دوره تحلیل فضایی بیان ژن در چشم‌پزشکی: از اصول تا کاربرد همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل فضایی بیان ژن در چشم‌پزشکی: از اصول تا کاربرد

موضوع کلی: علوم پزشکی

موضوع میانی: بیوانفورماتیک و ژنومیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر Spatial Transcriptomics: مفاهیم و اصول پایه
• 2. تفاوت‌های کلیدی Spatial Transcriptomics با روش‌های سنتی Transcriptomics
• 3. کاربردهای Spatial Transcriptomics در تحقیقات چشم‌پزشکی
• 4. مروری بر تکنیک‌های اصلی Spatial Transcriptomics (Visium, Slide-seq, MERFISH و غیره)
• 5. آماده‌سازی نمونه برای Spatial Transcriptomics در بافت‌های چشم
• 6. پروتکل‌های برش و فیکس کردن بافت چشم برای ST
• 7. روش‌های تصویربرداری در Spatial Transcriptomics: میکروسکوپ‌های نوری و فلورسنت
• 8. نرم‌افزارهای پیش‌پردازش داده‌های Spatial Transcriptomics
• 9. کنترل کیفیت داده‌های Spatial Transcriptomics: شناسایی و حذف نویز
• 10. نرمال‌سازی داده‌های Spatial Transcriptomics
• 11. روش‌های تحلیل داده‌های Spatial Transcriptomics: PCA، t-SNE، UMAP
• 12. شناسایی خوشه‌های سلولی در داده‌های Spatial Transcriptomics
• 13. تحلیل بیان ژن‌های دیفرانسیلی در داده‌های Spatial Transcriptomics
• 14. تحلیل همبستگی ژن در فضاهای مختلف بافت چشم
• 15. بررسی مسیرهای سیگنالینگ فعال در مناطق خاص بافت چشم
• 16. تحلیل تعاملات سلول به سلول در بافت چشم با استفاده از Spatial Transcriptomics
• 17. ادغام داده‌های Spatial Transcriptomics با سایر داده‌های Omics (ژنتیک، پروتئومیک)
• 18. تحلیل فضایی تکامل سلولی در چشم
• 19. تحلیل Spatial Transcriptomics در بیماری‌های شبکیه (مانند دژنراسیون ماکولا)
• 20. تحلیل Spatial Transcriptomics در گلوکوم
• 21. تحلیل Spatial Transcriptomics در بیماری‌های قرنیه
• 22. تحلیل Spatial Transcriptomics در تومورهای چشم
• 23. مطالعه تغییرات فضایی در بیان ژن در پاسخ به درمان‌های چشم‌پزشکی
• 24. تحلیل Spatial Transcriptomics در مدل‌های حیوانی بیماری‌های چشم
• 25. بررسی نقش میکرو-محیط تومور در سرطان چشم با استفاده از Spatial Transcriptomics
• 26. تحلیل Spatial Transcriptomics برای شناسایی بیومارکرها در بیماری‌های چشم
• 27. روش‌های بصری‌سازی داده‌های Spatial Transcriptomics
• 28. ابزارهای آنلاین برای تحلیل و اشتراک‌گذاری داده‌های Spatial Transcriptomics
• 29. چالش‌ها و محدودیت‌های Spatial Transcriptomics در چشم‌پزشکی
• 30. آینده Spatial Transcriptomics در تحقیقات و درمان بیماری‌های چشم
• 31. تحلیل داده‌های Single-cell RNA-seq به عنوان مکمل Spatial Transcriptomics
• 32. تحلیل داده‌های Spatial ATAC-seq و ارتباط آن با Spatial Transcriptomics
• 33. تحلیل داده‌های Spatial Proteomics و ادغام آن با Spatial Transcriptomics
• 34. بهینه‌سازی پروتکل‌های Spatial Transcriptomics برای بافت‌های چشم
• 35. تحلیل داده‌های فضایی برای درک فرآیندهای ترمیم بافت چشم
• 36. استفاده از Spatial Transcriptomics برای مطالعه فرآیندهای التهابی در چشم
• 37. تحلیل فضایی بیان ژن در قرنیه و نقش آن در زخم‌شدن
• 38. بررسی تاثیر عوامل محیطی بر بیان ژن در چشم با استفاده از Spatial Transcriptomics
• 39. تحلیل داده‌های Spatial Transcriptomics در بافت‌های مختلف چشم (قرنیه، عدسی، شبکیه، عصب بینایی)
• 40. تحلیل داده‌های Spatial Transcriptomics برای مطالعه تکوین چشم
• 41. بررسی نقش سلول‌های ایمنی در بیماری‌های چشم با استفاده از Spatial Transcriptomics
• 42. تحلیل فضایی بیان ژن در مدل‌های سلولی چشم
• 43. تحلیل داده‌های Spatial Transcriptomics برای شناسایی اهداف دارویی جدید در بیماری‌های چشم