎓 دوره آموزشی جامع
📚 اطلاعات دوره
عنوان دوره: دوره آموزش جامع محاسبات با عملکرد بالا (HPC) در تحلیلهای ژنومی و پردازش دادههای زیستی حجیم
موضوع کلی: بیوانفورماتیک و محاسبات با عملکرد بالا (HPC)
موضوع میانی: محاسبات با عملکرد بالا برای تحلیلهای ژنومی و بیولوژیکی
📋 سرفصل‌های دوره
- 1. مبانی و ضرورت استفاده از محاسبات با عملکرد بالا (HPC) در علوم ژنومیک و بیوانفورماتیک
- 2. آشنایی با ساختار کلاسترهای کامپیوتری، گره‌ها (Nodes) و سیستم‌عامل‌های توزیع‌شده
- 3. مدیریت صف و زمان‌بندی کارها (Job Schedulers) مانند Slurm در محیط‌های HPC
- 4. معماری دادههای ژنومی حجیم و چالش‌های ذخیره‌سازی و انتقال فایل‌های FASTQ, BAM و VCF
- 5. بهینه‌سازی مصرف حافظه و پردازنده در ابزارهای استاندارد بیوانفورماتیک
- 6. پردازش موازی و توزیع‌شده خطوط لوله (Pipelines) ژنومی با استفاده از ابزار Nextflow و Snakemake
- 7. استفاده از کانتینرها (Docker و Singularity) برای تضمین تکرارپذیری تحلیلهای ژنومی در کلاستر
- 8. تراز کردن (Alignment) سریع خوانش‌های نسل جدید توالی‌یابی (NGS) با ابزارهای موازی
- 9. فیلتر کردن، مرتب‌سازی و ایندکس‌گذاری موازی فایل‌های سام و بام با SAMtools
- 10. فراخوانی واریانت‌ها (Variant Calling) با استفاده از ابزارهای مقیاس‌پذیر مانند GATK در بستر HPC
- 11. آنالیزهای ترانسکریپتومیکس (RNA-Seq) در مقیاس وسیع و پردازش موازی داده‌ها
- 12. تحلیل متاژنومیکس (Metagenomics) و پردازش دادههای میکروبیوم با ابزارهای سنگین محاسباتی
- 13. تحلیل دادههای تک‌سلولی (Single-Cell RNA-Seq) و مدیریت بارگذاری حافظه در کلاستر
- 14. استفاده از شتاب‌دهنده‌های سخت‌افزاری (GPU) در سرعت‌بخشی به الگوریتم‌های تراز و یادگیری ماشین ژنومی
- 15. مدیریت فضای ذخیره‌سازی ابری و محلی (High-Performance File Systems) مانند Lustre
- 16. بررسی گلوگاه‌های عملکردی (Bottlenecks) در شبکه،I/O و پردازنده طی اجرای کارهای ژنومی
- 17. پایش مصرف منابع، بهینه‌سازی اسکریپت‌ها و عیب‌یابی خطاهای رایج در کلاستر
- 18. اتوماسیون اجرای خطوط لوله طولانی ژنومی در بسترهای ابری و کلاسترهای سازمانی
- 19. امنیت دادههای ژنومی، مدیریت دسترسی‌ها و پروتکل‌های حفاظت از حریم خصوصی در HPC
- 20. پروژه جامع: راه‌اندازی، بهینه‌سازی و اجرای یک پایپ‌لاین کامل تحلیل ژنومی سنگین در بستر HPC
محتویات بسته آموزشی
🌐 سامانه آنلاین فلشکارت؛ مرور هدفمند و هوشمند
اکانت ارائه‌شده، دسترسی به نسخه تحت وب سامانه فلشکارت ویژه این دوره را فراهم می‌کند. این سامانه از الگوریتم زمان‌بندی مرور SM-2 استفاده می‌کند و بر اساس ارزیابی شما از میزان یادآوری هر کارت، زمان مرورهای بعدی را تنظیم می‌کند.
به این ترتیب، کارت‌های دشوارتر می‌توانند زودتر مرور شوند و برای تثبیت مطالب در حافظه، برنامه مرور متناسب‌تری داشته باشید.
مدت‌زمان معادل آموزشی بر اساس برآورد این دوره در گواهی درج می‌شود.
گواهی دوزبانه با استعلام آنلاین
پس از تکمیل فعالیت‌های لازم و تأیید درخواست، گواهی پایان دوره به زبان فارسی و انگلیسی صادر می‌شود. گواهی دارای لینک اختصاصی و QR Code برای بررسی و استعلام آنلاین است.
این گواهی صرفاً به‌عنوان گواهی اتمام دوره آموزشی صادر می‌شود و معادل مدرک دانشگاهی، آکادمیک یا مدرک رسمی مورد تأیید نهادهای دولتی نیست. صدور آن منوط به تکمیل شرایط دوره و تأیید نهایی درخواست است.
نظرات
هنوز نظری ثبت نشده است.
وارد شوید تا نظر ثبت کنید.